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锐博生物总部位于广州市黄埔区广州开发区,是一家以核酸技术为核心,为基因功能、细胞生物学及药物研究提供产品与技术服务,以一体化核酸药 CDMO 服务为主导,致力于让新一代核酸药从概念走向商业化的国家火炬计划重点高新技术企业,是中国核酸行业的领军企业之一,拥有国家级博士后科研工作站。公司立足于基础生命科学与医学研究,创始人由国家重大人才工程入选者和诺贝尔生理/医学奖获得者领衔,以国际化视野和技术平台实力,提供高品质的寡核酸 Oligo 合成修饰、CRISPR-Cas9、RNAi、非编码 RNA、细胞分析、外泌体提取、DNA 提取、PCR 扩增、qRT-PCR 试剂盒及引物等,提供高内涵细胞成像及筛选、载体构建、动物实验、高通量测序、生信分析、RNA 体外转录、外泌体检测、qPCR 检测等技术服务,提供闻名业界的核酸药 GMP 生产 CDMO 服务。通过跨学科、多平台、上下游贯通的综合技术优势,赢得了国内外客户的信赖和赞誉。公司申请专利71项,其中已授权专利 21 项。“锐博生物RiboBio”是中国高品质核酸产品代名词之一,为国内外超过 5000 家机构提供产品或服务,客户 SCI 文章累计超过 25,000 多篇,合作客户包括诺贝尔奖得主实验室、知名科研机构和全球制药公司,锐博生物是亚洲知名的寡核酸原料药生产企业之一,2016年获得中国药监局颁发的寡核酸原料药生产许可证,现已跻身于全球核酸药 CDMO 的知名企业行列。锐博生物建立了与国际接轨的大规模cGMP生产基地,正在打造国际领先的大规模寡核酸 CMO 基地。锐博生物推动国内外核酸科学与技术的交流与合作,连续多年承办代表行业风向标的中国核酸国际论坛(CNAF)和非编码RNA与表观遗传学研究交流会,获批建立国家级博士后科研工作站,承担多项国家及省市重点科研项目。锐博生物致力于提供国际一流的核酸产品与服务,构建国际一流的合作平台与伙伴关系,培养国际一流的智慧型创新人才,为不断满足未来生命科学与医学研究及转化的需求而贡献力量。公司秉承“以创新求发展,以品质铸未来,以诚信待客户”的发展理念,追求“创新永不停”!
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lncRNA研究进展盘点丨20230817期

人阅读 发布时间:2023-08-21 09:18

01

高密度脂蛋白通过长链非编码RNA HDRACA调控血管生成

 

发表期刊:Signal Transduct Target Ther

影响因子:39.3

发表时间:2023年8月14日

 

正常高密度脂蛋白(nHDL)可以诱导健康个体的血管生成。然而,冠状动脉疾病患者的HDL经历各种改变,变得功能障碍(dHDL),并失去其促进血管生成的能力。本研究鉴定了一个长链非编码RNA HDRACA,其参与HDL对血管生成的调节。研究表明,nHDL结合的S1P通过与S1P受体1(S1P1)相互作用来激活含有WW结构域的E3泛素蛋白连接酶2(WWP2),从而促进泛素化介导的Kruppel样因子5(KLF5)降解,抑制HDRACA的转录,并下调内皮细胞中HDRACA的表达。相比之下,S1P水平低于nHDL的dHDL在降低HDRACA表达方面效果要差得多。HDRACA能够与Ras相互作用蛋白1(RAIN)结合以阻碍RAIN与vigilin之间的相互作用,导致vigilin蛋白与增殖细胞核抗原(PCNA)mRNA之间的结合增加,最终导致PCNA表达降低,并抑制血管生成。人HDRACA在后肢缺血小鼠模型中的表达抑制了血管生成的恢复。综上所述,这些发现表明HDRACA参与HDL对血管生成的调节,nHDL抑制HDRACA的表达诱导血管生成,而dHDL在抑制HDRACA表达方面的效果要差得多,这就解释了dHDL刺激血管生成能力下降的原因。

 

Fig1. HDL-HDRACA调控机制示意图

 



原文链接:

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37574469/







 

02

鉴定MALAT1 lncRNA中与核仁素和核仁磷酸蛋白相互作用的G-四链体结构

 

发表期刊:Nucleic Acids Res

影响因子:14.9

发表时间:2023年8月10日

 

包括MALAT1在内的核保留长链非编码RNAs(lncRNAs)已成为转录、可变剪接和染色质组织等许多分子过程的关键调节因子。本研究报道了位于MALAT1的3'区域中存在三个保守且热力学稳定的RNA G-四链体(rG4s)。使用rG4结构域特异性RNA pull-down,然后进行质谱和RNA免疫沉淀,本研究证明了MALAT1 rG4结构与两种核仁蛋白,核仁素(NCL)和核仁磷酸蛋白(NPM)特异性结合。通过成像,研究人员发现MALAT1 rG4s促进了NCL和NPM向核斑点的定位,而破坏rG4结构的特定G-to-A突变损害了斑点中NCL和NPM的定位。体外生物物理研究证实,NCL的截短体(ΔNCL)与所有三种rG4s紧密结合。总体而言,本研究揭示了MALAT1中新的rG4s,确定了它们被NCL和NPM特异性识别,并表明破坏rG4s可以消除这些蛋白质向核斑点的定位。

