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Science子刊丨lncRNA PILA促进OA中NF-κB信号通路活化的分子机制
人阅读 发布时间:2022-05-31 09:49
骨关节炎(OA)是最常见的关节炎,其特征是软骨退化、滑膜炎、骨赘形成和软骨下骨重塑。目前,已发现包括机械应力、代谢改变和炎症介质在内的多种因素在OA发病机制中发挥关键作用。这些驱动因素参与OA的发展和进展,并导致OA的几种表型,包括软骨细胞衰老、软骨破坏、软骨细胞代谢失调、软骨下骨变化和关节炎症。炎症性膝关节OA是一种常见的临床症状,伴有大量滑膜炎症、关节肿胀和膝关节疼痛。关节液中的一组分泌性促炎因子介导了导致OA病理生理学的过程。特别是,白细胞介素-1β(IL-1β)和肿瘤坏死因子(TNF)可介导核因子κB(NF-κB)信号通路的激活,并启动软骨细胞外基质(ECM)的降解。开发针对这些致病因素的有效治疗策略可能有助于炎症性OA表型的治疗。
长链非编码RNA(lncRNA)是一类超过200个核苷酸(nt)的RNA转录本,不具有蛋白质编码能力。越来越多的证据表明,lncRNAs具有广泛的生物学功能,其异常表达与多种病理状态有关,包括OA等肌肉骨骼疾病。据报道,MALAT1、HOTAIR、GAS5和H19等几种lncRNAs有助于OA的发病机制,但许多研究已经在滑膜细胞或小鼠细胞系中进行,关于lncRNAs在人类关节软骨细胞(HACs)中的功能研究较少。已在许多炎症性疾病中发现了炎症相关的lncRNAs。其中一些,如lncRNA-CIR(cartilage injury-related)和PACER(p50-associated cyclooxygenase 2-extragenic RNA),有助于ECM降解和OA进展。
蛋白质精氨酸甲基转移酶(PRMT)对精氨酸残基的甲基化是调节蛋白质功能的重要翻译后修饰(PTM)。催化靶蛋白中不对称二甲基精氨酸(ADMA)形成的I型PRMTs(包括PRMT1、PRMT2、PRMT3、CARM1、PRMT6和PRMT8)参与许多细胞过程,包括RNA剪接、信号转导和蛋白质-蛋白质相互作用。先前的研究表明PRMT1共激活NF-κB依赖性基因表达和在炎症反应中的功能。在破骨细胞分化过程中,PRMT1直接与NF-κB的p65亚基相互作用,促进NF-κB的转录活性。然而,也有研究报道PRMT1诱导的p65甲基化可以抑制p65与DNA的结合,从而抑制TNF-NF-κB信号传导。这些结果表明PRMT1在调节NF-κB信号传导中发挥重要作用,但PRMT1调节该通路的机制仍存在争议。
近日,Science Signaling期刊发表了一篇题为The lncRNA PILA promotes NF-κB signaling in osteoarthritis by stimulating the activity of the protein arginine methyltransferase PRMT1的研究论文。报道了一种功能性PRMT1相互作用的lncRNA PILA,其在体内外促进软骨细胞ECM分解代谢和细胞凋亡。并揭示了PILA通过刺激蛋白质精氨酸甲基转移酶PRMT1的活性促进OA中NF-κB信号通路活化的作用机制,为了解NF-κB信号通路在OA中的调控作用提供了新的见解,并为OA提供了一个潜在的新治疗靶点。
为了探索骨关节炎软骨细胞中炎症信号通路的激活状态,研究人员首先分析了GEO(GSE113825)中人膝关节骨关节炎软骨细胞的转录组测序数据。结果发现,与NF-κB信号通路、炎症反应和细胞凋亡(骨关节炎软骨细胞特异性特征)相关的基因集在骨关节炎软骨细胞中显著增加。为了鉴定可能参与这种炎症信号传导的lncRNAs,研究人员对炎症性细胞因子(TNF和IL-1β)刺激的原发性HACs与未刺激的HACs进行了RNA测序(RNA-seq)。结果显示,总共有1041个lncRNAs在发炎的软骨细胞中失调超过两倍,在前50个失调的lncRNAs中,研究人员发现了一个高度增加的lncRNA(超过15倍),称为PILA。随后的qRT-PCR检测结果与测序结果一致。为了探索其与OA的关系,研究人员进行了RNA原位杂交(ISH),以检测OA患者接受全膝关节置换术的软骨损伤和未损伤区域中的PILA,结果显示与未损伤组织相比,损伤软骨中的PILA增加。荧光ISH(FISH)及核质分离检测证实了PILA主要定位于HACs的细胞核。总之,结果表明PILA是一个OA相关的lncRNA,其在炎症软骨细胞和骨关节炎软骨中表达增加。
