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miRNA研究进展盘点丨20240204期
人阅读 发布时间:2024-02-07 09:24
01
Tissue-specific profiling of age-dependent miRNAomic changes in Caenorhabditis elegans
秀丽隐杆线虫年龄依赖性miRNAomic变化的组织特异性分析
发表期刊:Nat Commun
影响因子:16.6
发表时间:2024年2月1日
衰老在各种组织中表现出共同而独特的特征,这使得破译组织特异性衰老机制变得至关重要。MiRNAs是衰老过程中必不可少的调节因子,最近被强调为一类细胞间信使。然而,人们对衰老过程中miRNAs的组织特异性转录组变化知之甚少。秀丽隐杆线虫是衰老研究中公认的模式生物。本研究分析了五种分离的蠕虫组织中的年龄依赖性miRNAomic变化。除了跨组织的多样化衰老调节的miRNA表达外,研究人员还在组织中发现了许多没有转录的miRNAs。进一步分析了细胞外囊泡中的miRNAs,发现蠕虫miRNAs以年龄依赖性方式通过这些囊泡进行组织间运输。利用这些数据集,本研究揭示了体壁肌肉来源的mir-1和肠道中DAF-16/FOXO之间的相互作用,表明mir-1是组织间信号传导的信使。综上所述,本研究系统地探索了蠕虫衰老过程中体细胞组织和细胞外囊泡中的miRNAs,为研究miRNAs在衰老过程中的组织自主和非自主功能提供了宝贵的资源。
Fig1. 蠕虫衰老过程中miRNA转录组的组织特异性变化
原文链接:
https://www.nature.com/articles/s41467-024-45249-4
02
Degradative autophagy regulates the homeostasis of miRnas to control cancer development
降解性自噬调节miRNAs的稳态以控制癌症的发展
发表期刊:Autophagy
影响因子:13.3
发表时间:2024年1月31日
巨自噬/自噬在癌症早期阶段起着抗肿瘤机制的作用,但在已建立的肿瘤中则促进肿瘤生长。类似地,miRNAs作为肿瘤抑制因子或癌基因的功能取决于它们的靶基因。自噬和miRNAs之间的这种相互关系是一个充分研究的领域,主要集中在miRNAs如何调节自噬相关基因上。本研究为自噬如何选择性地控制miRNAs提供了创新的见解。例如,MIR224在自噬体中优先降解,导致SMAD4上调,并抑制肝细胞癌(HCC)肿瘤发生。相反,在结直肠癌(CRC)中,自噬通过降解EP300/p300激活FOXO1,并促进MIR449A转录来正向调节MIR449A。总之,本研究结果揭示了自噬在维持两种miRNAs的细胞平衡以减轻致瘤应激方面的作用,并强调了自噬调节的miRNA表达谱可以作为癌症发展的诊断和治疗标志物。
Fig2. 自噬降解机制如何正向(MIR449A)和负向(MIR224)调节miRNAs以维持细胞中miRNA平衡的示意图模型
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38294001/
03
MiR-17-5p-engineered sEVs Encapsulated in GelMA Hydrogel Facilitated Diabetic Wound Healing by Targeting PTEN and p21
MiR-17-5p工程化sEVs通过靶向PTEN和p21促进糖尿病伤口愈合
发表期刊:Adv Sci (Weinh)
影响因子:15.1
发表时间:2024年1月29日
伤口愈合延迟是糖尿病的主要并发症,与细胞功能受损有关。目前的治疗效果不尽如人意。基于先前关于microRNA在小细胞外囊泡(sEVs)中表达的报道,本研究制备了miR-17-5p工程化的sEVs(sEVs17-OE),并将其封装在明胶甲基丙烯酰(GelMA)水凝胶中,用于糖尿病创面治疗。结果表明,SEVs17-OE成功制备,miR-17-5p表达增加16倍。SEVs17-OE可抑制高糖诱导的人脐静脉内皮细胞(HG-HUVECs)的衰老,促进增殖、迁移和管形成。此外,sEVs17-OE还对高糖诱导的人真皮成纤维细胞(HG-HDFs)具有促进作用。机制分析表明,sEVs17-OE显著下调miR-17-5p的靶基因p21和PTEN的表达。因此,p21和PTEN的下游基因和通路被激活。接下来,将sEVs17-OE装载到GelMA水凝胶中,以制备一种新型生物活性伤口敷料,并评估其对糖尿病伤口愈合的影响。Gel-sEVs17-OE通过促进血管生成和胶原蛋白沉积,有效加速伤口愈合。细胞机制可能与局部细胞增殖有关。因此,本研究成功制备了一种通过在GelMA水凝胶中装载sEVs17-OE的新型生物活性伤口敷料,为慢性伤口管理提供了选择。
