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锐博生物总部位于广州市黄埔区广州开发区,是一家以核酸技术为核心,为基因功能、细胞生物学及药物研究提供产品与技术服务,以一体化核酸药 CDMO 服务为主导,致力于让新一代核酸药从概念走向商业化的国家火炬计划重点高新技术企业,是中国核酸行业的领军企业之一,拥有国家级博士后科研工作站。公司立足于基础生命科学与医学研究,创始人由国家重大人才工程入选者和诺贝尔生理/医学奖获得者领衔,以国际化视野和技术平台实力,提供高品质的寡核酸 Oligo 合成修饰、CRISPR-Cas9、RNAi、非编码 RNA、细胞分析、外泌体提取、DNA 提取、PCR 扩增、qRT-PCR 试剂盒及引物等,提供高内涵细胞成像及筛选、载体构建、动物实验、高通量测序、生信分析、RNA 体外转录、外泌体检测、qPCR 检测等技术服务,提供闻名业界的核酸药 GMP 生产 CDMO 服务。通过跨学科、多平台、上下游贯通的综合技术优势,赢得了国内外客户的信赖和赞誉。公司申请专利71项,其中已授权专利 21 项。“锐博生物RiboBio”是中国高品质核酸产品代名词之一,为国内外超过 5000 家机构提供产品或服务,客户 SCI 文章累计超过 25,000 多篇,合作客户包括诺贝尔奖得主实验室、知名科研机构和全球制药公司,锐博生物是亚洲知名的寡核酸原料药生产企业之一,2016年获得中国药监局颁发的寡核酸原料药生产许可证,现已跻身于全球核酸药 CDMO 的知名企业行列。锐博生物建立了与国际接轨的大规模cGMP生产基地,正在打造国际领先的大规模寡核酸 CMO 基地。锐博生物推动国内外核酸科学与技术的交流与合作,连续多年承办代表行业风向标的中国核酸国际论坛(CNAF)和非编码RNA与表观遗传学研究交流会,获批建立国家级博士后科研工作站,承担多项国家及省市重点科研项目。锐博生物致力于提供国际一流的核酸产品与服务,构建国际一流的合作平台与伙伴关系,培养国际一流的智慧型创新人才,为不断满足未来生命科学与医学研究及转化的需求而贡献力量。公司秉承“以创新求发展,以品质铸未来,以诚信待客户”的发展理念,追求“创新永不停”!
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lncRNA研究进展盘点丨20231222期

人阅读 发布时间:2023-12-22 15:42

LncRNA LY6E-DT and its encoded metastatic-related protein play oncogenic roles via different pathways and promote breast cancer progression

LncRNA LY6E-DT及其编码的转移相关蛋白通过不同的途径发挥致癌作用,促进乳腺癌进展

 

发表期刊:Cell Death Differ

影响因子:12.4

发表时间:2023年12月19日

 

长链非编码RNA(lncRNA)异常表达在肿瘤侵袭和转移中起着重要作用。本研究发现lncRNA LY6E-DT(LY6E divergent transcript)水平在乳腺癌(BC)组织中的升高。转录因子SP3直接与LY6E-DT启动子结合,激活其转录。此外,METTL14对LY6E-DT的N6-甲基腺苷修饰依赖于“reader”IGF2BP1依赖性途径来促进LY6E-DT表达。值得注意的是,研究人员发现lncRNA LY6E-DT编码一种保守的153-aa蛋白,即“转移相关蛋白”(MRP)。LY6E-DT和MRP均促进BC的侵袭和转移,MRP表达可鉴别有淋巴结转移的BC患者和无淋巴结转移的BC患者。机制上,MRP结合异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNPC),增强HNRNPC与表皮生长因子受体(EGFR)mRNA之间的相互作用,增加EGFR mRNA的稳定性和蛋白表达,随后激活磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B信号转导(PI3K)通路。LncRNA LY6E-DT促进Y box结合蛋白1(YBX1)与输入蛋白α1之间的相互作用,增加YBX1蛋白进入细胞核,转录激活锌指E-box结合同源盒1(ZEB1)。本研究结果揭示了由LY6E-DT及其编码的MRP协调的BC侵袭的新调控机制。

 

Fig1. LY6E-DT本身及其编码的蛋白质MRP在调节BC进展中的功能作用



 

原文链接:

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38114778/

 







  

 

SNHG17 alters anaerobic glycolysis by resetting phosphorylation modification of PGK1 to foster pro-tumor macrophage formation in pancreatic ductal adenocarcinoma