 

Fig2. 研究模型示意图



 

原文链接:

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37558241/







 

03

LITTIP/Lgr6/HnRNPK复合物通过Wnt信号调节牙骨质发生

 

发表期刊:Int J Oral Sci

影响因子:14.9

发表时间:2023年8月9日

 

正畸诱导牙根吸收(OIRR)是正畸治疗期间的一个严重并发症。刺激牙骨质修复是治疗OIRR的基本方法。甲状旁腺激素(PTH)可能是OIRR的潜在治疗药物,但其作用仍缺乏直接证据,其潜在机制尚不清楚。本研究旨在探索长链非编码RNAs(lncRNAs)在介导间歇性PTH的合成代谢作用和促进牙骨质修复中的潜在作用,因为鉴定lncRNA与疾病的关联可以为疾病的诊断和治疗提供有价值的见解。本研究发现间歇性PTH通过调节Wnt通路调节永生化小鼠成牙骨质细胞OCCM-30的细胞增殖和矿化。在体内,每天给药PTH足以通过局部抑制Wnt/β-catenin信号来加速根系再生。通过RNA微阵列分析,lncRNA LITTIP(间歇性PTH下LGR6基因间转录本)被鉴定为间歇性PTH下牙骨质发生的关键调节因子。ChIRP和RIP实验显示,LITTIP与富含亮氨酸的重复G蛋白偶联受体6(LGR6)和异质核核糖核蛋白K(HnRNPK)蛋白的mRNA结合。进一步的共转染实验证实,LITTIP在LITTIP/Lgr6/HnRNPK复合物的形成中发挥了结构作用。此外,LITTIP能够通过RNA结合蛋白HnRNPK促进LGR6的表达。总的来说,本研究结果表明,间歇性PTH给药通过抑制Wnt途径加速根系再生。lncRNA LITTIP通过HnRNPK促进的LGR6高表达来激活Wnt/β-catenin信号,被鉴定为负调节牙骨质发生。

 

Fig3. LITTIP通过LITTIP结合蛋白HnRNPK促进LGR6表达的模型图



 

原文链接:

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37558690/







 

04

m5C-甲基化的lncRNA NR_033928通过稳定GLS mRNA来促进谷氨酰胺代谢重编程从而促进胃癌增殖

 

发表期刊:Cell Death & Disease

影响因子:9.0

发表时间:2023年8月15日

 

异常的5-甲基胞嘧啶(m5C)甲基化已被证明与胃癌的发生、进展和预后密切相关。失调的长链非编码RNAs(lncRNAs)参与了癌症的各种生物学过程。然而,迄今为止,m5C甲基化的lncRNAs在胃癌(GC)中的研究很少。本研究发现RNA胞嘧啶-C(5)-甲基转移酶(NSUN2)在GC中上调,高NSUN2表达与预后不良有关。NR_033928被鉴定为GC中NSUN2甲基化和上调的lncRNA。功能上,NR_033928通过与IGF2BP3 / HUR复合物相互作用来上调谷氨酰胺酶(GLS)的表达,以促进GLS mRNA的稳定性。谷氨酰胺代谢物α-KG的增加,通过增强其启动子5-羟甲基胞嘧啶(hm5C)去甲基化来上调NR_033928的表达。总之,本研究结果表明,NSUN2-甲基化的NR_033928促进了GC进展,可能是GC的潜在预后和治疗靶点。

 

Fig4. NR_033928在GC中的功能示意图



 

原文链接:

https://www.nature.com/articles/s41419-023-06049-8







 

05

LncRNA DGCR5编码的多肽RIP通过抑制BMSCs中β-catenin的核定位来加重SONFH


发表期刊:Cell Rep

影响因子:8.8

发表时间:2023年8月12日

 

骨髓间充质干细胞(BMSCs)的分化命运影响类固醇诱导的股骨头骨坏死(SONFH)的进展。本研究发现lncRNA DGCR5编码一种102个氨基酸的多肽RIP(Rac1灭活肽),该多肽促进BMSCs的成脂分化并加剧SONFH的进展。RIP,而不是lncRNA DGCR5,与RAC1的N末端基序结合,并使RAC1/PAK1级联失活,导致β-catenin的Ser675磷酸化降低。最终,β-catenin的核定位减少,BMSCs的分化平衡向脂肪生成谱系倾斜。在大鼠股骨头中,RIP的过表达导致小梁骨紊乱和脂肪细胞积聚,这可以通过过表达RAC1来挽救。这一发现扩大了lncRNA在BMSCs中的调节作用,并表明RIP是一个潜在的治疗靶点。

 

Fig5. 作用模型示意图



 

原文链接:

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37573506/









 

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