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miRNA研究进展盘点(20220708)
人阅读 发布时间:2022-07-08 10:51
microRNAs in aged sperm confer psychiatric symptoms to offspring through causing the dysfunction of estradiol signaling in early embryos
年老精子中的microRNAs通过导致早期胚胎中雌二醇信号传导的功能障碍赋予后代精神症状
发表期刊:Cell Discovery
影响因子:38.079
发表时间:2022年7月5日
近几十年来,延迟生育已成为大多数发达国家日益普遍的趋势。这种人口结构的转变也引发了人们对高龄父母对后代健康的潜在不利影响的担忧。事实上,父亲的高龄经常与后代的许多负面精神病学结果有关,包括自闭症、精神分裂症和双相情感障碍,以及智力和学业问题,但其潜在的分子机制仍然是个谜。最近,精子小RNAs(sRNAs)已被确定为导致哺乳动物父系表型(例如精神压力和代谢紊乱)代际遗传的因果载体。本质上,精子能够在受精过程中向卵母细胞传递一系列不同的sRNAs,而遗传的sRNAs在早期胚胎发育过程中利用不同的机制来调节基因调控网络,甚至诱导成年后代的长期行为和生理变化。然而,精子sRNAs是否会受到高龄的敏感影响并有助于后代精神疾病的遗传,目前还知之甚少。本研究发现老年雄性小鼠所生的后代更容易出现精神症状,表现为焦虑水平增加和社交沟通缺陷。进一步的研究表明,将精子sRNAs注射到受精卵中所生的后代会产生与年老父亲所生后代相同的行为异常和精神症状。sRNA深度测序显示许多miRNAs(如miR-9-3p和miR-9-5p)在年老小鼠的精子中显著增加。有趣的是,miR-9-3p和miR-9-5p被证实在来自老年人类供体的精子中显著增加。机制上,年老小鼠精子中的miRNAs通过不恰当地调节早期胚胎中的17β-雌二醇信号传导给后代带来焦虑和社会功能障碍。总体而言,从年老父亲那里遗传的sRNAs可能会在胚胎早期发育过程中不恰当地抑制 GPER1,从而在雌二醇信号传导中留下异常印记并引起级联反应,对神经系统发育产生深远的下游影响,最终导致成年后代出现精神问题的脆弱表型。
原文链接:https://www.nature.com/articles/s41421-022-00414-1#Sec1
miR-181b targets semaphorin 3A to mediate TGF-β-induced endothelial-mesenchymal transition related to atrial fibrillation
miR-181b靶向semaphorin 3A以介导TGF-β诱导的心房颤动相关内皮间质转化
发表期刊:J Clin Invest
影响因子:19.456
发表时间:2022年7月1日
心房纤维化是心房颤动(AF)的重要诱因。目前尚不清楚经历内皮-间质转化(EndMT)的心房心内膜内皮细胞(AEECs)是否是心房成纤维细胞的来源。本研究探索了人类心房、TGF-β处理的人类AEECs、心脏特异性TGF-β转基因小鼠和心力衰竭兔,以确定EndMT在心房纤维化中的潜在机制。使用分离的AEECs,研究人员发现miR-181b在TGF-β处理的AEECs中被诱导,这降低了semaphorin 3A(Sema3A)并增加了EndMT标志物,并且这些作用可以被miR-181b antagomir逆转。在AEECs中,Sema3A通过多肽增加或通过siRNA减少的实验揭示了Sema3A和LIM激酶1/磷酸化cofilin(LIMK/p-cofilin)信号通路之间的机制联系,并表明Sema3A是LIMK通过p-cofilin调控肌动蛋白重构的上游。向TGF-β转基因小鼠施用miR-181b antagomir或重组Sema3A可引起Sema3A增加,EndMT标志物减少,并显著降低心房纤维化和AF易损性。本研究提供了TGF-β通过miR-181b/Sema3A/LIMK/p-cofilin信号通路诱导EndMT与心房纤维化之间的机制联系。阻断miR-181b和增加Sema3A是AF治疗干预的潜在策略。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35775491/