SNHG17通过重置PGK1的磷酸化修饰来改变厌氧糖酵解,从而促进胰腺导管腺癌中促肿瘤巨噬细胞的形成

 

发表期刊:J Exp Clin Cancer Res

影响因子:11.3

发表时间:2023年12月15日

 

背景:在肿瘤免疫微环境(TME)中,肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)在调节极化状态以通过代谢重编程影响癌症发展方面起着至关重要的作用。虽然长链非编码RNAs(lncRNAs)已被证明在各种癌症的进展中起着关键作用,但lncRNAs通过巨噬细胞代谢重塑改变M2极化的潜在机制仍未阐明。

 

结果:SNHG17在TAMs中显著富集,且与PDAC患者预后较差呈正相关。同时,功能实验确定SNHG17通过增强M2巨噬细胞极化和厌氧糖酵解促进PCs的恶性进展。机制上,SNHG17可以充当miR-628-5p海绵以释放PGK1 mRNA,并同时与PGK1蛋白相互作用,通过ERK1/2募集增强PGK1 T168A位点的磷酸化,从而激活PGK1的促肿瘤功能。最后,SNHG17敲低可以逆转PDAC中巨噬细胞的极化状态。

 

结论:本研究阐明了SNHG17在PDAC来源的TAMs中的重要作用及其分子机制,表明SNHG17可能是PDAC免疫治疗的可行靶点。

 

Fig2. 研究模型示意图



 

原文链接:

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38098044/

 







 

 

 

Super Enhancer–Regulated LncRNA LINC01089 Induces Alternative Splicing of DIAPH3 to Drive Hepatocellular Carcinoma Metastasis

超级增强子调节的 LncRNA LINC01089诱导DIAPH3可变剪接以驱动肝细胞癌转移

 

发表期刊:Cancer Res

影响因子:11.2

发表时间:2023年12月15日

 

肝细胞癌(HCC)是最致命的肿瘤之一,转移性疾病患者的5年生存率仅为18%。表观遗传修饰因子和改变,包括组蛋白修饰、长链非编码RNA(lncRNA)、RNA选择性剪接和N6-甲基腺苷(m6A)修饰,是HCC发展的关键调节因子,突出了了解这些生物过程之间的串扰的重要性。本研究将LINC01089鉴定为一种超级增强子(SE)驱动的 lncRNA,可在体内和体外促进HCC细胞的上皮-间充质转化(EMT)、迁移、侵袭和转移。转录因子E2F1与LINC01089 SE结合,促进LINC01089的转录和过表达。LINC01089与异质核核糖核蛋白M(hnRNPM)相互作用,导致hnRNPM介导的DIAPH3外显子3跳跃。敲低LINC01089增加了DIAPH3外显子3的内含,其中包含一个重要的m6A修饰位点,IGF2BP3可识别该位点以增加DIAPH3 mRNA 的稳定性。因此,LINC01089缺失增加了DIAPH3蛋白水平,从而抑制了ERK/Elk1/Snail轴并抑制了HCC细胞的EMT。总之,这项研究揭示了驱动HCC进展的不同表观遗传修饰因子和改变之间的串扰,并将LINC01089确定为HCC的潜在预后标志物和治疗靶点。

 

Fig3. SE驱动的L01089-hnRNPM-DIAPH3轴在HCC中的调节和功能的示意图

 



原文链接:

https://aacrjournals.org/cancerres/article-abstract/83/24/4080/731558/Super-Enhancer-Regulated-LncRNA-LINC01089-Induces?redirectedFrom=fulltext

 







 

 

 

Long non-coding RNAs - SNHG6 emerge as potential marker in colorectal cancer

长链非编码RNAs - SNHG6成为结直肠癌的潜在标志物

 

发表期刊:BBA Rev Cancer

影响因子:11.2

发表时间:2023年12月15日

 

结直肠癌(CRC)是西方国家发病率和死亡率最高的癌症之一。目前,没有足够的诊断标志物可以实现早期诊断和有效治疗。不幸的是,大量新的结直肠癌病例是在晚期发现的,并伴有远处转移,因此,迫切需要新的治疗方法,以缓解晚期结直肠癌的预后。SNHG6属于长链非编码RNAs组,这是一个由超过200个核苷酸组成的较大RNAs实体。SNHG6主要在细胞质中表达,在细胞质中它充当许多过程的调节因子:调节关键蛋白质枢纽;海绵化miRNA并上调其靶mRNA的表达;并与各种细胞通路相互作用,包括TGF-β/Smad和Wnt/β-catenin。SNHG6是一种致癌基因,与健康样本相比,在CRC组织和癌细胞系中显著过表达。其过表达与更高分级、淋巴血管浸润和肿瘤大小有关。考虑到SNHG6在结直肠肿瘤发生、侵袭和转移中的作用,本文总结了SNHG6在结直肠癌中的作用,并得出结论,SNHG6可以作为结直肠癌诊断和预后评估的潜在生物标志物。

