01

来自FTO位点的lncRNA作为m6A writer复合物和p53肿瘤抑制信号的抑制因子

 

发表期刊：Mol Cell

影响因子：16.0

发表时间：2023年7月20日

 

METTL3-METTL14-WTAP-RBM15甲基转移酶复合物和m6A去甲基化酶（如FTO）调节的mRNA的N6-甲基腺苷（m6A）在调控mRNA的稳定性、剪接和翻译中发挥重要作用。本研究证明了FTO-IT1长链非编码RNA（lncRNA）上调，并与野生型p53表达前列腺癌（PCa）患者的低生存率呈正相关。m6A RIP-seq分析显示，FTO-IT1敲除增加了p53转录靶基因子集（例如FAS、TP53INP1和SESN2）的mRNA m6A甲基化，并诱导PCa细胞周期停滞和凋亡。进一步研究表明，FTO-IT1直接结合RBM15并抑制RBM15的结合、m6A甲基化和p53靶mRNA的稳定性。FTO-IT1的治疗性缺失恢复了小鼠的mRNA m6A水平和p53靶基因的表达，并抑制了PCa的生长。本研究将FTO-IT1 lncRNA确定为m6A甲基转移酶复合物和p53肿瘤抑制信号的真正抑制因子，并将FTO-IT1指定为癌症的潜在治疗靶点。

 

Fig1. FTO-IT1调控mRNA m6A甲基化的工作模型

 

原文链接：

https://www.cell.com/molecular-cell/fulltext/S1097-2765(23)00471-9#%20

 

02

lncRNAs参与癌细胞迁移、侵袭和转移：细胞骨架和ECM串扰

 

发表期刊：J Exp Clin Cancer Res

影响因子：11.3

发表时间：2023年7月18日

 

癌症是全世界死亡的主要原因，转移是预后不良和癌症相关死亡的主要原因。癌细胞的转移转化是一个多重过程，包括通过细胞骨架重塑和与TME相互作用的EMT。已经鉴定出数以万计的假定lncRNAs，但大多数的生物学功能仍有待鉴定。然而，lncRNAs已经成为转录和转录后水平上基因表达的关键调节因子，以时空方式控制基因表达。LncRNA依赖性机制可以在发育过程中控制细胞命运，它们的扰动表达与包括癌症在内的许多疾病的发生和进展有关。LncRNAs通过不同的作用模式参与了癌细胞转移的每一步。研究lncRNAs在癌症转移中的不同作用，可能会导致新的生物标志物的鉴定和创新的癌症治疗方案。

 

Fig2. lncRNAs调控基因表达的不同作用机制

 

原文链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37464436/

 

03

LncRNA AGPG通过促进E2F1活性赋予乳腺癌内分泌耐药性

 

发表期刊：Cancer Res

影响因子：11.2

发表时间：2023年7月18日

 

对内分泌治疗的耐药性是雌激素受体α阳性（ERα+）乳腺癌患者的主要关注点。内分泌治疗耐药性通常由激活的E2F信号介导。更好地了解控制耐药细胞中E2F1活性的机制可以揭示克服耐药性的策略。本研究确定了长链非编码RNA（lncRNA）AGPG（肌动蛋白γ1假基因25）作为内分泌耐药乳腺癌E2F1活性的调节因子。AGPG在内分泌耐药乳腺癌细胞中的表达增加，这是由一种增强子的表观基因组激活驱动的。AGPG在乳腺肿瘤患者中也异常上调，特别是在管腔B亚型中，高AGPG表达与接受内分泌治疗的ERα+乳腺癌患者的生存率低有关。AGPG的上调介导乳腺癌细胞对内分泌治疗的耐药性和CDK4/6的抑制。机制上，AGPG与PURα物理相互作用，从而从PURα释放E2F1，并导致ERα+乳腺癌细胞中的E2F1信号激活。在乳腺癌患者中，E2F1靶基因分别与AGPG和PURα的表达呈正和负相关。化学修饰的AGPG siRNA和他莫昔芬的共同给药强烈抑制了内分泌耐药细胞系来源的异种移植物中的肿瘤生长。总之，这些结果表明AGPG可以驱动内分泌治疗耐药性，并表明它是乳腺癌中一种很有前途的生物标志物和潜在的治疗靶点。

 

Fig3. 表观遗传激活AGPG调控乳腺癌PURα/E2F1复合物的模型

 

原文链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37463119/

 

04

scLNC对肿瘤浸润T细胞lncRNA重新布线和功能改变的泛癌研究

 

发表期刊：Cancer Lett

影响因子：9.7

发表时间：2023年7月17日

 

据报道，长链非编码RNAs（lncRNAs）参与多种生物过程，包括肿瘤免疫。由于lncRNAs的表达具有高细胞类型特异性，因此在单细胞水平上对lncRNAs的研究将揭示lncRNAs的细胞类型特异性功能。然而，在单细胞水平上，仍然缺乏对肿瘤免疫微环境（TIMEs）中lncRNA功能的系统泛癌症分析。本研究对TIMEs中的lncRNA功能进行了泛癌单细胞分析，并开发了一种工具scLNC，专门用于在单细胞水平上对lncRNA进行功能表征。scLNC能够以细胞类型特异性的方式从lncRNA-mRNA对的水平、lncRNA调节单元活性和单元功能来比较lncRNA功能。本研究应用scLNC分析描述了T细胞亚型中的跨肿瘤和肿瘤特异性lncRNA调控谱，并揭示了lncRNAs在肿瘤浸润性T细胞中建立的新调控单元，特别是在肿瘤富集的T细胞中。研究人员通过lncRNAs的调控单元进一步表征了lncRNAs的活性和功能变化。总体而言，本研究结果表明，lncRNAs在肿瘤富集T细胞的细胞因子产生、细胞活化和迁移调控中，以及在进一步的免疫治疗中发挥了重要作用。

 

Fig4. scLNC及其在泛癌TIMEs中的应用

 

原文链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37468058/

 

05

MGCG通过hnRNPK/ATG2A调节胶质母细胞瘤的致瘤性并促进自噬

 

发表期刊：Cell Death Dis

影响因子：9.0

发表时间：2023年7月17日

 

胶质母细胞瘤（GBM）是成人中最常见的原发性恶性脑癌，一直是研究的焦点。长链非编码RNAs（lncRNAs）在癌症的发生发展中起着重要作用。为了阐明lncRNAs在胶质母细胞瘤发展中的作用，本研究使用来自GBM患者的三个新鲜分离的肿瘤组织样本和来自脑损伤患者的三个正常脑组织样本进行高通量RNA测序以获得转录本。然后，发现一种之前在GBM中未报道过的lncRNA MGCG（MGC70870在胶质母细胞瘤中高水平表达），其与患者的预后相关。生物信息学分析结果表明，MGCG与自噬相关，且与自噬相关基因ATG2A的表达呈正相关。质谱数据表明，hnRNPK蛋白是与MGCG相互作用的直接靶标，MGCG/hnRNPK通过增强ATG2A的翻译和自噬促进GBM的发展。综上所述，本研究表明MGCG具有促进GBM发展的潜力，并可能成为肿瘤分子诊断和治疗的候选药物。

 

Fig5. MGCG在GBM中的作用和机制

 

原文链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37460467/