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中科院发现生殖细胞piRNA对mRNA稳定性重要调控功能
人阅读 发布时间:2015-01-29 15:19
piRNA(PIWI-interacting RNA)是在2006年发现的一类新型非编码RNA,大小在24-32nt之间。piRNA特异性地在动物生殖细胞中表达,对于维持生殖系统DNA完整、抑制转座子转录、特殊基因表达、表观遗传调控及生殖细胞发生等生物学过程具有重要作用,近些年已逐渐受到重视。1月13日,Cell research报道了中科院关于piRNA在小鼠睾丸中介导mRNA降解的最新研究结果。
小鼠体内的PIWI蛋白包含MILI、MIWI和MIWI2三个组分。研究者首先构建了一种MIWI剪切活性缺陷的突变小鼠(Miwi-/ADH),利用此突变小鼠mRNA片段的5’-RACE文库,与已有的MIWI相关piRNA文库进行了比较,发现在距离mRNA片段3’端10nt处有强烈的piRNA配对,又通过比较Miwi+/-小鼠中相同位点序列,共鉴定出1878个piRNA:mRNA互作,包含1295个无冗余piRNA和193个mRNA片段,这193个片段作为piRNA结合位点存在于169个特殊蛋白编码基因中,超过70%的结合位点位于基因3’UTR区域内,而1295个piRNA大部分分布于RepeatMasker这类重复序列中,少部分来自于lncRNA或编码基因。在Miwi-/ADH小鼠圆形精细胞中,193个预测的piRNA切割生成mRNA片段强烈减少。这些结果表明MIWI剪切活性在mRNA稳定性调控过程中具有重要作用。
5’-RACE中鉴定出的Psma8和BC026590两个基因的mRNA片段与预测的piRNA文库比对结果,红点代表错配,黄点代表G-U配对
鉴定到的MIWI-piRNA剪切位点序列特征
之后研究者又对正常小鼠提取的圆形精细胞进行了CLIP-Seq实验,之前鉴定到的几乎所有piRNA切割mRNA片段都可以检测到。研究者从193个片段所分布的169个蛋白编码基因中选择了7个进行定量分析。在Miwi-/-小鼠圆形精细胞中,所有7个基因表达都比正常小鼠圆形精细胞要高。研究者进一步从这7个基因中选出3个,使用其3’UTR区域构建了两种荧光素酶报告载体,并在小鼠精母细胞中检测,结果发现,缺陷型报告载体无法结合piRNA,而野生型报告载体则能正常结合piRNA,并进一步引起报告载体mRNA下调,如果敲除MIWI,报告载体与piRNA的结合能力则会被强烈抑制。
以上实验结果可以说明,借助MIWI剪切活性及piRNA的引导,MIWI-piRNA复合物可以对特定的mRNA稳定性进行调控。已鉴定出的169个蛋白编码基因中有14个是小鼠精细胞产生过程中的重要基因,这也表明MIWI-piRNA对于精细胞的产生具有重要的调控作用。
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相关文献:Zhang P, Kang J Y, Gou L T, et al. MIWI and piRNA-mediated cleavage of messenger RNAs in mouse testes[J]. Cell research, 2015.