 

Fig4. SNHG6在结直肠癌中的作用机制示意图

 



原文链接:

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38104909/

 







 

 

 

LncRNA H19 inhibition impairs endoplasmic reticulum-mitochondria contact in hepatic cells and augments gluconeogenesis by increasing VDAC1 levels

LncRNA H19抑制损害了肝细胞中的内质网-线粒体接触,并通过增加VDAC1水平来增强糖异生

 

发表期刊:Redox Biol

影响因子:11.4

发表时间:2023年12月9日

 

尽管内质网(ER)和线粒体发挥着独立的细胞功能,但它们也在称为线粒体相关ER膜(MAMs)的特定位点物理连接,这些位点由几种拴系蛋白组成,这些蛋白在不同的细胞过程中发挥着不同的作用。然而,对细胞内这些拴系蛋白的调节研究相对较少。本研究发现,在糖尿病期间,肝脏中的几种MAM蛋白发生了显著变化,其中lncRNA H19调节VDAC1的水平。使用H19特异性siRNA抑制H19表达改变了Hepa 1-6细胞中的VDAC1、线粒体Ca2+和耗氧率、ATP和ROS水平,并增强了ER和线粒体偶联。虽然H19抑制不影响脂质积累,但糖异生基因水平显著增加。抑制H19可增加JNK磷酸化和IRS1-Ser307磷酸化,这与Hepa 1-6细胞中胰岛素刺激的AKT(Ser-473)磷酸化和葡萄糖摄取的消除有关。使用siRNA和二甲双胍抑制VDAC1的表达可显著挽救H19抑制的作用,而单独过表达VDAC1会产生与H19抑制相似的作用,表明VDAC1的增加介导了H19的不良反应。使用特异性siRNA进行体内H19抑制可增加小鼠肝脏VDAC1、pJNK和pIRS1(Ser307)水平并降低AKT(Ser-473) 磷酸化。这些表明H19-VDAC1轴在糖尿病期间内质网-线粒体偶联和调节肝脏糖异生中的重要作用。

 

Fig5. 研究模型示意图



 

原文链接:

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38100882/

 







 

 

 

Targeting ST8SIA6-AS1 counteracts KRASG12C inhibitor resistance through abolishing the reciprocal activation of PLK1/c-Myc signaling

靶向ST8SIA6-AS1通过消除PLK1/c-Myc信号的相互激活来抵消KRASG12C抑制剂的耐药性

 

发表期刊:Exp Hematol Oncol

影响因子:10.9

发表时间:2023年12月16日

 

背景:KRASG12C抑制剂(KRASG12Ci)AMG510和MRTX849在临床试验中显示出良好的疗效,并已被批准用于KRASG12C突变癌症的治疗。然而,与治疗相关的耐药性的出现限制了它们的长期潜力。本研究旨在确定关键介质并制定克服策略。

 

结果:KRASG12Ci可持续地降低应答细胞系的c-Myc水平,但在对KRASG12Ci具有固有或获得性耐药性的细胞系中则没有。PLK1激活有助于这种不依赖ERK的c-Myc稳定性,这反过来直接诱导PLK1转录,形成一个正反馈回路,并赋予对KRASG12Ci的抗性。本研究发现ST8SIA6-AS1在耐药细胞中显著上调,并促进KRASG12C突变癌症的增殖。ST8SIA6-AS1与Aurora激酶A(Aurora A)/PLK1结合并促进Aurora A介导的PLK1磷酸化。同时靶向KRA和ST8SIA6-AS1/PLK1信号可抑制ERK依赖性和非依赖性c-Myc表达,协同导致细胞死亡和肿瘤消退,并克服KRASG12Ci耐药性。

 

结论:本研究破译了ST8SIA6-AS1/PLK1/c-Myc轴对KRASG12Ci具有固有和获得性耐药性,并且代表了与KRASG12Ci联合治疗KRASG12C突变癌症的有希望的治疗靶点。

 

Fig6. 同时靶向ST8SIA6-AS1/PLK1/c-Myc轴与KRAS引起显著的KRASG12Ci耐药细胞死亡的机制示意图



 

原文链接:

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38104151/









 

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