Interpretable Machine Learning Models to Predict the Resistance of Breast Cancer Patients to Doxorubicin from Their microRNA Profiles
可判读的机器学习模型能够根据其microRNA表达谱预测乳腺癌患者对阿霉素的耐药性
发表期刊:Adv Sci (Weinh)
影响因子:17.521
发表时间:2022年7月3日
阿霉素是一种常见的乳腺癌治疗方法。然而,并非所有患者都对这种药物有反应,这有时会导致危及生命的副作用。因此,准确预测阿霉素耐药患者将允许他们避免这种风险,同时立即考虑替代治疗。根据治疗前肿瘤中的分子标记对患者进行分层是实现这一宏伟目标的一种有希望的方法,但单基因基因标记(如HER2表达)尚未显示出足够的预测性。最近在乳腺癌患者中获得了匹配的阿霉素反应和不同的分子图谱,这使得现在可以进行更大规模的分析。在同一队列患者中系统地评估了16个机器学习算法和8个分子图谱。得到的128个结果模型中只有2个具有显著的预测性,这表明它们很容易被标准规模的分析遗漏。The best model是分类和回归树(CART)非线性组合4个选定的miRNA亚型来预测阿霉素反应(中位马修斯相关系数(MCC)和曲线下面积(AUC)分别为0.56和0.80)。相比之下,HER2表达的预测性显著降低(中位MCC和AUC分别为0.14和0.57)。随着更大的训练集,这个CART模型的预测准确性也随着增加,它与未来数据的更新应该会导致更好的准确性。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35785523/
Tumor necrosis factor alpha delivers exogenous inflammation-related microRNAs to recipient cells with functional targeting capabilities
肿瘤坏死因子α将外源性炎症相关microRNAs递送至具有靶向功能的受体细胞
发表期刊:Mol Ther
影响因子:12.910
发表时间:2022年7月4日
肿瘤坏死因子α(TNF-α)是广泛存在于肿瘤和感染性疾病中的一种关键的促炎细胞因子。本研究首次表明TNF-α在体外和体内均可特异性结合某些细胞内或循环炎症相关的microRNAs。TNF-α与microRNAs的结合位点位于TNF-α的N端和microRNAs的3'-GGUU基序。TNF-α可以通过TNF-α受体(TNFRs)将外源性未修饰的单链microRNAs递送到受体细胞中,并稳定其不被细胞中的RNase降解。通过TNF-α递送到HCT116细胞中的外源性miR-146a或let-7c可以从溶酶体中逃逸并特异性下调其靶基因,从而影响体外细胞增殖和迁移,以及体内肿瘤发生。基于上述发现,提出了“非共轭配体介导的RNA递送(ncLMRD)”的概念,这可能成为未来治疗性microRNA递送的一种有前景的策略。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35791880/
MiR-21 regulating PVT1/PTEN/IL-17 axis towards the treatment of infectious diabetic wound healing by modified GO-derived biomaterial in mouse models
MiR-21调节PVT1/PTEN/IL-17轴在小鼠模型中通过改良的氧化石墨烯衍生生物材料治疗感染性糖尿病创面愈合
发表期刊:J Nanobiotechnology
影响因子:9.429
发表时间:2022年6月28日
背景:糖尿病足溃疡(DFU),持续性高血糖和炎症,加上营养和缺氧受损,可在组织损伤后出现异常血管生成,使这些组织无法正常愈合。为DFU患者设计一种新的治疗方法至关重要,该方法具有独特的生物机制,比目前的治疗方案更有效。
结果:本研究发现改良的氧化石墨烯(GO)基创面敷料材料是治疗糖尿病创面的一种有希望的选择。其次,该生物材料可以通过脂肪来源的间充质干细胞(AD-MSCs)增强含有更多miR-21的小EVs(sEVs)的分泌。第三,通过生物信息学分析和测试发现PVT1/PTEN/IL-17轴降低通过修饰miR-21来促进DFU创面愈合。
结论:这些发现有助于制定DFU创伤的临床护理策略。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35764963/
