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ACS Nano(IF17.1)丨CRISPR-Cas9全RNA体系客户应用案例
人阅读 发布时间:2023-07-19 13:44
近日,ACS Nano期刊发表了一篇题为Biomodified Extracellular Vesicles Remodel the Intestinal Microenvironment to Overcome Radiation Enteritis的研究论文。其中,为了构建无miR-142表达的原代小鼠小肠细胞(PIC)来源的外泌体(PIC-exo|miR-142|KO),研究人员使用锐博生物CRISPR-Cas9全RNA体系来敲除PICs 中的Mir142基因。
Fig1. 使用CRISPR-Cas9全RNA体系构建PIC-exo|miR-142|KO的流程示意图
简单来说,即先将合成的crRNA(10 nM)、tracrRNA(10 nM)和Cas9 mRNA(1000 ng)与mRNA转染试剂混合。孵育5 min后,将混合物加入PICs中。将细胞进一步培养约48−72 h。用0.25%胰蛋白酶处理细胞,并使用含FBS的培养基将细胞稀释至终浓度(5个细胞/mL)。然后,将细胞以100μL/孔置于96孔板中。培养7−14天后,筛选单克隆细胞群以进行进一步培养。然后,从扩增的细胞中提取基因组和总RNA进行鉴定。对于基因组,以Positive Control crRNA作为阳性对照,采用RT-PCR方法检测Mir142基因中的剪切片段(773 bp)。对于总RNA,通过细胞中的qPCR分析验证miR-142水平。然后筛选Mir142敲除(KO)单克隆PICs,并分离外泌体进行进一步研究。用于验证的crRNAs靶序列和引物见下表。
结果显示,使用CRISPR/Cas9 mRNA系统将Mir142基因中的剪切片段(773 bp)敲除以后,与对照组相比,RT-PCR未检测到对应剪切片段的条带。此外,定量RT‒PCR检测发现,与对照组相比,在PIC |miR-142|KO中未检测到miR-142的表达水平。表明使用CRISPR-Cas9全RNA体系已成功实现PIC-exo|miR-142|KO的构建,可用于进一步实验。
Fig2. PIC-exo|miR-142|KO的验证
参考文献:
Li H, Zhao S, Jiang M, et al. Biomodified Extracellular Vesicles Remodel the Intestinal Microenvironment to Overcome Radiation Enteritis[J]. ACS nano, 2023.