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Nature子刊丨LncRNA BCAN-AS1通过m6A介导的与SNIP1结合来稳定c-Myc从而促进胰腺癌

人阅读 发布时间:2023-10-11 08:56

胰腺导管腺癌(PDAC)是最恶性的癌症之一,其5年生存率低于10%。许多PDAC患者最初被诊断为晚期,最终因缺乏有效治疗而死于肿瘤进展。因此,为了开发更有效的PDAC诊断和治疗干预措施,阐明PDAC发展和进展的生物学特征和分子机制势在必行。

 

癌蛋白c-Myc是一种参与重要细胞过程(如增殖、分化、代谢、细胞凋亡、自我更新、蛋白质和核糖体生物发生)的主转录因子,已被报道在各种人类恶性肿瘤中发挥重要作用。c-Myc的基因组扩增和过表达增加了肿瘤细胞表面免疫检查点蛋白的表达。此外,c-Myc还可以指导肿瘤基质和血管生成的重塑,并广泛编程肿瘤进展所必需的免疫抑制基质。c-Myc的异常表达是包括PDAC在内的人类癌症的重要分子标志。体内惰性胰腺上皮内肿瘤(PanIN)上皮细胞中c-Myc的急性激活足以导致多种基质和免疫细胞类型的变化,并驱动向PDAC的转变。据报道,C-Myc扩增是转移性扩散的驱动因素,并且在某些癌症的转移性病变中富集。除了基因本身的突变外,更常见的是c-Myc表达是通过上游致癌途径诱导的,或者由c-Myc蛋白的稳定性控制。然而,直到现在,PDAC中c-Myc上调的潜在机制尚未完全了解。值得注意的是,越来越多的证据表明,降低c-Myc表达可在多种肿瘤模型中引起肿瘤消退,并且靶向c-Myc被认为是许多人类癌症的一种有吸引力的治疗选择。靶向c-Myc通路的疗法将是逆转癌性生长和恢复抗肿瘤免疫反应的关键。然而,直接靶向c-Myc蛋白具有挑战性,并且在技术上不切实际,因为c-Myc本身对正常组织有潜在的毒性,并且缺乏可药性的结合口袋。因此,需要努力确定c-Myc失调所涉及的关键靶标,以探索c-Myc的潜在间接靶点。

 

长链非编码RNAs(lncRNAs)是一类重要的转录本,可以通过各种机制(如信号、诱饵、引导或支架)作为主基因调节因子发挥作用。表观遗传调控机制,如m6A修饰,被发现存在于大多数lncRNAs上,可以影响RNA-蛋白相互作用。越来越多的证据表明,lncRNA-蛋白质相互作用的失调有助于各种癌症特征,例如c-Myc表达异常。然而,确切的机制仍然很少。最近的研究表明,一些lncRNAs可以直接或间接地与c-Myc相互作用。LncRNA PVT1通过阻止c-Myc磷酸化和降解直接或间接地与c-Myc物理相互作用并稳定c-Myc。此外,与c-Myc结合有助于lncRNA EPIC1在调节c-Myc蛋白转录活性方面的功能。其他lncRNAs如PCGEM1、LINC01638、MALAT1和PD-L1-lnc也可以直接与c-Myc蛋白相互作用,并在癌症中发挥相当大的作用。此外,据报道,一些circRNAs还具有与c-Myc相互作用的能力。所有这些研究表明,c-Myc相互作用的RNA可能在调节c-Myc功能中起着至关重要的作用。鉴于lncRNAs因其在癌症治疗中的潜在作用而受到广泛关注,靶向c-Myc相互作用的lncRNAs可能是间接靶向c-Myc用于癌症治疗的理想策略。因此,迫切需要更好地了解c-Myc/lncRNAs在癌症中相互作用的确切机制,以探索癌症治疗中的潜在治疗策略。

 

近日,Cell Death & Differentiation期刊(IF12.4)发表了一篇题为LncRNA BCAN-AS1 stabilizes c-Myc via N6-methyladenosinemediated binding with SNIP1 to promote pancreatic cancer的研究论文。报道了PDAC中一种c-Myc相互作用的致癌lncRNA BCAN-AS1。研究发现SNIP1可以识别并与m6A修饰的BCAN-AS1结合。而BCAN-AS1 作为c-Myc和SNIP1的支架,可加强c-Myc/SNIP1相互作用,进而阻断SKP2介导的c-Myc泛素化。此外,用BCAN-AS1抑制剂治疗小鼠模型可降低小鼠的肿瘤负荷。该研究强调了BCAN-AS1作为PDAC中c-Myc调节的重要介质,并暗示了靶向BCAN-AS1作为PDAC辅助治疗方法的潜力。

 

 

