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miRNA研究进展盘点丨20231206期
人阅读 发布时间:2023-12-06 08:47
01
发表期刊:Adv Sci (Weinh)
影响因子:15.1
发表时间:2023年12月3日
细胞外囊泡(EVs)在包括急性脑损伤在内的中枢神经系统(CNS)疾病的发病机制中的关键作用越来越得到认可。本研究通过分析脑出血(ICH)患者血浆样本中EVs包裹的miRNAs,发现EVs包裹的miR-143-3p(EVs-miR-143-3p)水平与血肿周围水肿和神经系统预后密切相关。进一步的研究表明,在ICH后,星形胶质细胞会强烈分泌EVs-miR-143-3p,并可以穿梭到脑微血管内皮细胞(BMECs)中。BMECs中miR-143-3p水平升高可诱导细胞粘附分子(CAMs)的表达上调,这些分子与循环中性粒细胞结合并促进其跨内皮细胞迁移(TEM)进入大脑。机制方面,miR-143-3p直接靶向ATP6V1A,导致溶酶体水解能力受损并减少CAMs的自噬降解。重要的是,本研究创建了一种靶向VCAM-1的EVs系统,以选择性地将miR-143-3p抑制剂递送至病理性BMECs,该系统在ICH和创伤性脑损伤(TBI)小鼠模型中都显示出令人满意的治疗效果。总之,该研究强调了EVs-miR-143-3p在急性脑损伤中BMECs功能障碍中的因果作用,并证明了工程化EVs可以设计为一种潜在的适用于治疗中枢神经系统疾病的核苷酸药物递送系统的概念证明。
Fig1. miR-143-3p通过靶向ATP6V1A损害CAMs的自噬降解
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38044319/
02
具有尾巴的mirtron可促进果蝇的寿命
发表期刊:Nucleic Acids Res
影响因子:14.9
发表时间:2023年12月4日
在动物基因组中已经发现了数以千计的非典型microRNAs(miRNAs);然而,目前尚不清楚这些非典型miRNAs是否可以适度地影响表型。Mirtrons是最大的一类非经典miRNAs,由剪接切除的发夹产生,在脱支后成为Dicer的底物并加载到RISC中。大多数mirtron在剪接后需要额外的处理,以去除插入在其中一个宿主内含子剪接位点和发夹前体结构基部之间的“尾部”残基。尽管大多数mirtrons需要去除尾巴,但尚未对有尾巴mirtrons的功能进行阐明,事实上,对于所有已鉴定的mirtrons功能仅指定到单一物种。本研究发现miR-1017,一种具有3'尾巴的mirtron,其在果蝇物种中表达良好且保守。研究发现miR-1017在神经元中异位表达时可以延长寿命,这似乎部分是由于这种miRNA靶向其宿主转录本乙酰胆碱受体Dα2。出乎意料的是,研究人员发现miR-1017不仅在反式中起作用,而且通过影响Dα2的剪接在顺式中也起作用。这暗示了一种mirtron进化的机制,其中结构元件在剪接中的初始作用导致反式调节功能的二次获得。
Fig2. 研究模型示意图
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38048325/
03
miRNA-靶标相互作用:被低估的复杂性
发表期刊:Nucleic Acids Res
影响因子:14.9
发表时间:2023年12月1日
MicroRNAs(miRNAs)在转录后基因调控中起着不可或缺的作用。它们对细胞的调控作用不仅取决于它们的绝对数量(在人类中可能超过2000个独特的miRNAs),还取决于单个miRNAs的调控有效性。尽管人们开始了解miRNA-靶标相互作用(MTIs)的复杂机制,但对MTI功能的整体了解仍然相当不完整。在这篇批判性综述中,作者总结了哺乳动物MTIs的主要特征。特别强调了以下方面的新见解:(i)miRNA结合位点的动态组成,包括非典型结合位点,(ii)miRNA结合位点之间的协同性,(iii)MTIs通过序列修饰的适应性,(iv) 细胞内miRNA定位变化的影响,以及(v)细胞类型和细胞状态特异性miRNA相互作用伙伴的作用。本文在zui先进的方法背景下讨论了MTI生物学,特别强调了评估miRNA功能的实验策略。
