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miRNA研究进展盘点(20220602)
人阅读 发布时间:2022-06-02 09:26
A plant immune protein enables broad antitumor response by rescuing microRNA deficiency
一种植物免疫蛋白通过挽救microRNA缺乏可实现广谱抗肿瘤反应
发表期刊:Cell
影响因子:41.582
发表时间:2022年5月26日
癌细胞具有不可控细胞周期激活的特点,而microRNA缺乏会驱动肿瘤发生。RNA依赖性RNA聚合酶(RDR)在植物中对小RNA介导的免疫反应至关重要,但在脊椎动物中不存在。本研究发现植物RDR1的异位表达通常可以抑制癌细胞增殖。在许多人类原发性肿瘤中,具有1-nt-shorter 3'末端的异常microRNA亚型被广泛积累。具有核苷酸转移酶活性的RDR1可以识别和通过单核苷酸修饰有问题的不含AGO2的microRNA双链体,以恢复其2nt悬垂结构,最终挽救AGO2加载效率并提高全局miRNA表达,以特异性抑制癌细胞周期。RDR1的广谱抗肿瘤作用可以通过腺相关病毒递送,在体内多个异种移植肿瘤模型中可见。总之,本研究揭示了异常microRNA亚型在肿瘤中的广泛积累,并通过编辑和修复有缺陷的microRNAs开发了植物RDR1介导的抗肿瘤策略。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35623329/
miR-223 Exerts Translational Control of Proatherogenic Genes in Macrophages
miR-223对巨噬细胞中的促进动脉粥样硬化基因进行翻译控制
发表期刊:Circulation Research
影响因子:17.367
发表时间:2022年5月25日
背景:动脉粥样硬化疾病的一个重大负担是由炎症驱动的。最近,microRNAs(miRNAs)已成为驱动和保护动脉粥样硬化的重要因素。miR-223通过靶向胆固醇生物合成途径和NF-kB信号通路调节胆固醇代谢和炎症;然而,尚未研究其在动脉粥样硬化中的作用。我们假设miR-223全面调节巨噬细胞中的核心炎症通路,以响应炎症和导致动脉粥样硬化的刺激,从而限制动脉粥样硬化的进展。
方法和结果:巨噬细胞中miR-223的缺失降低了Abca1基因和蛋白质的表达以及胆固醇外流到apoA1(载脂蛋白A1),并增强了促炎基因的表达。相比之下,miR-223过表达促进了胆固醇外流和巨噬细胞极化趋向抗炎表型。miR-223的这些有益作用依赖于其靶基因,转录因子Sp3。与miR-223在体外的抗动脉粥样硬化作用一致,接受miR223-/-骨髓的小鼠表现出斑块大小、脂质含量和循环炎性细胞因子(即IL-1β)的增加。与对照小鼠相比,骨髓源性细胞中miR-223的缺乏也会导致循环促动脉粥样硬化细胞(总单核细胞和中性粒细胞)的增加。此外,在缺乏miR-223的小鼠骨髓源性细胞中,主动脉弓中miR-223靶基因(Sp3)和促炎标志物(Il-6)的表达增强,而Abca1和抗炎标志物 (Retnla) 的表达降低。在喂食高胆固醇饮食的小鼠和患有不稳定颈动脉粥样硬化的人类中,miR-223的表达增加。为了进一步了解miR-223对体内动脉粥样硬化影响的分子机制,研究人员从接受野生型或miR223-/-骨髓的小鼠中分离巨噬细胞,并分析了巨噬细胞的全局RNA翻译图谱。使用核糖体分析,本研究揭示了在翻译水平上炎症信号和脂质代谢的显著上调,但在转录水平上则不那么显著。在翻译水平上对上调基因的分析揭示了miR-223结合位点的富集,证实了miR-223通过改变其翻译对致动脉粥样硬化巨噬细胞中的靶基因产生显著变化。
结论:本研究表明,miR-223可以通过作为胆固醇外流和炎症通路的RNA翻译的全局调节因子来预防动脉粥样硬化。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35611698/
enrichMiR predicts functionally relevant microRNAs based on target collections
enrichMiR基于靶标集合来预测功能相关的microRNAs
发表期刊:Nucleic Acids Research
影响因子:16.971
发表时间:2022年5月24日
MicroRNAs(miRNAs)是一类小的非编码RNAs,是基因表达的主要转录后调节因子之一。大量的数据集合和预测工具已经收集了这些调节因子假定或确认的靶标。对于发现和验证来说,利用这些集合在给定的转录特征或基因集中进行靶标富集分析以预测相关的miRNAs,通常是很有用的。尽管为此提出了几种方法,但缺乏使用各种方法和集合进行此类分析的灵活且容易使用的界面。enrichMiR(https://ethz-ins.org/enrichMiR/)通过使用户能够基于几个靶标集合执行一系列富集测试来解决这一差距,以根据miRNAs可能参与控制某一给定转录特征或基因集的程度对miRNAs进行排序。此外,enrichMiR结果还可以通过交互式和可发布的图表进行可视化。为了指导选择适当的分析方法,研究人员在一组涉及已知miRNAs扰动的实验中对各种测试进行了基准测试。最后,研究人员在两个用例中展示了enrichMiR的功能。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35609985/
