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lncRNA研究进展盘点(20220706)
人阅读 发布时间:2022-07-06 09:31
A nerve injury-specific long noncoding RNA promotes neuropathic pain by increasing Ccl2 expression
神经损伤特异性长链非编码RNA通过增加Ccl2表达促进神经性疼痛
发表期刊:J Clin Invest
影响因子:19.456
发表时间:2022年7月1日
背根神经节(DRGs)中神经损伤相关基因的适应不良变化对于神经性疼痛的发生至关重要。新出现的证据支持长链非编码RNAs(lncRNAs)在调节基因转录中的作用。本研究鉴定了一种保守的lncRNA,命名为神经损伤特异性lncRNA(NIS-lncRNA),其在损伤的DRGs中只在响应神经损伤时表达上调。这种上调是由神经损伤诱导的DRG ELF1增加引发的(DRG ELF1是一种与NIS-lncRNA启动子结合的转录因子)。在神经病理性疼痛的发展和维持过程中,阻断这种上调可减轻神经损伤诱导的CCL2在受损DRGs和伤害性超敏反应中的增加。模拟NIS-lncRNA上调提高了CCL2的表达,增加了DRG神经元中CCL2介导的兴奋性,并产生了神经性疼痛症状。机制上,NIS-lncRNA可以招募更多的RNA相互作用蛋白FUS与Ccl2启动子的结合,并增强了受损DRGs中的Ccl2转录。因此,NIS-lncRNA可能通过促进FUS触发的DRG Ccl2表达参与神经性疼痛,并且可能是神经性疼痛管理的潜在靶点。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35775484/
LncRNA EPR-induced METTL7A1 modulates target gene translation
LncRNA EPR诱导的METTL7A1调节靶基因翻译
发表期刊:Nucleic Acids Res
影响因子:19.160
发表时间:2022年6月24日
EPR是一种长链非编码RNA(lncRNA),通过调节基因转录来控制乳腺细胞中的细胞增殖。本研究报道了Mettl7a1作为EPR的直接靶标。研究显示EPR通过在Mettl7a1基因座重新连接三维染色质相互作用来诱导Mettl7a1转录。研究数据表明METTL7A1有助于TGF-β信号传导的EPR依赖性抑制。METTL7A1在致瘤性鼠乳腺细胞中不存在,其人类直系同源物(METTL7A)在乳腺癌中下调。重要的是,在4T1致瘤细胞中重新表达METTL7A1减弱了其转化潜力,假定的METTL7A1的甲基转移酶活性对其生物学功能是可有可无的。研究发现METTL7A1定位于细胞质,通过与参与mRNA翻译早期步骤相关的因子相互作用,与核糖体结合,并在不改变mRNA丰度的情况下影响靶蛋白的水平。总体而言,本研究数据表明METTL7A1-EPR的转录靶标调节了选定转录本的翻译。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35748870/
LncRNA OIP5-AS1-directed miR-7 degradation promotes MYMX production during human myogenesis
LncRNA OIP5-AS1介导的miR-7降解促进人类肌生成过程中MYMX的产生
发表期刊:Nucleic Acids Res
影响因子:19.160
发表时间:2022年6月23日