首先,研究人员通过RIP-Seq以鉴定PANC-1细胞中与c-Myc蛋白相互作用的功能性lncRNAs。结果筛选出了包括先前报道的c-myc相互作用的lncRNAs PVT1、EPIC1和MALAT1在内的各种lncRNAs。研究人员选择了前10个显著富集的lncRNAs来验证它们在PDAC细胞系中与c-Myc的结合。其中,适度保守的基因间lncRNA BCAN-AS1在两个PDAC细胞中表现出与c-Myc最高的结合亲和力。因此,本研究将重点集中在BCAN-AS1上。随后的临床样本分析显示,胰腺肿瘤中的BCAN-AS1水平明显高于邻近正常组织,并且III/IV期PDACs中的BCAN-AS1水平要高于I/II期PDACs。此外,Kaplan-Meier分析显示,高BCAN-AS1水平的PDAC患者总生存时间比BCAN-AS1水平低的患者短。这些结果表明了BCAN-AS1在PDAC进展中的致癌作用。

 

Fig1. c-Myc相关的lncRNA BCAN-AS1在PDAC中过表达,并与PDAC患者的临床预后相关

 

接下来,研究人员试图通过改变BCAN-AS1在PDAC细胞系中的表达来研究BCAN-AS1对PDAC细胞表型的影响。结果显示,BCAN-AS1过表达/沉默显著增强/抑制了PDAC细胞的细胞增殖、集落形成、迁移和侵袭能力。在小鼠异种移植模型中观察到了类似的效果。BCAN-AS1过表达显著提高了皮下异种移植物的生长速率,而沉默BCANAS1则表现出相反的效果。原位异种移植模型结果显示,与对照细胞相比,BCAN-AS1过表达的PDAC细胞形成的胰腺肿瘤表现出显著更高的生长速率和更短的存活时间,而BCAN-AS1沉默的PDAC细胞则表现出相反的表型。此外,BCAN-AS1过表达/沉默显著促进/抑制PDAC细胞的肺转移。表明BCAN-AS1作为一种致癌lncRNA刺激PDAC细胞的增殖和侵袭性。

 

Fig2. BCAN-AS1在体外和体内促进PDAC的恶性表型

 

随后,为了揭示BCAN-AS1对PDAC细胞表型影响的分子机制,研究人员进行了RNA-seq、Western blot、RNA pull-down、ChIRP、CLIP等一系列实验。结果表明,Smad核相互作用蛋白1(SNIP1)被表征为一种新的N6-甲基腺苷(m6A)介质,可通过识别BCAN-AS1的m6A修饰与其结合。m6A修饰的BCAN-AS1充当支架,促进与c-Myc和SNIP1一起形成三元复合物,阻断S期激酶相关蛋白2(SKP2)介导的c-Myc泛素化和降解,从而刺激PDAC细胞的增殖和侵袭性,导致PDAC的进展。

 

Fig3. BCAN-AS1调控PDAC发展和进展的作用模型示意图

 

最后,为了进一步确认BCAN-AS1和c-Myc的临床意义,研究人员首先检查了60对PDAC和相邻正常样本中c-Myc和BCAN-AS1的水平。结果显示,PDAC肿瘤具有显著较高的c-Myc蛋白和BCAN-AS1水平。相关性分析显示,PDAC肿瘤和正常组织中BCAN-AS1水平与c-Myc蛋白水平呈显著正相关。接着,研究人员使用BCAN-AS1的体内优化反义寡核苷酸(ASO-BCAN-AS1)在小鼠异种移植和转移模型中进行实验治疗,以评估其治疗效果。结果发现,与ASO对照治疗相比,ASO-BCAN-AS1治疗可显著减少异种移植转移小鼠模型中的肺转移。在小鼠PDX模型中,ASO-BCAN-AS1处理显著降低了PDX生长速率。此外,ASO-BCAN-AS1处理显著降低了BCAN-AS1和c-Myc蛋白的水平。这些结果表明BCAN-AS1可能是靶向治疗PDAC的新选择。

 

Fig4. BCAN-AS1是小鼠PDAC异种移植的治疗靶点

 

总之,本研究将BCAN-AS1确定为PDAC中c-Myc相互作用的致癌lncRNA。BCAN-AS1的m6A修饰桥接了c-Myc/BCAN-AS1/SNIP1三元复合物,以稳定c-Myc蛋白,抑制SKP2介导的泛素化和降解。抑制BCAN-AS1可抑制PDAC细胞在体外和体内的生长和侵袭。这些发现揭示了BCAN-AS1的促肿瘤作用,并为PDAC中c-Myc相互作用的lncRNA提供了新的见解。





 

原文链接:

https://www.nature.com/articles/s41418-023-01225-x







 

本研究使用到的lncRNA BCAN-AS1动物用ASO及其NC、SNIP1动物用siRNA及其NC产品由锐博生物提供!更多关于lncRNA研究的产品或服务,欢迎登陆锐博生物官方网站(www.ribobio.com)进行查询!









 

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