年老精子中的microRNAs通过导致早期胚胎中雌二醇信号传导的功能障碍赋予后代精神症状
发表期刊:Cell Discovery
影响因子:38.079
发表时间:2022年7月5日
近几十年来,延迟生育已成为大多数发达国家日益普遍的趋势。这种人口结构的转变也引发了人们对高龄父母对后代健康的潜在不利影响的担忧。事实上,父亲的高龄经常与后代的许多负面精神病学结果有关,包括自闭症、精神分裂症和双相情感障碍,以及智力和学业问题,但其潜在的分子机制仍然是个谜。最近,精子小RNAs(sRNAs)已被确定为导致哺乳动物父系表型(例如精神压力和代谢紊乱)代际遗传的因果载体。本质上,精子能够在受精过程中向卵母细胞传递一系列不同的sRNAs,而遗传的sRNAs在早期胚胎发育过程中利用不同的机制来调节基因调控网络,甚至诱导成年后代的长期行为和生理变化。然而,精子sRNAs是否会受到高龄的敏感影响并有助于后代精神疾病的遗传,目前还知之甚少。本研究发现老年雄性小鼠所生的后代更容易出现精神症状,表现为焦虑水平增加和社交沟通缺陷。进一步的研究表明,将精子sRNAs注射到受精卵中所生的后代会产生与年老父亲所生后代相同的行为异常和精神症状。sRNA深度测序显示许多miRNAs(如miR-9-3p和miR-9-5p)在年老小鼠的精子中显著增加。有趣的是,miR-9-3p和miR-9-5p被证实在来自老年人类供体的精子中显著增加。机制上,年老小鼠精子中的miRNAs通过不恰当地调节早期胚胎中的17β-雌二醇信号传导给后代带来焦虑和社会功能障碍。总体而言,从年老父亲那里遗传的sRNAs可能会在胚胎早期发育过程中不恰当地抑制 GPER1,从而在雌二醇信号传导中留下异常印记并引起级联反应,对神经系统发育产生深远的下游影响,最终导致成年后代出现精神问题的脆弱表型。
Fig1. 年老小鼠精子中的miRNAs通过不恰当地调节早期胚胎中的17β-雌二醇信号传导给后代带来焦虑和社会功能障碍
原文链接:https://www.nature.com/articles/s41421-022-00414-1#Sec1
miR-181b targets semaphorin 3A to mediate TGF-β-induced endothelial-mesenchymal transition related to atrial fibrillation
miR-181b靶向semaphorin 3A以介导TGF-β诱导的心房颤动相关内皮间质转化
发表期刊:J Clin Invest
影响因子:19.456
发表时间:2022年7月1日
心房纤维化是心房颤动(AF)的重要诱因。目前尚不清楚经历内皮-间质转化(EndMT)的心房心内膜内皮细胞(AEECs)是否是心房成纤维细胞的来源。本研究探索了人类心房、TGF-β处理的人类AEECs、心脏特异性TGF-β转基因小鼠和心力衰竭兔,以确定EndMT在心房纤维化中的潜在机制。使用分离的AEECs,研究人员发现miR-181b在TGF-β处理的AEECs中被诱导,这降低了semaphorin 3A(Sema3A)并增加了EndMT标志物,并且这些作用可以被miR-181b antagomir逆转。在AEECs中,Sema3A通过多肽增加或通过siRNA减少的实验揭示了Sema3A和LIM激酶1/磷酸化cofilin(LIMK/p-cofilin)信号通路之间的机制联系,并表明Sema3A是LIMK通过p-cofilin调控肌动蛋白重构的上游。向TGF-β转基因小鼠施用miR-181b antagomir或重组Sema3A可引起Sema3A增加,EndMT标志物减少,并显著降低心房纤维化和AF易损性。本研究提供了TGF-β通过miR-181b/Sema3A/LIMK/p-cofilin信号通路诱导EndMT与心房纤维化之间的机制联系。阻断miR-181b和增加Sema3A是AF治疗干预的潜在策略。
Fig2. TGF-β诱导的EndMT过程和心房心内膜下纤维化中连接miR-181b和Sema3A的机制示意图
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35775491/
Interpretable Machine Learning Models to Predict the Resistance of Breast Cancer Patients to Doxorubicin from Their microRNA Profiles
