Transcriptional kinetics and molecular functions of long noncoding RNAs
长链非编码RNAs的转录动力学和分子功能

发表期刊：Nature Genetics
影响因子：38.330
发表时间：2022年3月3日

越来越多的长链非编码RNAs（lncRNAs）已被实验证实具有重要的功能，但对它们的转录动力学知之甚少，确定它们的调控作用仍然具有挑战性。本研究使用等位基因敏感的单细胞RNA测序证明了与信使RNAs相比，lncRNAs在两次转录爆发之间的持续时间是信使RNAs的两倍。此外，研究人员观察到lncRNA表达的细胞间变异性增加，这是由于较低频率的爆发产生了更多的RNA分子。利用异步生长细胞的异质性，研究人员鉴定并通过实验验证了具有细胞状态特异性功能的lncRNAs，这些功能涉及细胞周期进程和细胞凋亡。最后，研究人员确定了具有顺式功能的lncRNAs，并发现这些lncRNAs的敲低可以调节附近蛋白质编码基因的转录爆发频率或大小。总之，本研究确定了lncRNAs的不同转录调控，并证明了lncRNAs在调节mRNA转录爆发中的作用。
原文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35241826/

Interaction of lncRNA MIR100HG with hnRNPA2B1 facilitates m 6 A-dependent stabilization of TCF7L2 mRNA and colorectal cancer progression
lncRNA MIR100HG与hnRNPA2B1的相互作用促进TCF7L2 mRNA的m6A依赖性稳定和结直肠癌进展

发表期刊：Mol Cancer
影响因子：27.401
发表时间：2022年3月12日

研究背景：上皮间充质转化（EMT）是一个与转移和耐药性相关的过程，其中非编码RNAs（ncRNAs）发挥着关键作用。之前的研究表明，嵌入ncRNA宿主基因MIR100HG第三个内含子中的miR-100和miR-125b在结直肠癌（CRC）中赋予对西妥昔单抗【一种抗表皮生长因子受体（EGFR）单克隆抗体】的耐药性。然而，MIR100HG转录本本身是否在西妥昔单抗耐药或EMT中发挥作用尚不清楚。

研究结果：MIR100HG的表达与EMT标志物密切相关，是EMT的正向调节因子。MIR100HG在体外和体内均能维持西妥昔单抗耐药并促进CRC细胞的侵袭和转移。hnRNPA2B1被鉴定为MIR100HG的结合分子。机制上讲，MIR100HG通过与hnRNPA2B1相互作用维持了TCF7L2 的mRNA稳定性，TCF7L2是Wnt/β-catenin信号传导的主要转录共激活因子。hnRNPA2B1在MIR100HG存在的情况下识别TCF7L2 mRNA的N6-甲基腺苷（m6A）位点。反过来，TCF7L2激活MIR100HG的转录，形成前馈调节环。MIR100HG/hnRNPA2B1/TCF7L2轴在出现局部或远处转移或与西妥昔单抗耐药相关疾病进展的CRC患者标本中得到增强。

研究结论：MIR100HG和hnRNPA2B1相互作用通过调节TCF7L2 mRNA的稳定性来控制CRC中Wnt信号的转录活性。本研究结果确定MIR100HG是CRC中的一种有效的EMT诱导剂，可能通过激活MIR100HG/hnRNPA2B1/TCF7L2反馈回路导致西妥昔单抗耐药和转移。
原文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35279145/

Long non-coding RNA LINC00680 functions as a ceRNA to promote esophageal squamous cell carcinoma progression through the miR-423-5p/PAK6 axis
长链非编码RNA LINC00680作为ceRNA通过miR-423-5p/PAK6轴促进食管鳞状细胞癌进展

发表期刊：Mol Cancer
影响因子：27.401
发表时间：2022年3月7日

研究背景：食管鳞状细胞癌（ESCC）是世界范围内常见的侵袭性恶性肿瘤，临床预后较差。据报道，越来越多的长链非编码RNAs（lncRNAs）与癌症发展有关。然而，在ESCC中发挥作用的lncRNAs及其潜在的分子机制在很大程度上仍然未知。

研究结果：转录组分析显示，大量lncRNAs在ESCC组织中失调。值得注意的是，LINC00680是高表达的，并且LINC00680的上调与大肿瘤、晚期肿瘤分期和不良预后相关。功能上，LINC00680的敲低在体外抑制了ESCC细胞的增殖、集落形成、迁移和侵袭，并在体内抑制肿瘤生长。机制上，LINC00680被发现作为一种ceRNA，通过充当miR-423-5p海绵来调节ESCC细胞中PAK6（p21活化激酶6）的表达。在PAK6恢复和miR-423-5p抑制后，LINC00680敲低诱导的细胞活力和运动抑制显著逆转。此外，靶向LINC00680的ASO在体外和体内都显著抑制了ESCC。

