01

在集体癌症侵袭过程中，长链非编码RNA MALAT1在领导细胞中受到动态调节

 

影响因子：12.78

发表时间：2023年6月26日

 

癌细胞使用“leader”-“追随者”组织集体侵袭，但领导细胞在这个动态过程中的调节知之甚少。本研究使用双重双链锁核酸（LNA）纳米生物传感器跟踪活单细胞中的长链非编码RNA（lncRNA）动力学，监测了lncRNA在集体癌症侵袭过程中的时空分布。结果发现，lncRNA MALAT1（转移相关肺腺癌转录本1）在癌细胞和患者来源的球状体的侵袭前沿中动态调节。MALAT1转录本在领导细胞和追随细胞之间表现出明显的丰度、扩散性和分布。当癌细胞成为“leader”时，MALAT1表达增加，当集体迁移过程停止时，MALAT1表达降低。MALAT1的瞬时敲低可防止领导细胞的形成并消除癌细胞的侵袭。综上所述，本研究的单细胞分析表明，在集体癌症侵袭过程中，MALAT1在领导细胞中受到动态调节。

 

Fig1. MALAT1在领导细胞的形成和终止过程中受到动态调控

 

原文链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37364126/

 

02

转录组测序分析揭示了lncRNA NONMMUT058932.2和NONMMUT029203.2在产前PM2.5暴露后雄性后代髓鞘发育异常中的潜在作用

 

发表期刊：Sci Total Environ

影响因子：10.75

发表时间：2023年6月20日

 

大量流行病学研究表明，早年接触PM2.5会影响男孩大脑发育并增加神经发育障碍的风险，但其潜在的分子机制尚不清楚。在本研究中，怀孕的C57BL/6 J小鼠在口咽部给予PM2.5悬浮液（3mg/kg/2天），直到后代出生。基于mRNA表达谱，采用双向方差分析（双向ANOVA）和加权基因共表达网络分析（WGCNA）来探讨雄性后代中受影响最大的神经发育过程和最显著相关的基因模块。GO富集和KEGG通路分析表明，产前PM2.5暴露显著改变了几个生物过程（如底物粘附依赖性细胞扩散、髓鞘形成和神经元鞘）和KEGG通路（如紧密连接和轴突引导）。进一步研究发现，PM2.5暴露显著改变了雄性后代在出生后发育过程中髓鞘相关基因的表达，并使PND 14和21上的髓鞘超微结构受损，表现为视神经中髓鞘厚度的减少和胼胝体中髓磷脂的轻度丢失。重要的是，lncRNA NONMMUT058932.2和NONMMUT029203.2通过与转录因子Ctcf结合调节几个髓鞘形成相关基因（Fa2h、Mal、Sh3tc2、Trf和Tppp）的表达，在异常髓鞘形成中发挥关键作用。本研究工作为产前PM2.5暴露诱导的雄性后代神经发育障碍提供了基因组证据。

 

Fig2. lncRNA NONMMUT058932.2和NONMMUT029203.2在产前PM2.5暴露后雄性后代髓鞘发育异常中的作用示意图

 

原文链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37348736/

 

03

lncRNA LETS1通过转录激活TβR1稳定机制促进TGF-β诱导的EMT和癌细胞迁移

 

发表期刊：Sci Signal

影响因子：9.58

发表时间：2023年6月20日

 

转化生长因子β（TGF-β）信号是上皮-间充质转化（EMT）和癌症进展的关键驱动因素。在SMAD依赖性TGF-β信号中，TGF-β受体复合物的激活刺激细胞内受体相关SMADs（SMAD2和SMAD3）的磷酸化，这些SMADs易位到细胞核以促进靶基因表达。SMAD7通过促进TGF-β I型受体（TβRI）的多泛素化来抑制通过该途径的信号传导。本研究鉴定出一种未注释的核长链非编码RNA（lncRNA），将其命名为LETS1（lncRNA enforcing TGF-β signaling 1），LETS1不仅在TGF-β信号传导中增加，而且在TGF-β信号传导中延续。LETS1的缺失减弱了TGF-β诱导的EMT和体外乳腺癌和肺癌细胞的迁移以及斑马鱼异种移植模型中细胞的外渗。LETS1通过稳定细胞表面TβRI来增强TGF-β-SMAD信号传导，从而形成正反馈回路。具体而言，LETS1通过与活化T细胞的核因子（NFAT5）结合并诱导编码孤儿核受体4A1（NR4A1）的基因表达来抑制TβRI多泛素化，该受体是SMAD7破坏复合物的组成部分。总之，本研究结果将LETS1表征为一种促进EMT的lncRNA，其通过TGF-β受体复合物增强信号传导。

