Substoichiometric action of long noncoding RNAs
长链非编码RNAs的亚化学计量作用

发表期刊：Nat Cell Biol
影响因子：28.824
发表时间：2022年5月13日

长链非编码RNAs（lncRNAs）的低表达水平和化学计量失衡通常被用作其可能缺乏功能或限制其潜在影响范围的证据。我们对lncRNAs亚化学计量作用理解的研究进展挑战了这些概念，并提出了不丰富的lncRNAs影响细胞功能和基因调控网络的途径。
原文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35562482/


Ezh2 competes with p53 to license lncRNA Neat1 transcription for inflammasome activation
Ezh2与p53竞争使lncRNA Neat1转录以激活炎症小体

发表期刊：Cell Death Differ
影响因子：15.828
发表时间：2022年5月14日

炎症小体有助于各种炎性疾病的发病机制，但控制其激活的表观遗传机制仍然不明确。本研究发现组蛋白甲基转移酶Ezh2介导了巨噬细胞/小胶质细胞中多种类型炎症小体的激活，而不依赖其甲基转移酶活性，从而促进了炎症小体相关的病理。机制上，Ezh2通过其SANT2结构域来维持长链非编码RNA（lncRNA）Neat1启动子区域中H3K27乙酰化的富集，从而促进染色质的可及性并促进p65介导的Neat1（炎症小体组装和激活的关键中介因子）转录。此外，肿瘤抑制蛋白p53与Ezh2竞争Neat1启动子中的相同结合区域，从而拮抗Ezh2诱导的Neat1转录和炎症小体的激活。因此，Ezh2的缺失强烈促进了p53的结合，从而募集去乙酰化酶SIRT1用于Neat1启动子的H3K27去乙酰化，从而抑制Neat1转录和炎症小体的激活。总体而言，本研究证明了一种通过Ezh2/p53竞争模型调节炎症小体激活的表观遗传机制，并强调了Ezh2在维持H3K27乙酰化以支持lncRNA Neat1转录的新功能。
原文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35568718/


The long noncoding RNA Malat1 regulates CD8+ T cell differentiation by mediating epigenetic repression
长链非编码RNA Malat1通过介导表观遗传抑制调节CD8+ T细胞分化

发表期刊：J Exp Med
影响因子：14.307
发表时间：2022年5月20日

在对微生物感染的免疫反应过程中，CD8+ T细胞会产生短暂的效应细胞和记忆细胞，从而提供持续的保护。尽管调节CD8+ T细胞分化的转录程序已被广泛表征，但长链非编码RNAs（lncRNAs）在此过程中的作用仍知之甚少。使用功能性基因敲除筛选，本研究将lncRNA Malat1鉴定为终末效应细胞和终末效应记忆（t-TEM）循环记忆亚群的调节因子。对富含染色质的lncRNAs的评估表明，Malat1与反式lncRNAs聚集在一起，在基因启动子和基因体处表现出RNA相互作用的增加。此外，研究人员观察到Malat1通过与Ezh2的直接相互作用，与许多记忆细胞相关基因的H3K27me3沉积增加有关，从而促进终末效应子和t-TEM细胞分化。本研究结果表明Malat1在调节CD8+ T细胞分化中具有重要的功能作用，并拓宽了CD8+ T细胞生物学中lncRNAs的知识基础。
原文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35593887/


TP53-inducible putative long noncoding RNAs encode functional polypeptides that suppress cell proliferation
TP53诱导的假定长链非编码RNAs编码抑制细胞增殖的功能性多肽

发表期刊：Genome Res
影响因子：9.043
发表时间：2022年5月24日

由长链非编码RNAs（lncRNAs）编码的多肽是一类新型的功能分子。然而，这些隐藏的多肽是否参与TP53通路并发挥重要的生物学作用仍不清楚。本研究发现TP53调节的lncRNAs编码多肽，其中两种在不同的人类细胞系中发挥作用。使用核糖体分析和RNA-seq方法，研究人员在HepG2细胞中系统地鉴定了300多个新的TP53调节的lncRNAs，并进一步证实了其中15个TP53调节的lncRNAs编码多肽。此外，研究人员通过多种质谱测量验证了几种多肽。 10个新型翻译lncRNAs可直接被TP53诱导以响应DNA损伤。值得注意的是，本研究发现TP53诱导肽TP53LC02和TP53LC04，而不是它们的lncRNAs，可以抑制细胞增殖。TP53LC04肽还通过调节细胞周期以响应DNA损伤而具有与细胞增殖相关的功能。本研究表明，TP53诱导的lncRNA编码新的功能性多肽，从而扩大了TP53肿瘤抑制网络的组成部分，并为癌症治疗提供了新的潜在靶点。
原文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35609991/


The lncRNA PILA promotes NF-κB signaling in osteoarthritis by stimulating the activity of the protein arginine methyltransferase PRMT1
lncRNA PILA通过刺激蛋白质精氨酸甲基转移酶PRMT1的活性促进骨关节炎中的NF-κB信号

发表期刊：Science Signaling
影响因子：8.192
发表时间：2022年5月24日

炎症细胞因子诱导的核因子κB（NF-κB）信号的激活在骨关节炎（OA）的发病机制中起着关键作用。本研究将PILA鉴定为一种可以增强NF-κB信号和OA的长链非编码RNA（lncRNA）。PILA的丰度在OA患者受损的软骨中以及在促炎细胞因子肿瘤坏死因子（TNF）刺激的人关节软骨细胞中增加。PILA的敲低抑制了TNF诱导的NF-κB信号、细胞外基质分解代谢和软骨细胞凋亡，而PILA的异位表达促进了NF-κB信号和基质降解。PILA促进PRMT1介导的DExH-box解旋酶9（DHX9）的精氨酸甲基化，导致编码转化生长因子β活化激酶1（TAK1）的基因转录增加，TAK1是NF-κB信号的上游激活因子。此外，关节内注射编码PILA的腺病毒载体会引发自发性软骨损失，并加剧小鼠的创伤后OA。本研究为探索NF-κB信号在OA中的调控提供了新的思路，并鉴定了该疾病的一个潜在治疗靶点。
原文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35609127/