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lncRNA研究进展盘点丨20230519期
人阅读 发布时间:2023-06-08 09:19
01
BPDE暴露通过上调lnc-HZ14/ZBP1/NLRP3轴促进滋养层细胞焦亡并诱导流产
发表期刊:J Hazard Mater
影响因子:14.22
发表时间:2023年5月6日
环境苯并(a)芘(BaP)及其最终代谢产物BPDE(苯并(a)芘-7,8-二氢二醇-9,10-环氧化物)是典型的持久性有机污染物和内分泌干扰化学物质。BaP/BPDE暴露可能导致人类滋养层细胞功能障碍并诱发流产。然而,潜在的机制在很大程度上仍然未知。本研究发现BPDE暴露通过上调NLRP3/Caspase1/GSDMD途径诱导人滋养层细胞焦亡。研究人员还发现lnc-HZ14在BPDE暴露的滋养层细胞和复发性流产(RM)与健康对照(HC)的绒毛组织中高表达。Lnc-HZ14通过促进IRF1介导的ZBP1转录,增加METTL3介导的m6A对NLRP3 mRNA的甲基化及其稳定性,以及增强ZBP1/NLRP3蛋白相互作用,促进滋养层细胞焦亡。敲低lnc-HZ14/ZBP1/NLRP3轴可有效缓解BPDE诱导的滋养层细胞焦亡。从lnc-HZ14/ZBP1/NLRP3轴的上调可以看出,RM比HC的绒毛组织有更高水平的焦亡。在BaP暴露小鼠模型中,BaP暴露通过上调小鼠Zbp1/Nlrp3轴诱导胎盘组织焦亡和流产,敲低Nlrp3可有效减少胎盘焦亡,缓解BaP诱导的小鼠流产。血清 IL-1β 蛋白水平可作为预测流产风险的一个有希望的指示因子。这些发现为BaP/BPDE诱导的滋养层细胞焦亡和流产提供了新的见解,可能有助于进一步评估BaP/BPDE对雌性生殖的毒理学影响。
Fig1. BPDE暴露通过上调lnc-HZ14/ZBP1/NLRP3轴促进滋养层细胞焦亡并诱导流产的模型示意图
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37167865/
02
探索“黑暗基因组”中的神秘RNAs以征服人类疾病发表期刊:Mol Ther
影响因子:12.91
发表时间:2023年5月10日
新一代测序显示,只有不到2%的转录基因被翻译成蛋白质,很大一部分被转录成非编码RNAs(ncRNAs)。其中,长链非编码RNA(lncRNA)代表最大的一类,并在整个基因组中广泛转录。lncRNAs的功能障碍已经在各种疾病中被发现,突出了它们作为治疗、诊断和预后靶点的潜力。然而,诸如未知的分子机制和非特异性免疫反应以及药物特异性和递送问题等挑战为将lncRNA转化为临床应用带来了障碍。本文总结了最近发表的关于lncRNA在人类疾病中的功能的研究。还讨论了开发lncRNA治疗的挑战和未来方向,旨在弥合功能研究与临床潜力之间的差距,并激发该领域的进一步探索。
Fig2. LncRNA作用机制及其临床应用潜能
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37165619/
03
果蝇触角丰富的非编码RNA景观发表期刊:Cell Rep
影响因子:9.995
发表时间:2023年5月10日
越来越多的证据表明,长链非编码RNAs(lncRNAs)在神经发育、功能和疾病中发挥着多种关键作用。本研究探索了一个模型系统中的神经元lncRNAs,该系统为破译其功能提供了巨大的优势:果蝇嗅觉系统。这个系统在数值上很简单,它的神经元定义得很精致,它驱动着多种复杂的行为。研究人员对果蝇触角中的线性和圆形lncRNAs进行了全面调查,并鉴定了丰富的lncRNAs。研究人员生成了一个新的lncRNA到神经元的图谱,它揭示了嗅觉受体神经元不仅由它们的受体定义,还由它们表达的lncRNAs的组合定义。本研究鉴定了物种特异性lncRNAs,包括许多主要在信息素感知神经元中表达的lncRNAs,它们可能在调节信息素反应或物种形成中起作用。该资源为研究lncRNAs在神经系统中的作用提供了许多新的机会。
Fig3. 研究模型示意图
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37167060/
04