Fig3. miRNA-靶标相互作用(MTIs)模型图
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38048325/
04
基于胆汁的microRNA标记可用于鉴别良性与恶性胰胆管疾病
发表期刊:Exp Hematol Oncol
影响因子:10.9
发表时间:2023年12月1日
鉴别胰腺导管腺癌(PDAC)和胆管癌(CCA)对于适当的疗程至关重要,尤其是与CCA相比,新辅助化疗对PDAC的作用越来越大。此外,良性胰胆疾病可能与恶性疾病相似,不确定的病变可能需要反复检查才能做出诊断。由于胆汁在这些病变附近流动,本研究旨在建立基于胆汁的microRNA(miRNA)标记,以区分恶性和良性胰胆管疾病。本研究通过使用NanoString nCounter平台在前瞻性收集的恶性(n=43)和良性(n=14)胰胆管疾病的胆汁样本中对800个miRNAs进行全局分析来进行miRNA发现。通过RT-qPCR验证差异表达的miRNAs,并在恶性(n=37)和良性(n=38)胰胆管疾病胆汁的独立验证队列中进一步评估。在发现队列(AUC=0.797 [95% CI 0.68-0.92])、验证队列(AUC=0.772 [95% CI 0.66-0.84])和联合队列(AUC=0.752 [95% CI 0.67-0.84])中,MiR-148a-3p被确定为一种鉴别性标志物,可有效区分恶性和良性胰胆管病。本研究还建立了一个双miRNA标记(miR-125b-5p和miR-194-5p),将PDAC与CCA区分开来(验证:AUC=0.815 [95%CI 0.67-0.96];合并队列:AUC=0.814 [95%CI 0.70-0.93])。该研究是对胰胆管疾病患者胆汁中miRNAs的最大、多中心、全局分析研究。证明了它们作为检测和鉴别恶性胰胆管疾病的临床上有用的诊断工具的潜力。这些胆汁miRNA生物标志物可以被开发出来,以补充目前诊断胰胆癌的方法。
Fig4. 研究模型示意图
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38041102/
05
MiR-1246b是支气管肺泡灌洗液中细胞外囊泡的一种新型miRNA分子,可通过FGF14促进肺癌患者的结节生长
发表期刊:Cell Death Dis
影响因子:9.0
发表时间:2023年12月1日
随着胸部计算机断层扫描(CT)的广泛发展,肺结节的检出率有所提高;因此,良性结节与恶性结节的分类已成为临床上普遍存在的问题。MicroRNA作为一种潜在的工具,有望通过支气管肺泡灌洗液细胞外囊泡(BALF-EVs)载体,成为诊断和研究疾病发生和发展的良好选择。本研究采用径向支气管内超声(R-EBUS)定位患者的肺结节。获得BALF,分离EVs,并进行小RNA测序,筛选良恶性肺结节间差异表达的miRNAs。通过体外和体内实验验证了差异表达miRNAs的结合靶点和潜在机制。采用R-EBUS定位和采样获得BALF,并成功分离和表征了EVs。通过高通量小RNA测序筛选良性与恶性肺结节患者BALF-EVs中差异表达的miRNAs。结果鉴定出一种新的miRNA miR-1246b。通过荧光素酶测定发现FGF14是miR-1246b的结合靶标。后续的机制研究表明,miR-1246b抑制了肺癌细胞中FGF14的表达,进一步导致ERK磷酸化和上皮间充质转化(EMT),最终促进了肺癌细胞的增殖、迁移和侵袭。总之,本研究表明,通过液体活检手段检测BALF-EVs中的miRNAs,可以帮助区分恶性结节和良性结节。从BALF-EVs中提取的miR-1246b靶向FGF14,促进肺癌细胞增殖、迁移和侵袭。
Fig5. miR-1246b促进肺癌进展的分子机制示意图
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38040694/