长链非编码RNAs(lncRNAs)和microRNAs(miRNAs)在生理和疾病中调节基因表达程序。本研究报道了一个非编码RNA调节网络,它调节成肌细胞融合成多核肌管,这一过程发生在损伤后发肌肉发育和肌肉再生过程中。在人类肌生成早期,lncRNA OIP5-AS1水平升高,而miR-7水平下降。此外,OIP5-AS1通过靶标RNA指导的miRNA衰变来结合并诱导miR-7的衰变;因此,OIP5-AS1的缺失减弱了肌管的形成,而拮抗miR-7加速了肌管的形成。研究发现OIP5-AS1介导的miR-7降解促进了成肌细胞融合,因为它解除了对miR-7 靶标 MYMX mRNA(编码融合蛋白myomixer(MYMX))的抑制。值得注意的是,寡核苷酸位点阻断剂干扰了OIP5-AS1介导的miR-7降解,允许miR-7积累,降低MYMX的产生并抑制肌管形成。这些结果强调了一种机制,即lncRNA OIP5-AS1介导的miR-7衰变通过刺激肌源性融合程序促进肌管形成。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35736212/
Molecular Landscape of LncRNAs in Prostate Cancer: A focus on pathways and therapeutic targets for intervention
前列腺癌中LncRNAs的分子图谱:关注干预的途径和治疗靶点
发表期刊:J Exp Clin Cancer Res
影响因子:12.658
发表时间:2022年7月1日
背景:前列腺癌是男性中最恶性的肿瘤之一,由于其异质性和进展性,至今仍然无法治愈。遗传和表观遗传变化在其发展过程中发挥着重要作用。长度超过200个核苷酸的RNA分子被称为lncRNAs,这些表观遗传因子不编码蛋白质。它们在转录、转录后和表观遗传水平上调节基因表达。LncRNAs在细胞和病理事件中发挥重要的生物学功能,因此它们的表达会出现异常调节。
目的:本文旨在强调表观遗传改变在前列腺癌发展中的作用。因此,作者选择了lncRNAs作为研究对象,并检测了它们在前列腺癌进展过程中的表达水平以及与其他信号网络的相互作用。
结果:lncRNAs在前列腺癌中的异常表达已得到充分证明,肿瘤细胞的进展速度通过影响STAT3、NF-κB、Wnt、PI3K/Akt和PTEN等分子途径来调节。此外,lncRNAs还调节前列腺肿瘤细胞的放射抗性和化学抗性特征。HOXD-AS1和CCAT1等促肿瘤lncRNAs的过表达可导致耐药性。此外,lncRNAs可以通过上调PD-1诱导前列腺癌的免疫逃避。槲皮素和姜黄素等药理化合物已被用于靶向lncRNAs。此外,siRNA工具可以减少lncRNAs的表达,从而抑制前列腺癌的进展。临床过程中前列腺肿瘤的预后和诊断可以通过lncRNAs进行评估。外泌体lncRNA(如lncRNA-p21)的表达水平可作为前列腺癌患者血清中可靠的生物标志物。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35773731/
Long Noncoding RNA lncRHL Regulates Hepatic VLDL Secretion by Modulating hnRNPU/ BMAL1/MTTP Axis
长链非编码RNA lncRHL通过调节hnRNPU/ BMAL1/MTTP轴调节肝脏VLDL的分泌
发表期刊:Diabetes
影响因子:9.461
发表时间:2022年6月30日
肝脏极低密度脂蛋白(VLDL)分泌的异常调节有助于代谢疾病的发病机制,例如非酒精性脂肪肝病(NAFLD)和高脂血症。越来越多的证据表明,长链非编码RNAs(lncRNAs)在NAFLD的发病机制中发挥了失常的作用。然而,lncRNAs在控制肝脏VLDL分泌中的作用在很大程度上仍未阐明。本研究鉴定了一种新的长链非编码RNA lncRHL,其在肝脏中富集,在高脂饮食喂养时下调,并在原代肝细胞中被油酸处理抑制。通过对小鼠和原代肝细胞的遗传操纵,lncRHL的缺失可诱导肝脏VLDL分泌,同时肝脏脂质含量降低。相反,lncRHL的恢复减少了VLDL的分泌,肝细胞中脂质沉积增加。机制分析表明,lncRHL直接与异质核核糖核蛋白U(hnRNPU)结合,从而增强其稳定性,并且hnRNPU可以转录激活Bmal1,从而抑制肝细胞中VLDL的分泌。lncRHL缺乏会加速hnRNPU的蛋白质降解并抑制Bmal1的转录,进而激活肝细胞中VLDL的分泌。总之,lncRHL是一种新型的肝脏VLDL分泌抑制剂。激活lncRHL/hnRNPU/Bmal1/MTTP轴代表了一种维持肝内和血浆脂质稳态的潜在策略。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35771993/
