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lncRNA研究进展盘点丨20230601期
人阅读 发布时间:2023-07-03 11:45
01
影响因子:15.26
发表时间:2023年5月24日
慢性疼痛影响着全世界数百万人,迫切需要新的治疗方法。确定新型镇痛策略的一种方法是了解导致人类遗传性疼痛不敏感疾病的生物学功能障碍。本研究报道了最近发现的脑和背根神经节表达的FAAH-OUT长链非编码RNA(lncRNA)基因,该基因是通过研究焦虑减轻和伤口快速愈合的疼痛不敏感患者而发现的,其可调节邻近的关键endocannabinoid系统基因FAAH。本研究证明了FAAH-OUT lncRNA转录的中断导致FAAH启动子内的DNMT1依赖性DNA甲基化。此外,FAAH-OUT还含有一种保守的调节元件FAAH-AMP,可作为FAAH表达的增强子。此外,通过对患者来源的细胞进行转录组学分析,研究人员发现了一个因FAAH-FAAH-OUT轴的破坏而失调的基因网络,从而为理解所观察到的人类表型提供了一致的机制基础。鉴于FAAH是治疗疼痛、焦虑、抑郁和其他神经系统疾病的潜在靶点,对FAAH-OUT基因调控作用的新认识为未来基因和小分子疗法的开发提供了一个平台。
Fig1. FAAH-OUT依赖性调节FAAH表达和患者随后表型变化的示意图
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37222214/
02
FAR591通过调节Fos表达介导的骨微血管内皮细胞凋亡来促进SONFH的发病机制和进展
影响因子:13.36
发表时间:2023年5月22日
类固醇诱导的股骨头骨坏死(SONFH)的具体发病机制尚不完全清楚,目前尚无有效的早期治愈方法。了解长链非编码RNAs(lncRNAs)在SONFH发病机制中的作用和机制,有助于揭示SONFH的发病机制,为其早期防治提供新的靶点。本研究首先证实了糖皮质激素(GC)诱导的骨微血管内皮细胞(BMECs)凋亡是SONFH发病机制和进展的前置事件。然后,研究人员通过lncRNA/mRNA微阵列在BMECs中鉴定出一种新的lncRNA,称为Fos相关的lincRNA ENSRNOT00000088059.1(FAR591)。FAR591在GC诱导的BMEC细胞凋亡和股骨头坏死中高表达。敲除FAR591可有效阻断GC诱导的BMECs细胞凋亡,从而减轻GCs对股骨头微循环的损伤,抑制SONFH的发病机制和进展。相比之下,过表达FAR591显著促进了GC诱导的BMECs细胞凋亡,从而加剧了GCs对股骨头微循环的损伤,促进了SONFH的发病机制和进展。机制上,GCs激活糖皮质激素受体,糖皮质激素受体易位到细胞核并直接作用于FAR591基因启动子以诱导FAR591基因过表达。随后,FAR591与Fos基因启动子(-245∼-51)结合形成稳定的RNA:DNA三联体结构,然后募集TATA-box结合蛋白相关因子15和RNA聚合酶II,通过转录激活促进Fos表达。Fos通过调节Bim(Bcl-2 interacting mediator of cell death)和Puma(P53 upregulated modulator of apoptosis)的表达来激活线粒体凋亡途径,以介导GC诱导的BMECs凋亡,从而导致股骨头微循环功能障碍和股骨头坏死。综上所述,这些结果证实了lncRNA与SONFH发病机制之间的机制联系,有助于揭示SONFH的发病机制,为SONFH的早期防治提供新的靶点。
Fig2. FAR591介导的GC诱导股骨头坏死机制示意图
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37217464/
03
NR_109/FUBP1/c-Myc轴调控TAM极化,重塑肿瘤微环境,促进肿瘤发展
发表期刊:J Immunother Cancer
影响因子:12.49
发表时间:2023年5月22日
背景:肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)是肿瘤微环境(TME)的重要组成部分,在肿瘤进展中发挥重要作用。由于TAMs的异质性和可塑性,调节TAMs的极化状态被认为是一种肿瘤的潜在治疗策略。长链非编码RNAs(lncRNAs)与各种生理和病理过程有关,但lncRNAs如何操纵TAMs极化状态的潜在机制尚不清楚,仍有待进一步研究。