研究结论：总之，本研究确定了一种ESCC中的致癌lncRNA LINC00680，其通过充当miR-423-5p海绵发挥ceRNA作用，从而促进PAK6表达和随后的ESCC进展。暗示了LINC00680/miR-423-5p/PAK6轴可作为一个有前景的ESCC诊断和预后生物标志物和治疗靶点。
原文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35255921/

Loss of NPPA-AS1 promotes heart regeneration by stabilizing SFPQ-NONO heteromer-induced DNA repair
NPPA-AS1的缺失通过稳定SFPQ-NONO异聚体诱导的DNA修复促进心脏再生

发表期刊：Basic Res Cardiol
影响因子：17.165
发表时间：2022年3月5日

长链非编码RNA（lncRNA）在内源性心脏再生中的作用在很大程度上仍然不清楚。哺乳动物心肌细胞能够在出生后的一段时间内再生。这一事实允许探索关键lncRNAs在调节心脏再生中的作用。通过新生小鼠左心室心尖切除（AR）的心脏再生模型，本研究鉴定了一种名为NPPA-AS1（natriuretic peptide A antisense RNA 1）的lncRNA，其负调控心肌细胞增殖。在新生小鼠中，NPPA-AS1缺失不影响心脏发育，但足以延长AR后的出生后再生窗口。在成年小鼠中，NPPA-AS1缺失可改善心肌梗塞（MI）后的心脏功能并减少梗塞面积，这与心肌细胞增殖的显著改善有关。进一步分析表明，NPPA-AS1与DNA修复相关的分子SFPQ（脯氨酸/谷氨酰胺富含性剪接因子）相互作用。双链DNA断裂修复需要SFPQ和NONO（含非POU域八聚体结合蛋白）的异聚体，但由于SFPQ和NONO的结合位点重叠，NPPA-AS1与SFPQ竞争性结合。NPPA-AS1缺失促进了SFPQ-NONO异聚体的结合，减少了DNA损伤，并激活了心肌细胞细胞周期的重新进入。总之，NPPA-AS1的缺失通过稳定SFPQ-NONO异聚体诱导的DNA修复来促进心肌细胞增殖，并对成年小鼠的MI发挥治疗作用。因此，NPPA-AS1可能是刺激心脏再生治疗MI的新靶点。
原文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35247074/

Cancer-associated fibroblast-induced lncRNA UPK1A-AS1 confers platinum resistance in pancreatic cancer via efficient double-strand break repair
癌症相关成纤维细胞诱导的lncRNA UPK1A-AS1通过有效的双链断裂修复赋予胰腺癌铂类耐药性

发表期刊：Oncogene
影响因子：9.867
发表时间：2022年3月9日

胰腺导管腺癌（PDAC）的肿瘤基质以大量且异质性的癌症相关成纤维细胞（CAFs）为特征，这些成纤维细胞与化疗耐药性密切相关。然而，CAFs在化学抗性中的潜在机制尚不清楚。本研究发现CAFR是来自铂耐药PDAC患者的CAF亚群，其呈现iCAF表型，并且比从铂敏感PDAC患者中分离的CAFS产生更多的IL8。CAFR衍生的IL8促进PDAC中的奥沙利​​铂化疗耐药。基于对CAF-CM孵育的肿瘤细胞进行长链非编码RNA（lncRNA）表达谱分析，本研究发现UPK1A-AS1的表达直接由IL8/NF-kappa B信号诱导，可作为一种促化学抗性的lncRNA，在活性IL8诱导的奥沙利铂耐药中起着关键作用。值得注意的是，阻断UPK1A-AS1表达的激活会增加体内肿瘤细胞对奥沙利铂的敏感性。机制上，UPK1A-AS1加强了Ku70和Ku80之间的相互作用，以促进非同源末端连接（NHEJ），从而增强DNA双链断裂（DSB）修复。临床上，UPK1A-AS1表达与晚期PDAC患者的IL8表达、较差的化疗反应和较短的无进展生存（PFS）时间呈正相关。总的来说，本研究揭示了lncRNA介导的CAF来源的旁分泌IL8依赖性奥沙利铂耐药机制，并强调UPK1A-AS1是一个潜在的治疗靶点。
原文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35264742/