 

Fig3. LETS1通过增强NFAT5介导的NR4A1转录对TGF-β-SMAD信号转导的作用模型示意图

 

原文链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37339182/

 

04

GAS5通过miR-28a-5p/MARCH7/NLRP3轴介导的焦亡预防非酒精性脂肪性肝病

 

发表期刊：Cell Death Differ

影响因子：12.08

发表时间：2023年6月19日

 

非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）的特征是肝脂肪变性、炎症和胰岛素抵抗。长链非编码RNA（lncRNA）调控的焦亡在NAFLD发展中的作用在很大程度上仍然未知。本研究旨在通过体内和体外模型研究lncRNA生长停滞特异性转录本5（GAS5）/miR-28a-5p/膜相关环CH型指7（MARCH7）介导的焦亡是否控制NAFLD的发展。首先，GAS5在NAFLD患者、高脂肪饮食（HFD）喂养的小鼠和瘦素缺乏的肥胖（Ob/Ob）小鼠的肝脏中表达降低，而miR-28a-5p表达增加。此外，GAS5抑制NAFLD的发展，而miR-28a-5p则促进NAFLD的发展，miR-28a-5p的过表达逆转GAS5过表达诱导的NAFLD衰减。机制上，GAS5作为miR-28a-5p的海绵，和miR-28a-5p通过在NAFLD发展过程中靶向E3连接酶MARCH7的3'非翻译区域（UTR）来增强焦亡。MARCH7与NOD样受体蛋白3（NLRP3）蛋白相互作用，导致NLRP3的蛋白酶体降解以抑制焦亡。正如预期的那样，MARCH7敲低消除了miR-28a-5p敲低诱导的对NAFLD发展的抑制，而MARCH7的泛素E3连接酶无活性突变体（W589A / I556A）未能抑制NAFLD的发展。总之，GAS5通过与miR-28a-5p结合来防止NAFLD的发展，miR-28a-5p通过靶向MARCH7促进NAFLD的发展，而MARCH7通过抑制NLRP3介导的焦亡来改善NAFLD。GAS5/miR-28a-5p/MARCH7/NLRP3轴在NAFLD的进展中起重要作用，它可能是NAFLD的生物标志物。

 

Fig4. miR-28a-5p的过表达显著消除了GAS5过表达介导的对Ob/Ob小鼠肝脂肪变性，炎症和胰岛素抵抗的抑制

 

原文链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37337032/

 

05

缺氧响应的lncRNA AC115619编码一种抑制m6A修饰和肝细胞癌进展的微肽

 

发表期刊：Cancer Res

影响因子：13.31

发表时间：2023年6月16日

 

长链非编码RNAs（lncRNAs）调节癌症生物学的许多方面。最近的研究表明，lncRNAs可以编码微肽，介导其在肿瘤中的功能。本研究发现肝脏特异性假定的lncRNA AC115619，其在肝细胞癌（HCC）中低水平表达，并编码一种微肽，称为AC115619-22aa。AC115619在肿瘤进展的调节中起关键作用，是HCC的预后指示因子。编码的微肽AC115619-22aa通过与WTAP结合并阻碍N6-甲基腺苷（m6A）甲基转移酶复合物的组装来抑制HCC的进展，而N6-甲基腺苷（m6A）甲基转移酶复合物调节肿瘤相关基因（如SOCS2和ATG14）的表达。AC115619与邻近的上游编码基因APOB共转录，缺氧通过控制HIF1A/HDAC3和HNF4A信号传导诱导APOB和AC115619的转录抑制。在动物和患者来源的模型中，AC115619-22aa降低了全局m6A水平并抑制了肿瘤生长。总之，本研究确立了AC115619及其编码的微肽作为HCC患者的潜在预后标志物和治疗靶点。

 

Fig5. 合成AC115619-22aa抑制PDX和PDO模型中HCC的发展

 

原文链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37326474/