结果:本研究发现lncRNA NR_109在M2样巨噬细胞中高表达。敲低NR_109阻碍IL-4诱导的M2样巨噬细胞极化,并显著降低M2样巨噬细胞的活性,以支持肿瘤细胞在体外和体内的增殖和转移。机制上,NR_109与JVT-1竞争性结合在FUBP1的C末端结构域结合,阻碍泛素介导的FUBP1降解,激活c-Myc转录,从而促进M2样巨噬细胞极化。同时,c-Myc作为转录因子,可以与NR_109的启动子结合,增强NR_109的转录。临床上,肿瘤组织CD163+ TAMs中NR_109高表达,与胃癌和乳腺癌患者临床分期不良呈正相关。
结论:本研究首次揭示了NR_109通过NR_109/FUBP1/c-Myc正反馈环在调节M2样巨噬细胞的表型重塑和功能中发挥关键作用。因此,NR_109在癌症的诊断、预后和免疫治疗方面具有巨大的转化潜力。
Fig3. NR_109通过调节M2样巨噬细胞极化来促进肿瘤进展的示意图
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37217247/
04
循环外泌体lncRNA-GC1监测胃癌新辅助化疗反应的早期评估
发表期刊:Int J Surg
影响因子:13.40
发表时间:2023年5月22日
背景:接受新辅助化疗(neoCT)的胃癌(GC)患者的手术时机主要由连续放射影像学指导。然而,早期评估对于避免对无应答者的延迟治疗和对应答者的过度毒性是必不可少的。之前的研究已经确定了循环细胞外囊泡来源的lncRNA-GC1作为早期检测和监测GC进展的生物标志物。然而,人们对neoCT的潜在作用仍然知之甚少。
结果:96.3%的患者在基线时可检测到循环细胞外囊泡来源的lncRNA-GC1,并且在第2周期之前观察到显著降低(P<0.0001)。在neoCT的第一个周期中,循环细胞外囊泡来源的lncRNA-GC1水平与肿瘤负荷的相关性更强,并且表现出比传统胃肠道生物标志物更早的动态变化。在循环细胞外囊泡来源的lncRNA-GC1反应(减少>50%)和放射学反应(Cohen's κ,0.704)之间观察到强烈的一致性。重要的是,循环细胞外囊泡来源的lncRNA-GC1在两个外部队列中保持了预测价值。循环细胞外囊泡来源的lncRNA-GC1应答的患者表现出优越的无病生存期[风险比(HR), 0.6238; 95%CI, 0.4095-0.9501; P=0.0118]和总生存期(HR, 0.6131; 95%CI, 0.4016-0.9358; P=0.0090)。
结论:循环细胞外囊泡来源的lncRNA-GC1是neoCT疗效的早期标志物,并预示着接受neoCT治疗的GC患者的生存率更高。
Fig4. 可切除胃癌患者循环细胞外囊源性lncRNA-GC1的分析
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37222716/
05
Meteor长链非编码RNA位点的不同功能特征介导的Eomes水平的复杂调控
发表期刊:Cell Reports
影响因子:9.995
发表时间:2023年5月30日
长链非编码RNAs(lncRNAs)参与了大量的细胞过程,但目前缺乏对其功能特征或作用机制的深入了解。本研究探索了一种在编码EOMES的基因附近转录的lncRNA Meteor,其中EOMES是一种多效性转录因子,涉及整个发育和成人组织中的各种过程。使用一系列的微扰技术,研究人员发现通过Meteor位点的转录延伸对于小鼠胚胎干细胞中的Eomes激活是必需的,Meteor抑制与准备分化为中胚层谱系的亚群的变化有关。进一步的研究证明,该位点的一个独特的功能特征 - 即潜在的DNA元件 - 是抑制神经元分化后Eomes表达所必需的。本研究结果证明了单个位点可以赋予复杂的调控,并强调了在研究lncRNA位点时仔细选择微扰技术的重要性。
Fig5. Meteor的功能模型
原文链接:
https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(23)00580-6