可判读的机器学习模型能够根据其microRNA表达谱预测乳腺癌患者对阿霉素的耐药性
发表期刊:Adv Sci (Weinh)
影响因子:17.521
发表时间:2022年7月3日
阿霉素是一种常见的乳腺癌治疗方法。然而,并非所有患者都对这种药物有反应,这有时会导致危及生命的副作用。因此,准确预测阿霉素耐药患者将允许他们避免这种风险,同时立即考虑替代治疗。根据治疗前肿瘤中的分子标记对患者进行分层是实现这一宏伟目标的一种有希望的方法,但单基因基因标记(如HER2表达)尚未显示出足够的预测性。最近在乳腺癌患者中获得了匹配的阿霉素反应和不同的分子图谱,这使得现在可以进行更大规模的分析。在同一队列患者中系统地评估了16个机器学习算法和8个分子图谱。得到的128个结果模型中只有2个具有显著的预测性,这表明它们很容易被标准规模的分析遗漏。The best model是分类和回归树(CART)非线性组合4个选定的miRNA亚型来预测阿霉素反应(中位马修斯相关系数(MCC)和曲线下面积(AUC)分别为0.56和0.80)。相比之下,HER2表达的预测性显著降低(中位MCC和AUC分别为0.14和0.57)。随着更大的训练集,这个CART模型的预测准确性也随着增加,它与未来数据的更新应该会导致更好的准确性。
Fig3. 用于预测患者对阿霉素反应的监督式学习模型的示意图
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35785523/
Tumor necrosis factor alpha delivers exogenous inflammation-related microRNAs to recipient cells with functional targeting capabilities
肿瘤坏死因子α将外源性炎症相关microRNAs递送至具有靶向功能的受体细胞
发表期刊:Mol Ther
影响因子:12.910
发表时间:2022年7月4日
肿瘤坏死因子α(TNF-α)是广泛存在于肿瘤和感染性疾病中的一种关键的促炎细胞因子。本研究首次表明TNF-α在体外和体内均可特异性结合某些细胞内或循环炎症相关的microRNAs。TNF-α与microRNAs的结合位点位于TNF-α的N端和microRNAs的3'-GGUU基序。TNF-α可以通过TNF-α受体(TNFRs)将外源性未修饰的单链microRNAs递送到受体细胞中,并稳定其不被细胞中的RNase降解。通过TNF-α递送到HCT116细胞中的外源性miR-146a或let-7c可以从溶酶体中逃逸并特异性下调其靶基因,从而影响体外细胞增殖和迁移,以及体内肿瘤发生。基于上述发现,提出了“非共轭配体介导的RNA递送(ncLMRD)”的概念,这可能成为未来治疗性microRNA递送的一种有前景的策略。
Fig4. 研究模型示意图
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35791880/
MiR-21 regulating PVT1/PTEN/IL-17 axis towards the treatment of infectious diabetic wound healing by modified GO-derived biomaterial in mouse models
MiR-21调节PVT1/PTEN/IL-17轴在小鼠模型中通过改良的氧化石墨烯衍生生物材料治疗感染性糖尿病创面愈合
发表期刊:J Nanobiotechnology
影响因子:9.429
发表时间:2022年6月28日
背景:糖尿病足溃疡(DFU),持续性高血糖和炎症,加上营养和缺氧受损,可在组织损伤后出现异常血管生成,使这些组织无法正常愈合。为DFU患者设计一种新的治疗方法至关重要,该方法具有独特的生物机制,比目前的治疗方案更有效。
结果:本研究发现改良的氧化石墨烯(GO)基创面敷料材料是治疗糖尿病创面的一种有希望的选择。其次,该生物材料可以通过脂肪来源的间充质干细胞(AD-MSCs)增强含有更多miR-21的小EVs(sEVs)的分泌。第三,通过生物信息学分析和测试发现PVT1/PTEN/IL-17轴降低通过修饰miR-21来促进DFU创面愈合。
结论:这些发现有助于制定DFU创伤的临床护理策略。
Fig5. 温度敏感型PEP@GO及其通过上调ADSC中的miR-21促进糖尿病创面愈合的示意图
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35764963/