推荐产品
公司新闻/正文
lncRNA研究进展盘点丨20231128期
人阅读 发布时间:2023-11-28 16:20
01
恐惧消退受突触处长链非编码RNAs活性的调节
发表期刊:Nat Commun
影响因子:16.6
发表时间:2023年11月22日
长链非编码RNAs(lncRNAs)代表了一类多维的调节分子,涉及大脑功能的许多方面。新出现的证据表明,lncRNAs定位于突触;然而,它们在这个亚细胞区室中的活性在记忆形成中的直接作用尚未得到证实。使用lncRNA capture-seq,本研究鉴定了一组特定的lncRNAs,这些lncRNAs积聚在成年雄性C57/Bl6小鼠边缘下前额叶皮层内的突触区室中。其中包括与应激相关的lncRNA Gas5相关的剪接变体。RNA免疫沉淀、质谱分析和单分子成像显示,该Gas5亚型与RNA结合蛋白G3BP2和CAPRIN1结合,调节RNA颗粒的活性依赖性运输和聚集。此外,研究人员发现细胞类型特异性、活动依赖性和突触特异性敲低Gas5变体导致恐惧消退记忆受损。这些发现确定了一种新的恐惧消除机制,该机制涉及突触区室中局部lncRNA活性和RNA凝聚物之间的动态相互作用。
Fig1. Gas5影响突触活性和恐惧消退记忆形成的机制模型
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37993455/
02
LncRNA INHEG通过调节rRNA 2'-O-甲基化促进胶质瘤干细胞的维持和致瘤性
发表期刊:Nat Commun
影响因子:16.6
发表时间:2023年11月18日
胶质母细胞瘤(GBM)是人类最致命的癌症之一,其含有具有治疗耐药性的胶质瘤干细胞(GSCs)。本研究结果显示,与分化胶质瘤细胞(DGCs)相比,lncRNA INHEG在GSCs中高表达,并通过控制rRNA 2'-O-甲基化促进GSC自我更新和致瘤性。INHEG诱导SUMO2 E3连接酶TAF15与引导rRNA甲基化的snoRNP核心成分NOP58相互作用,调控NOP58的sumoylation,并加速C/D盒snoRNP组装。INHEG激活增强rRNA 2'-O-甲基化,从而增加胶质瘤细胞中致癌蛋白的表达,包括EGFR、IGF1R、CDK6和PDGFRB。综上所述,这项研究确定了一种lncRNA,该lncRNA将snoRNP引导的rRNA 2'-O-甲基化与GSCs中上调的蛋白质翻译联系起来,从而为胶质瘤潜在治疗靶向提供了支持。
Fig2. INHEG促进GSCs的自我更新和胶质瘤生成
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37980347/
03
SINE相关LncRNA SAWPA调节猪合子基因组激活
发表期刊:Adv Sci
影响因子:15.1
发表时间:2023年11月20日
在小鼠中,逆转录转座子相关的长链非编码RNAs(lncRNAs)在植入前发育中起着重要的调控作用;然而,它们是否在猪的植入前发育中起作用在很大程度上是未知的。目前的研究旨在筛选猪早期胚胎中的逆转录转座子相关lncRNA,并鉴定出一种名为SAWPA的猪8细胞胚胎特异性SINE相关核长链非编码RNA。SAWPA对猪胚胎发育至关重要,因为SAWPA的缺失会导致8细胞阶段的发育停滞,同时抑制JNK-MAPK信号通路。机制上,SAWPA通过形成RNA-蛋白质复合物,与HNRNPA1和MED8结合JNK上游的SINE元件,在反式中作为JNK的转录因子起作用。因此,SAWPA作为猪体内shou个功能性SINE相关长链非编码RNA,为哺乳动物胚胎植入前发育中逆转录转座子的机制研究提供了新的见解。
Fig3. SAWPA通过SINE序列结合MED8和HNRNPA1来调控JNK的模型示意图
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37984872/
04
HILPS是一种对人类全局氧感应至关重要的长链非编码RNA
发表期刊:Sci Adv
影响因子:13.6
发表时间:2023年11月24日
适应低水平的氧气(缺氧)是后生动物的普遍生物学特征。然而,不同物种感知缺氧的独特机制仍未得到解决。本研究在功能上表征了一种新型长链非编码RNA(lncRNA) LOC105369301,将其称为缺氧诱导的lncRNA,用于polo样激酶1(PLK1)稳定(HILPS)。HILPS仅在多种人类正常细胞和癌细胞中表现出明显的基础表达,并由缺氧诱导因子1α (HIF1α)强烈诱导。HILPS与PLK1结合并将其与蛋白酶体降解隔离。稳定的PLK1直接磷酸化HIF1α并增强其稳定性,构成正前馈回路,增强HIF1α的氧感应。HILPS缺失在正常细胞和癌细胞的缺氧期间触发灾难性的适应缺陷。这些发现引入了一种与PLK1完整性密切相关的HIF1α身份基础机制,并将HILPS-PLK1-HIF1α通路确定为调节人体生理和致病过程的独特氧敏感轴。
Fig4. HILPS抑制阻碍缺氧下人体类器官的生长
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37992175/
05
m6A修饰的BACE1-AS通过TUFT1依赖性激活Wnt信号促进结直肠癌的肝转移和干性样特性
发表期刊:J Exp Clin Cancer Res
影响因子:11.3
发表时间:2023年11月21日
背景:肝转移是结直肠癌(CRC)高死亡率的最重要原因之一。越来越多的证据表明,lncRNAs在CRC肝转移中起着关键作用。本研究探索了BACE1-AS促进CRC肝转移的新功能和机制。
结果:BACE1-AS在与预后不良相关的转移性CRC中表达上调最多。Sequence blast揭示了BACE1-AS中的两个m6A基序。IGF2BP2与这两个m6A基序的结合是转移性CRC中BACE1-AS增强所必需的。m6A修饰的BACE1-AS在体外和体内驱动CRC细胞迁移和侵袭以及肝转移。此外,BACE1-AS维持CRC细胞的干性样特性。机制上,BACE1-AS通过miR-214-3p的ceRNA网络促进TUFT1表达。具有这种ceRNA网络的CRC患者的预后比ceRNA阴性患者更差。TUFT1 的缺失类似于BACE1-AS的缺失。BACE1-AS以TUFT1依赖性方式激活Wnt信号通路。BACE1-AS/miR-214-3p/TUFT1/Wnt信号调节轴对CRC肝转移至关重要。Wnt信号通路的药理抑制抑制了BACE1-AS过表达CRC细胞的肝转移和干性样特征。
结论:本研究证明BACE1-AS是m6A修饰IGF2BP2的新靶点。m6A修饰的BACE1-AS通过TUFT1依赖性激活Wnt信号通路促进CRC肝转移。因此,靶向BACE1-AS及其下游Wnt信号通路可能为转移性CRC的干预和治疗提供新的机遇。
Fig5. BACE1-AS在体外和体内促进CRC转移
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37986103/