linc01515通过靶向气道上皮细胞中的NRF2来调节PM2.5诱导的氧化应激发表期刊:Environ Pollut
影响因子:9.99
发表时间:2023年5月9日
长链非编码RNA(lncRNA)的失调参与了细颗粒物(PM2.5)引起的不良反应。然而,其分子机制尚未完全阐明。本研究对PM2.5处理的人支气管上皮细胞(HBE)进行了lncRNA测序,以鉴定重要的lncRNA,并通过RT-qPCR验证了rncRNA在HBE和人正常肺上皮细胞(BEAS-2B)中的差异表达。结果发现,暴露于125和250μg/mL PM2.5后,分别有657个和652个lncRNAs失调。其中,lncRNA linc01515在经过PM2.5处理的HBE和BEAS-2B细胞中上调。亚细胞定位实验表明,linc01515主要位于细胞核中。在功能上,研究人员在PM2.5处理前下调了HBE和BEAS-2B细胞中linc01515的表达,这可以降低丙二醛(MDA)和活性氧(ROS)水平,并提高超氧化物歧化酶(SOD)活性。相应地,linc01515过表达增强了PM2.5诱导的气道上皮细胞氧化损伤。机制上,N6-甲基腺苷RNA结合蛋白免疫沉淀(MeRIP)测定表明,PM2.5处理后m6A在linc01515上的富集水平增加,3-脱氮腺苷(DAA)抑制RNA甲基化水平降低了linc01515的表达。Western Blot发现,NRF2(一种重要的转录因子)在linc01515沉默细胞中显著增强,而在linc01515过表达细胞中显著降低。此外,抑制NRF2活性显著挽救了linc01515表达下调对PM2.5诱导的细胞毒性的影响。此外,在PM2.5处理前下调HBE和BEAS-2B细胞中linc01515和NRF2表达时观察到了类似的效果。综上所述,本研究结果表明,PM2.5处理可以通过增强linc01515的m6A修饰来促进其表达,进而调节NRF2以诱导气道上皮细胞的氧化损伤。
Fig4. linc01515通过靶向气道上皮细胞中的NRF2来调节PM2.5诱导的氧化应激的示意图
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37169236/
05
长链非编码RNA KRT7-AS作为一种新的肿瘤抑制因子在肺癌和乳腺癌中抑制肿瘤发生和促进细胞凋亡发表期刊:Cell Death Dis
影响因子:9.71
发表时间:2023年5月9日
长链非编码RNA(lncRNA)keratin-7 antisense(KRT7-AS)的表达在各种类型的癌症中下调;然而,KRT7-AS缺失对肿瘤发生和细胞凋亡的影响尚不清楚。本研究旨在探索KRT7-AS在癌变和细胞凋亡中的影响。结果发现KRT7-AS在乳腺癌和肺癌中缺乏,而低水平的KRT7-AS是乳腺癌的不良预后因素。细胞研究表明,沉默肺癌细胞中的KRT7-AS增加了致癌Keratin-7水平并促进了肿瘤发生,但减少了癌细胞的癌症凋亡;相比之下,KRT7-AS的过表达抑制了肺癌细胞的肿瘤发生。此外,KRT7-AS使癌细胞对抗癌药物顺铂敏感,从而促进癌细胞凋亡。在体内,KRT7-AS过表达显著抑制异种移植小鼠的肿瘤生长,而KRT7-AS的沉默则促进肿瘤生长。机制上,KRT7-AS通过其核心核酸基序GGCAAUGGGGG直接与PTEN蛋白结合,降低了癌细胞中致癌Keratin-7的水平,并显著增加了关键肿瘤抑制因子PTEN的含量。这抑制了PTEN蛋白的泛素化-蛋白酶体降解,从而提高了癌细胞中的PTEN水平。研究人员还发现KRT7-AS基因转录是由转录因子RXRα驱动的;有趣的是,小分子黄连素增强了KRT7-AS的表达,减少了肿瘤发生,并促进了癌细胞的凋亡。总的来说,KRT7-AS在肺癌和乳腺癌中作为一种新的肿瘤抑制因子和细胞凋亡增强因子起作用,揭示了RXRα-KRT7-AS-PTEN信号轴控制癌变和细胞凋亡。本研究结果强调了内源性KRT7-AS在癌症中的肿瘤抑制作用,以及RXRα-KRT7-AS-PTEN轴对控制癌细胞肿瘤发生和凋亡的重要作用,并为开发抗癌新疗法提供了新的平台。
Fig5. KRT7-AS与PTEN结合并保护蛋白不被泛素化系统降解(O)
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37185462/