随后,为了确定PILA是否导致软骨细胞功能障碍,研究人员使用Ribo Smart Silencer(3条siRNAs和3条反义寡核苷酸)和过表达质粒进行了功能缺失性实验和获得性实验。结果显示,沉默TNF处理的HACs中的PILA降低了编码基质降解蛋白酶(如MMP3、MMP13和ADAMTS4)转录本的表达,相应地MMP3、MMP13、ADAMTS4蛋白表达减少。一致地,PILA沉默的软骨细胞中糖胺聚糖(GAG)增加。此外,PILA敲低可抑制TNF诱导的软骨细胞凋亡,并且沉默PILA降低了TNF诱导的p65磷酸化,显著消除了TNF诱导的p65核转位(炎症细胞因子诱导的p65磷酸化和随后p65复合物易位进入细胞核是NF-κB信号激活的标准标志物)。过表达PILA则得到相反的结果。表明高度丰富的PILA促进软骨细胞降解并积极激活NF-κB信号通路。
接下来,研究人员通过一系列实验探索了PILA诱导NF-κB信号通路激活的潜在机制。结果发现,PILA与PRMT1相互作用并促进PRMT1介导的DHX9(DExH-box helicase 9)的精氨酸甲基化,导致编码NF-κB信号上游激活因子TAK1[ 转化生长因子-β(TGF-β)-活化激酶1 ]的基因的转录增强,从而促进NF-κB通路的激活。
最后,为了探索PILA的生理功能,研究人员评估了过表达人类PILA对小鼠软骨退化和OA进展的影响。结果发现,在小鼠关节内注射编码PILA的腺病毒载体会引发自发性软骨损失并加剧创伤后OA。此外,PILA异位过表达增加TAK1丰度,激活NF-κB信号通路,促进关节软骨细胞中PRMT1和DHX9的相互作用。表明PILA在体内可促进NF-κB信号传导和软骨降解,并加重OA。
总之,本研究确定了一个参与OA进展的关键lncRNA PILA。体外和体内功能实验证明了PILA 在软骨细胞ECM降解和炎症凋亡反应中的调节作用。机制上,PILA与PRMT1相互作用并促进PRMT1介导的DHX9的ADMA修饰,导致编码TAK1的基因表达增加,从而促进NF-κB信号传导。本研究结果揭示了OA进展中的功能性炎症相关lncRNA,并将其确定为OA治疗的潜在治疗靶点。
原文链接:
https://www.science.org/doi/full/10.1126/scisignal.abm6265
本研究使用到的lncRNA PILA Smart Silencer及其NC、FISH探针&试剂盒产品均由锐博生物提供!更多miRNA研究产品与服务信息,欢迎登陆锐博生物官网(www.ribobio.com)进行查询或来电咨询!
长链非编码RNA(lncRNA)是一类超过200个核苷酸(nt)的RNA转录本,不具有蛋白质编码能力。越来越多的证据表明,lncRNAs具有广泛的生物学功能,其异常表达与多种病理状态有关,包括OA等肌肉骨骼疾病。据报道,MALAT1、HOTAIR、GAS5和H19等几种lncRNAs有助于OA的发病机制,但许多研究已经在滑膜细胞或小鼠细胞系中进行,关于lncRNAs在人类关节软骨细胞(HACs)中的功能研究较少。已在许多炎症性疾病中发现了炎症相关的lncRNAs。其中一些,如lncRNA-CIR(cartilage injury-related)和PACER(p50-associated cyclooxygenase 2-extragenic RNA),有助于ECM降解和OA进展。
蛋白质精氨酸甲基转移酶(PRMT)对精氨酸残基的甲基化是调节蛋白质功能的重要翻译后修饰(PTM)。催化靶蛋白中不对称二甲基精氨酸(ADMA)形成的I型PRMTs(包括PRMT1、PRMT2、PRMT3、CARM1、PRMT6和PRMT8)参与许多细胞过程,包括RNA剪接、信号转导和蛋白质-蛋白质相互作用。先前的研究表明PRMT1共激活NF-κB依赖性基因表达和在炎症反应中的功能。在破骨细胞分化过程中,PRMT1直接与NF-κB的p65亚基相互作用,促进NF-κB的转录活性。然而,也有研究报道PRMT1诱导的p65甲基化可以抑制p65与DNA的结合,从而抑制TNF-NF-κB信号传导。这些结果表明PRMT1在调节NF-κB信号传导中发挥重要作用,但PRMT1调节该通路的机制仍存在争议。