神经损伤特异性长链非编码RNA通过增加Ccl2表达促进神经性疼痛
发表期刊:J Clin Invest
影响因子:19.456
发表时间:2022年7月1日
背根神经节(DRGs)中神经损伤相关基因的适应不良变化对于神经性疼痛的发生至关重要。新出现的证据支持长链非编码RNAs(lncRNAs)在调节基因转录中的作用。本研究鉴定了一种保守的lncRNA,命名为神经损伤特异性lncRNA(NIS-lncRNA),其在损伤的DRGs中只在响应神经损伤时表达上调。这种上调是由神经损伤诱导的DRG ELF1增加引发的(DRG ELF1是一种与NIS-lncRNA启动子结合的转录因子)。在神经病理性疼痛的发展和维持过程中,阻断这种上调可减轻神经损伤诱导的CCL2在受损DRGs和伤害性超敏反应中的增加。模拟NIS-lncRNA上调提高了CCL2的表达,增加了DRG神经元中CCL2介导的兴奋性,并产生了神经性疼痛症状。机制上,NIS-lncRNA可以招募更多的RNA相互作用蛋白FUS与Ccl2启动子的结合,并增强了受损DRGs中的Ccl2转录。因此,NIS-lncRNA可能通过促进FUS触发的DRG Ccl2表达参与神经性疼痛,并且可能是神经性疼痛管理的潜在靶点。
Fig1. NIS-lncRNA是FUS触发的受伤DRGs中CCL2表达所必需的
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35775484/
LncRNA EPR-induced METTL7A1 modulates target gene translation
LncRNA EPR诱导的METTL7A1调节靶基因翻译
发表期刊:Nucleic Acids Res
影响因子:19.160
发表时间:2022年6月24日
EPR是一种长链非编码RNA(lncRNA),通过调节基因转录来控制乳腺细胞中的细胞增殖。本研究报道了Mettl7a1作为EPR的直接靶标。研究显示EPR通过在Mettl7a1基因座重新连接三维染色质相互作用来诱导Mettl7a1转录。研究数据表明METTL7A1有助于TGF-β信号传导的EPR依赖性抑制。METTL7A1在致瘤性鼠乳腺细胞中不存在,其人类直系同源物(METTL7A)在乳腺癌中下调。重要的是,在4T1致瘤细胞中重新表达METTL7A1减弱了其转化潜力,假定的METTL7A1的甲基转移酶活性对其生物学功能是可有可无的。研究发现METTL7A1定位于细胞质,通过与参与mRNA翻译早期步骤相关的因子相互作用,与核糖体结合,并在不改变mRNA丰度的情况下影响靶蛋白的水平。总体而言,本研究数据表明METTL7A1-EPR的转录靶标调节了选定转录本的翻译。
Fig2. METTL7A1调节选定基因的翻译
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35748870/
LncRNA OIP5-AS1-directed miR-7 degradation promotes MYMX production during human myogenesis
LncRNA OIP5-AS1介导的miR-7降解促进人类肌生成过程中MYMX的产生
发表期刊:Nucleic Acids Res
影响因子:19.160
发表时间:2022年6月23日
长链非编码RNAs(lncRNAs)和microRNAs(miRNAs)在生理和疾病中调节基因表达程序。本研究报道了一个非编码RNA调节网络,它调节成肌细胞融合成多核肌管,这一过程发生在损伤后发肌肉发育和肌肉再生过程中。在人类肌生成早期,lncRNA OIP5-AS1水平升高,而miR-7水平下降。此外,OIP5-AS1通过靶标RNA指导的miRNA衰变来结合并诱导miR-7的衰变;因此,OIP5-AS1的缺失减弱了肌管的形成,而拮抗miR-7加速了肌管的形成。研究发现OIP5-AS1介导的miR-7降解促进了成肌细胞融合,因为它解除了对miR-7 靶标 MYMX mRNA(编码融合蛋白myomixer(MYMX))的抑制。值得注意的是,寡核苷酸位点阻断剂干扰了OIP5-AS1介导的miR-7降解,允许miR-7积累,降低MYMX的产生并抑制肌管形成。这些结果强调了一种机制,即lncRNA OIP5-AS1介导的miR-7衰变通过刺激肌源性融合程序促进肌管形成。