MicroRNAs in drug addiction: Current status and future perspectives
MicroRNAs在药物成瘾中的研究现状与展望
发表期刊:Pharmacology & Therapeutics
影响因子:12.310
发表时间:2022年5月21日
药物成瘾是一种慢性和复发性脑部疾病,其特征是强迫性药物寻求和持续使用药物,尽管有不良后果。成瘾的高流行率和社会负担是无可争辩的;然而,现有的干预措施是不够的。在成瘾动物模型中,在奖赏相关的大脑区域中观察到异常基因表达。基因表达的调节和神经网络的异常适应归因于反复接触成瘾药物后大脑功能的变化。对microRNA(miRNA)作用的新认识为中枢神经系统中的许多生物学和病理过程提供了新的见解。大量研究表明,miRNAs是药物成瘾中转录后基因表达的强调节因子。本文提供了miRNAs的综述,并提供了miRNA异常表达以及miRNA在药物成瘾和神经适应中的调节作用的证据。通过本文作者提供的观点可以得出结论,即miRNAs有潜力成为药物成瘾的新治疗靶点。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35609719/
miR-188-3p targets skeletal endothelium coupling of angiogenesis and osteogenesis during ageing
miR-188-3p靶向衰老过程中血管生成和骨生成的骨骼内皮耦合
发表期刊:Cell Death & Disease
影响因子:8.469
发表时间:2022年5月25日
H型血管是一种特定的骨毛细血管亚型,具有高表达的CD31和endomucin,最近显示可耦合血管生成和骨生成。骨组织中H型血管的数量随着年龄的增长而减少,这种减少的潜在机制尚不清楚。本研究报道了microRNA-188-3p(miR-188-3p)参与这一过程。miRNA-188-3p在骨骼内皮中表达上调,并在衰老过程中负调节H型血管的形成。miR-188缺失的小鼠表现出H型血管与年龄相关的衰退减弱。相比之下,内皮特异性miR-188-3p过表达减少了H型血管的数量,导致骨量减少和骨再生延迟。机制研究发现,miR-188通过直接靶向内皮细胞中的整合素β3来抑制H型血管的形成。本研究结果表明,miR-188-3p是H型血管形成的关键调节因子,可能是预防骨丢失和加速骨再生的潜在治疗靶点。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35610206/
一种植物免疫蛋白通过挽救microRNA缺乏可实现广谱抗肿瘤反应
发表期刊:Cell
影响因子:41.582
发表时间:2022年5月26日
癌细胞具有不可控细胞周期激活的特点,而microRNA缺乏会驱动肿瘤发生。RNA依赖性RNA聚合酶(RDR)在植物中对小RNA介导的免疫反应至关重要,但在脊椎动物中不存在。本研究发现植物RDR1的异位表达通常可以抑制癌细胞增殖。在许多人类原发性肿瘤中,具有1-nt-shorter 3'末端的异常microRNA亚型被广泛积累。具有核苷酸转移酶活性的RDR1可以识别和通过单核苷酸修饰有问题的不含AGO2的microRNA双链体,以恢复其2nt悬垂结构,最终挽救AGO2加载效率并提高全局miRNA表达,以特异性抑制癌细胞周期。RDR1的广谱抗肿瘤作用可以通过腺相关病毒递送,在体内多个异种移植肿瘤模型中可见。总之,本研究揭示了异常microRNA亚型在肿瘤中的广泛积累,并通过编辑和修复有缺陷的microRNAs开发了植物RDR1介导的抗肿瘤策略。
Fig1. 植物免疫蛋白RDR1通过挽救microRNA缺陷实现广泛抗肿瘤反应的模型示意图
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35623329/
miR-223 Exerts Translational Control of Proatherogenic Genes in Macrophages
miR-223对巨噬细胞中的促进动脉粥样硬化基因进行翻译控制
发表期刊:Circulation Research
影响因子:17.367
发表时间:2022年5月25日
背景:动脉粥样硬化疾病的一个重大负担是由炎症驱动的。最近,microRNAs(miRNAs)已成为驱动和保护动脉粥样硬化的重要因素。miR-223通过靶向胆固醇生物合成途径和NF-kB信号通路调节胆固醇代谢和炎症;然而,尚未研究其在动脉粥样硬化中的作用。我们假设miR-223全面调节巨噬细胞中的核心炎症通路,以响应炎症和导致动脉粥样硬化的刺激,从而限制动脉粥样硬化的进展。