近日,Science Signaling期刊发表了一篇题为The lncRNA PILA promotes NF-κB signaling in osteoarthritis by stimulating the activity of the protein arginine methyltransferase PRMT1的研究论文。报道了一种功能性PRMT1相互作用的lncRNA PILA,其在体内外促进软骨细胞ECM分解代谢和细胞凋亡。并揭示了PILA通过刺激蛋白质精氨酸甲基转移酶PRMT1的活性促进OA中NF-κB信号通路活化的作用机制,为了解NF-κB信号通路在OA中的调控作用提供了新的见解,并为OA提供了一个潜在的新治疗靶点。
为了探索骨关节炎软骨细胞中炎症信号通路的激活状态,研究人员首先分析了GEO(GSE113825)中人膝关节骨关节炎软骨细胞的转录组测序数据。结果发现,与NF-κB信号通路、炎症反应和细胞凋亡(骨关节炎软骨细胞特异性特征)相关的基因集在骨关节炎软骨细胞中显著增加。为了鉴定可能参与这种炎症信号传导的lncRNAs,研究人员对炎症性细胞因子(TNF和IL-1β)刺激的原发性HACs与未刺激的HACs进行了RNA测序(RNA-seq)。结果显示,总共有1041个lncRNAs在发炎的软骨细胞中失调超过两倍,在前50个失调的lncRNAs中,研究人员发现了一个高度增加的lncRNA(超过15倍),称为PILA。随后的qRT-PCR检测结果与测序结果一致。为了探索其与OA的关系,研究人员进行了RNA原位杂交(ISH),以检测OA患者接受全膝关节置换术的软骨损伤和未损伤区域中的PILA,结果显示与未损伤组织相比,损伤软骨中的PILA增加。荧光ISH(FISH)及核质分离检测证实了PILA主要定位于HACs的细胞核。总之,结果表明PILA是一个OA相关的lncRNA,其在炎症软骨细胞和骨关节炎软骨中表达增加。
Fig1. PILA在炎症软骨细胞和骨关节炎软骨中表达增加
随后,为了确定PILA是否导致软骨细胞功能障碍,研究人员使用Ribo Smart Silencer(3条siRNAs和3条反义寡核苷酸)和过表达质粒进行了功能缺失性实验和获得性实验。结果显示,沉默TNF处理的HACs中的PILA降低了编码基质降解蛋白酶(如MMP3、MMP13和ADAMTS4)转录本的表达,相应地MMP3、MMP13、ADAMTS4蛋白表达减少。一致地,PILA沉默的软骨细胞中糖胺聚糖(GAG)增加。此外,PILA敲低可抑制TNF诱导的软骨细胞凋亡,并且沉默PILA降低了TNF诱导的p65磷酸化,显著消除了TNF诱导的p65核转位(炎症细胞因子诱导的p65磷酸化和随后p65复合物易位进入细胞核是NF-κB信号激活的标准标志物)。过表达PILA则得到相反的结果。表明高度丰富的PILA促进软骨细胞降解并积极激活NF-κB信号通路。
Fig2. PILA通过刺激NF-κB通路促进软骨细胞ECM降解和凋亡
接下来,研究人员通过一系列实验探索了PILA诱导NF-κB信号通路激活的潜在机制。结果发现,PILA与PRMT1相互作用并促进PRMT1介导的DHX9(DExH-box helicase 9)的精氨酸甲基化,导致编码NF-κB信号上游激活因子TAK1[ 转化生长因子-β(TGF-β)-活化激酶1 ]的基因的转录增强,从而促进NF-κB通路的激活。
Fig3. lncRNA PILA在骨关节炎中促进NF-κB信号传导的作用模型
最后,为了探索PILA的生理功能,研究人员评估了过表达人类PILA对小鼠软骨退化和OA进展的影响。结果发现,在小鼠关节内注射编码PILA的腺病毒载体会引发自发性软骨损失并加剧创伤后OA。此外,PILA异位过表达增加TAK1丰度,激活NF-κB信号通路,促进关节软骨细胞中PRMT1和DHX9的相互作用。表明PILA在体内可促进NF-κB信号传导和软骨降解,并加重OA。
Fig4. 人类PILA加重小鼠DMM模型中的骨关节炎进展
总之,本研究确定了一个参与OA进展的关键lncRNA PILA。体外和体内功能实验证明了PILA 在软骨细胞ECM降解和炎症凋亡反应中的调节作用。机制上,PILA与PRMT1相互作用并促进PRMT1介导的DHX9的ADMA修饰,导致编码TAK1的基因表达增加,从而促进NF-κB信号传导。本研究结果揭示了OA进展中的功能性炎症相关lncRNA,并将其确定为OA治疗的潜在治疗靶点。
原文链接:
https://www.science.org/doi/full/10.1126/scisignal.abm6265
本研究使用到的lncRNA PILA Smart Silencer及其NC、FISH探针&试剂盒产品均由锐博生物提供!更多miRNA研究产品与服务信息,欢迎登陆锐博生物官网(www.ribobio.com)进行查询或来电咨询!