Fig3. 研究模型示意图
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35736212/
Molecular Landscape of LncRNAs in Prostate Cancer: A focus on pathways and therapeutic targets for intervention
前列腺癌中LncRNAs的分子图谱:关注干预的途径和治疗靶点
发表期刊:J Exp Clin Cancer Res
影响因子:12.658
发表时间:2022年7月1日
背景:前列腺癌是男性中最恶性的肿瘤之一,由于其异质性和进展性,至今仍然无法治愈。遗传和表观遗传变化在其发展过程中发挥着重要作用。长度超过200个核苷酸的RNA分子被称为lncRNAs,这些表观遗传因子不编码蛋白质。它们在转录、转录后和表观遗传水平上调节基因表达。LncRNAs在细胞和病理事件中发挥重要的生物学功能,因此它们的表达会出现异常调节。
目的:本文旨在强调表观遗传改变在前列腺癌发展中的作用。因此,作者选择了lncRNAs作为研究对象,并检测了它们在前列腺癌进展过程中的表达水平以及与其他信号网络的相互作用。
结果:lncRNAs在前列腺癌中的异常表达已得到充分证明,肿瘤细胞的进展速度通过影响STAT3、NF-κB、Wnt、PI3K/Akt和PTEN等分子途径来调节。此外,lncRNAs还调节前列腺肿瘤细胞的放射抗性和化学抗性特征。HOXD-AS1和CCAT1等促肿瘤lncRNAs的过表达可导致耐药性。此外,lncRNAs可以通过上调PD-1诱导前列腺癌的免疫逃避。槲皮素和姜黄素等药理化合物已被用于靶向lncRNAs。此外,siRNA工具可以减少lncRNAs的表达,从而抑制前列腺癌的进展。临床过程中前列腺肿瘤的预后和诊断可以通过lncRNAs进行评估。外泌体lncRNA(如lncRNA-p21)的表达水平可作为前列腺癌患者血清中可靠的生物标志物。
Fig4. 前列腺癌中lncRNAs的治疗靶向
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35773731/
Long Noncoding RNA lncRHL Regulates Hepatic VLDL Secretion by Modulating hnRNPU/ BMAL1/MTTP Axis
长链非编码RNA lncRHL通过调节hnRNPU/ BMAL1/MTTP轴调节肝脏VLDL的分泌
发表期刊:Diabetes
影响因子:9.461
发表时间:2022年6月30日
肝脏极低密度脂蛋白(VLDL)分泌的异常调节有助于代谢疾病的发病机制,例如非酒精性脂肪肝病(NAFLD)和高脂血症。越来越多的证据表明,长链非编码RNAs(lncRNAs)在NAFLD的发病机制中发挥了失常的作用。然而,lncRNAs在控制肝脏VLDL分泌中的作用在很大程度上仍未阐明。本研究鉴定了一种新的长链非编码RNA lncRHL,其在肝脏中富集,在高脂饮食喂养时下调,并在原代肝细胞中被油酸处理抑制。通过对小鼠和原代肝细胞的遗传操纵,lncRHL的缺失可诱导肝脏VLDL分泌,同时肝脏脂质含量降低。相反,lncRHL的恢复减少了VLDL的分泌,肝细胞中脂质沉积增加。机制分析表明,lncRHL直接与异质核核糖核蛋白U(hnRNPU)结合,从而增强其稳定性,并且hnRNPU可以转录激活Bmal1,从而抑制肝细胞中VLDL的分泌。lncRHL缺乏会加速hnRNPU的蛋白质降解并抑制Bmal1的转录,进而激活肝细胞中VLDL的分泌。总之,lncRHL是一种新型的肝脏VLDL分泌抑制剂。激活lncRHL/hnRNPU/Bmal1/MTTP轴代表了一种维持肝内和血浆脂质稳态的潜在策略。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35771993/