方法和结果:巨噬细胞中miR-223的缺失降低了Abca1基因和蛋白质的表达以及胆固醇外流到apoA1(载脂蛋白A1),并增强了促炎基因的表达。相比之下,miR-223过表达促进了胆固醇外流和巨噬细胞极化趋向抗炎表型。miR-223的这些有益作用依赖于其靶基因,转录因子Sp3。与miR-223在体外的抗动脉粥样硬化作用一致,接受miR223-/-骨髓的小鼠表现出斑块大小、脂质含量和循环炎性细胞因子(即IL-1β)的增加。与对照小鼠相比,骨髓源性细胞中miR-223的缺乏也会导致循环促动脉粥样硬化细胞(总单核细胞和中性粒细胞)的增加。此外,在缺乏miR-223的小鼠骨髓源性细胞中,主动脉弓中miR-223靶基因(Sp3)和促炎标志物(Il-6)的表达增强,而Abca1和抗炎标志物 (Retnla) 的表达降低。在喂食高胆固醇饮食的小鼠和患有不稳定颈动脉粥样硬化的人类中,miR-223的表达增加。为了进一步了解miR-223对体内动脉粥样硬化影响的分子机制,研究人员从接受野生型或miR223-/-骨髓的小鼠中分离巨噬细胞,并分析了巨噬细胞的全局RNA翻译图谱。使用核糖体分析,本研究揭示了在翻译水平上炎症信号和脂质代谢的显著上调,但在转录水平上则不那么显著。在翻译水平上对上调基因的分析揭示了miR-223结合位点的富集,证实了miR-223通过改变其翻译对致动脉粥样硬化巨噬细胞中的靶基因产生显著变化。
结论:本研究表明,miR-223可以通过作为胆固醇外流和炎症通路的RNA翻译的全局调节因子来预防动脉粥样硬化。
Fig2. miR-223对巨噬细胞中的促进动脉粥样硬化基因进行翻译控制的模型图
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35611698/
enrichMiR predicts functionally relevant microRNAs based on target collections
enrichMiR基于靶标集合来预测功能相关的microRNAs
发表期刊:Nucleic Acids Research
影响因子:16.971
发表时间:2022年5月24日
MicroRNAs(miRNAs)是一类小的非编码RNAs,是基因表达的主要转录后调节因子之一。大量的数据集合和预测工具已经收集了这些调节因子假定或确认的靶标。对于发现和验证来说,利用这些集合在给定的转录特征或基因集中进行靶标富集分析以预测相关的miRNAs,通常是很有用的。尽管为此提出了几种方法,但缺乏使用各种方法和集合进行此类分析的灵活且容易使用的界面。enrichMiR(https://ethz-ins.org/enrichMiR/)通过使用户能够基于几个靶标集合执行一系列富集测试来解决这一差距,以根据miRNAs可能参与控制某一给定转录特征或基因集的程度对miRNAs进行排序。此外,enrichMiR结果还可以通过交互式和可发布的图表进行可视化。为了指导选择适当的分析方法,研究人员在一组涉及已知miRNAs扰动的实验中对各种测试进行了基准测试。最后,研究人员在两个用例中展示了enrichMiR的功能。
Fig3. enrichMiR操作流程示意图
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35609985/
MicroRNAs in drug addiction: Current status and future perspectives
MicroRNAs在药物成瘾中的研究现状与展望
发表期刊:Pharmacology & Therapeutics
影响因子:12.310
发表时间:2022年5月21日
药物成瘾是一种慢性和复发性脑部疾病,其特征是强迫性药物寻求和持续使用药物,尽管有不良后果。成瘾的高流行率和社会负担是无可争辩的;然而,现有的干预措施是不够的。在成瘾动物模型中,在奖赏相关的大脑区域中观察到异常基因表达。基因表达的调节和神经网络的异常适应归因于反复接触成瘾药物后大脑功能的变化。对microRNA(miRNA)作用的新认识为中枢神经系统中的许多生物学和病理过程提供了新的见解。大量研究表明,miRNAs是药物成瘾中转录后基因表达的强调节因子。本文提供了miRNAs的综述,并提供了miRNA异常表达以及miRNA在药物成瘾和神经适应中的调节作用的证据。通过本文作者提供的观点可以得出结论,即miRNAs有潜力成为药物成瘾的新治疗靶点。
Fig4. miRNA调节药物成瘾中的神经传递
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35609719/
miR-188-3p targets skeletal endothelium coupling of angiogenesis and osteogenesis during ageing
miR-188-3p靶向衰老过程中血管生成和骨生成的骨骼内皮耦合
发表期刊:Cell Death & Disease
影响因子:8.469
发表时间:2022年5月25日
H型血管是一种特定的骨毛细血管亚型,具有高表达的CD31和endomucin,最近显示可耦合血管生成和骨生成。骨组织中H型血管的数量随着年龄的增长而减少,这种减少的潜在机制尚不清楚。本研究报道了microRNA-188-3p(miR-188-3p)参与这一过程。miRNA-188-3p在骨骼内皮中表达上调,并在衰老过程中负调节H型血管的形成。miR-188缺失的小鼠表现出H型血管与年龄相关的衰退减弱。相比之下,内皮特异性miR-188-3p过表达减少了H型血管的数量,导致骨量减少和骨再生延迟。机制研究发现,miR-188通过直接靶向内皮细胞中的整合素β3来抑制H型血管的形成。本研究结果表明,miR-188-3p是H型血管形成的关键调节因子,可能是预防骨丢失和加速骨再生的潜在治疗靶点。
Fig5. miR-188-3p通过靶向ITGβ3抑制血管生成
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35610206/