Fig3. 研究模型示意图
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38286650/
04
Exosomes miRNA-499a-5p targeted CD38 to alleviate anthraquinone induced cardiotoxicity: experimental research
外泌体miRNA-499a-5p靶向CD38减轻蒽醌诱导的心脏毒性:实验性研究
发表期刊:Int J Surg
影响因子:15.3
发表时间:2024年1月26日
背景:本研究的目的是探索装载miRNA-499a-5p的心脏归巢肽(CHP)工程化骨髓间充质干细胞(BMMSc)源性外泌体(B-exo)对阿霉素(DOX)诱导的心脏毒性的影响。
结果:miRNA芯片分析显示,miRNA-499a-5p是DOX诱导的H9c2细胞中差异表达最多的miRNAs之一,与对照组相比,miRNA-499a-5p显著降低。Exo-和B-exo具有碟形的双层膜结构。对B-exo的CHP进行工程处理后,结果显示miRNA-499a-5p的递送显著增加,并显著到达靶器官(心脏)。实验结果表明,C-B-exo-miRNA-499a-5p显著改善心电图,降低心肌酶、血清和心脏细胞因子,改善心脏病理改变,抑制CD38/MAPK/NF-κB信号通路。
结论:本研究中,C-B-exo-miRNA-499a-5p通过CD38/MAPK/NF-κB信号通路显著改善DOX诱导的心脏毒性,为DOX诱导的心脏毒性的治疗提供了新的思路和方法。
Fig4. C-B-miRNA-499a-5p对DOX诱导的H9c2细胞活力和细胞因子的影响
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38277348/
05
Genomic and epigenetic characterization of the arsenic-induced oncogenic microRNA-21
砷诱导的致癌microRNA-21的基因组和表观遗传学表征
发表期刊:Environ Pollut
影响因子:8.9
发表时间:2024年1月29日
作为最早发现的致癌microRNAs之一,microRNA-21(miR-21)的转录调控和功能的确切细节仍未完全确定。miR-21基因位于染色体17q23.2上,位于编码液泡膜蛋白-1(VMP1)基因的3'-UTR。本研究提供了证据表明miR-21拥有自己的基因启动子,可以在VMP1基因的内含子10中找到。ChIP-seq显示,在砷(As3+)诱导的癌症干细胞样细胞(CSCs)和人诱导多能干细胞(hiPSC)中,存在一个广泛的H3K4me3峰跨越了初级miR-21的整个基因体,并且在miR-21基因启动子和转录终止位点附近存在超级增强子簇。在未转化的人支气管上皮细胞(BEAS-2B)中,As3+处理增强了Nrf2与miR-21的宿主基因VMP1和miR-21基因的结合。敲除Nrf2抑制了basal和As3+诱导的miR-21表达。此外,ChIP-seq中As3+增强的Nrf2峰与miR-21基因中富集H3K4me1和H3K27ac的这些超级增强子完全重叠,表明Nrf2可能通过这些超级增强子与其他转录因子协调,以调节miR-21在细胞对As3+的反应中的表达。这些发现证明了miR-21独特的遗传和表观遗传特征,并可能为理解环境As3+暴露与人类癌症相关的新机制提供见解。
Fig5. 砷诱导的miR-21的基因组和表观遗传学特征示意图
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38295932/