01

LINC02159通过ALYREF/YAP1信号促进非小细胞肺癌进展

 

发表期刊：Mol Cancer

影响因子：37.3

发表时间：2023年8月4日

 

肺癌是全球癌症相关死亡的主要原因。长链非编码RNAs（lncRNAs）已成为癌症发展和进展的关键调节因子，并成为癌症诊断和预后的有希望的生物标志物。本研究鉴定了一个新的lncRNA（LINC02159），其在非小细胞肺癌（NSCLC）患者的肿瘤组织和血清中上调。功能实验表明，LINC02159的敲低抑制了NSCLC细胞的增殖、迁移和侵袭，在体外诱导细胞凋亡和细胞周期停滞，在体内则延缓了肿瘤的生长，而LINC02159的过表达则起到相反的作用。通过转录组学分析发现LINC02159与癌症生长和转移相关通路高度相关，YAP1是LINC02159的潜在靶基因。机制上，LINC02159与Aly/REF输出因子（ALYREF）结合，通过m5C修饰增强YAP1信使RNA（mRNA）的稳定性，这导致了YAP1的过表达以及NSCLC细胞中Hippo和β-catenin信号通路的激活。挽救实验表明，LINC01259以YAP1和ALYREF依赖性方式促进NSCLC进展。总之，LINC02159通过调节ALYREF/YAP1信号通路在NSCLC进展中起致癌作用，具有作为NSCLC诊断标志物和治疗靶点的潜力。

 

Fig1. LINC02159在NSCLC进展中的生物学作用模型

 

 

原文链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37537569/

 

02

 

发表期刊：Mol Plant

影响因子：27.5

发表时间：2023年8月7日

 

植物中已经发现了数以万计的长链非编码RNAs，然而，其中很少有对其生物学功能和作用方式的分子机制进行全面研究。本研究表明拟南芥长链非编码RNA DANA2与细胞核中的AP2/ERF转录因子ERF84相互作用，然后改变JMJ29的转录，JMJ29是一种含有Jumonji C结构域的组蛋白H3K9去甲基酶。RNA-seq和遗传分析都表明，DANA2通过JMJ29正向调节干旱胁迫反应。JMJ29的表达可以通过直接相互作用和调节H3K9me2去甲基化来正向调控ERF15和GOLS2的表达。因此，JMJ29的突变抑制ERF15和GOLS2表达，导致耐旱性受损，这与dana2和erf84突变体的干旱敏感表型一致。本研究结果表明，DANA2是干旱响应的正调节因子，并且DANA2与新型转录激活因子ERF84共同调节干旱响应过程中JMJ29的表达。

 

Fig2. DANA2在植物干旱响应中起作用的工作模型

 

原文链接：

https://www.cell.com/molecular-plant/fulltext/S1674-2052(23)00217-4

 

03

 

影响因子：13.6

发表时间：2023年8月4日

 

胶质母细胞瘤（GBM）干细胞样细胞（GSCs）对GBM的肿瘤发生/治疗耐药性至关重要。越来越多的证据支持长链非编码RNAs（lncRNAs）的肿瘤促进功能，但它们在GSCs中的作用仍然知之甚少。通过将CRISPRi筛选与正交多组学方法相结合，本研究鉴定了一个lncRNA DARS1-AS1控制的转录后环路，该环路促进了GBM细胞/ GSCs的恶性特性。DARS1-AS1缺失抑制了GBM细胞/ GSCs的增殖和GSCs的自我更新，延长原位GBM模型的存活期。DARS1-AS1缺失也损害了同源重组（HR）介导的双链断裂（DSB）修复，并增强了GBM细胞/GSCs的放射敏感性。机制上，DARS1-AS1与YBX1相互作用以促进靶mRNA结合和稳定，形成一个混合的转录/转录后前馈环路，上调G1-S过渡关键调节因子（包括E2F1和CCND1）的表达。DARS1-AS1/YBX1还稳定了FOXM1的mRNA，FOXM1是调节GSC自我更新和DSB修复的主转录因子。本研究结果表明，DARS1-AS1/YBX1轴是使GBM对辐射/HR缺陷靶向治疗敏感的潜在治疗靶点。

 

Fig3. DARS1-AS1促进患者来源的GSCs的生长/自我更新和原位肿瘤的形成

 

原文链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37540752/

 

04

递送lncRNA WAC-AS1的小细胞外囊泡通过诱导铁死亡传播加重肾同种异体移植缺血‒再灌注损伤

 

影响因子：12.4

发表时间：2023年8月2日

 

铁死亡是肾移植后肾缺血再灌注损伤（IRI）的主要原因，导致移植物功能延迟和较差的长期预后。铁死亡以波状方式在细胞群中广泛传播，形成“铁死亡波”，导致更大面积的肾小管坏死，从而加重肾同种异体移植物IRI。本研究破译了铁死亡的全新代谢机制，并提出了肾组织微环境中“铁死亡波”的新传播途径，其中肾脏IRI细胞分泌的递送lncRNA WAC-AS1的小细胞外囊泡（IRI-sEVs）通过诱导GFPT1表达和增加己糖胺生物合成途径（HBP）通量，在邻近肾小管上皮细胞群中重编程葡萄糖代谢， 并因此增强O-GlcNAcylation。此外，肾小管上皮细胞中苏氨酸389处的BACH2 O-GlcNAcylation显著抑制其泛素化降解，并促进importin α5介导的核易位。本研究首次提出证据表明，核内BACH2通过与SLC7A11和GPX4的近端启动子结合来抑制其转录，并降低细胞抗过氧化能力，从而促进铁死亡。GW4869对sEV生物发生和分泌的抑制以及IRI-sEV中lncRNA WAC-AS1的敲除均明确减少了“铁死亡波”的传播，并防止肾同种异体移植IRI。IRI-sEVs的功能和机制调控在同种异体肾移植模型和原位肾IRI模型中得到进一步证实。综上所述，本研究结果表明，抑制sEV介导的lncRNA WAC-AS1分泌并靶向HBP代谢诱导的肾小管上皮细胞中的BACH2 O-GlcNAcylation可能是预防肾移植后移植IRI的新策略。

 

Fig4. IRI-sEVs如何介导“铁死亡波”广泛传播的模型示意图

 

原文链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37532764/

 

05

 

影响因子：11.4

发表时间：2023年8月7日

 

长链非编码RNAs（lncRNAs）影响许多细胞类型中基因网络的转录，但它们在肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）中的作用在很大程度上仍然是未知的。本研究发现lncRNA ADPGK-AS1在人工诱导的M2样人巨噬细胞、体外暴露于肺癌细胞的巨噬细胞以及来自人肺癌组织的TAMs中显著上调。ADPGK-AS1部分位于线粒体内，并与线粒体核糖体蛋白MRPL35结合。巨噬细胞中ADPGK-AS1的过表达上调三羧酸循环并促进线粒体分裂，提示表型转向M2样，促肿瘤细胞因子释放谱。ADPGK-AS1的巨噬细胞特异性敲低可诱导代谢和表型转换（通过细胞因子谱和活性氧的产生来判断）到促炎肿瘤抑制M1样状态，在体外肿瘤细胞-巨噬细胞共培养、离体人肿瘤精密切割肺切片以及小鼠体内抑制肺肿瘤生长。因此，在TAMs中沉默ADPGK-AS1可能为肺癌提供一种新的治疗策略。

 

Fig5. 作用模型示意图

 

原文链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37545364/