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miRNA研究进展盘点(20220620)
人阅读 发布时间:2022-06-20 10:48
MiR-690 treatment causes decreased fibrosis and steatosis and restores specific Kupffer cell functions in NASH
MiR-690治疗可减少NASH中的纤维化和脂肪变性并恢复特定的Kupffer细胞功能
发表期刊:Cell Metab
影响因子:27.287
发表时间:2022年6月4日
非酒精性脂肪性肝炎(NASH)是一种具有显著发病率的肝脏疾病。Kupffer细胞(KCs)产生内源性miR-690,并通过外泌体分泌将该miRNA运送到其他肝细胞,例如肝细胞、募集的肝巨噬细胞(RHMs)和肝星状细胞(HSCs)。miR-690直接抑制HSCs中的纤维发生、RHMs中的炎症和肝细胞中的从头脂肪生成。当miR-690 mimic被注射到NASH小鼠体内时,NASH表型的所有特征都受到强烈抑制。在NASH的发展过程中,KCs发生miR-690缺失,并且小鼠和人类NASH肝脏中的miR-690水平明显低于对照组。miR-690的KC特异性KO促进NASH发病机制。miR-690的一个主要靶点是NADK mRNA,NADK水平与细胞中的miR-690含量成反比。这些研究表明,KCs在NASH的病因学中发挥核心作用,并提出了miR-690作为NASH治疗手段的可能性。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35700738/
Control of CRK-RAC1 activity by the miR-1/206/133 miRNA family is essential for neuromuscular junction function
miR-1/206/133 miRNA家族控制CRK-RAC1活性对神经肌肉接头功能至关重要
发表期刊:Nat Commun
影响因子:14.919
发表时间:2022年6月8日
神经肌肉接头(NMJs)的形成和维持对骨骼肌功能至关重要,允许自主运动和维持肌张力,从而防止萎缩。NMJs的产生依赖于运动神经元与骨骼肌纤维的相互作用,这引发了一系列调节事件,这对于肌膜特定部位的乙酰胆碱受体(AChR)簇的形成至关重要。本研究表明miR-1/206/133家族的肌肉特异性miRNAs是包含DOK7-CRK-RAC1的信号级联的关键调节因子,这对于NMJ发育和维持期间突触后AChRs的稳定和锚定至关重要。研究发现miR-1/206/133对CRK的转录后抑制对于RAC1的平衡激活至关重要。RAC1活性调整失败会严重损害NMJ功能,导致新生儿呼吸衰竭和成年小鼠出现神经肌肉症状。本研究结果表明,miR-1/206/133对NMJ具有特定的功能,但对骨骼肌发育是非必要的。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35676269/
The microRNA cluster C19MC confers differentiation potential into trophoblast lineages upon human pluripotent stem cells
microRNA簇C19MC赋予人类多能干细胞向滋养层谱系分化的潜能
发表期刊:Nat Commun
影响因子:14.919
发表时间:2022年6月2日
哺乳动物发育过程中的第一个细胞命运定型是内细胞团和滋养外胚层的确定。这种不可逆的细胞命运定型应该受到表观遗传调控,但在人类中确切的机制很大程度上是未知的。本研究发现naïve hES(人类胚胎干细胞)可以转分化为hTS(滋养层干细胞),但primed hES细胞不能。转录组和甲基化组分析表明,灵长类动物特异性19号染色体上的miRNA簇(C19MC)在naïve hES细胞中是活跃的,但在primed hES细胞中表观遗传沉默。此外,使用CRISPR/Cas系统进行的基因组和表观基因组编辑表明,C19MC对hTS细胞的维持至关重要,而C19MC重新激活的primed hES 细胞可以产生hTS细胞。因此,我本研究揭示了C19MC激活赋予hES细胞向滋养层谱系分化的潜能。本研究结果对于理解人类早期发育和多能性的表观遗传调控至关重要。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35654791/
5'isomiR-183-5p|+2 elicits tumor suppressor activity in a negative feedback loop with E2F1
5'isomiR-183-5p|+2在E2F1的负反馈回路中引发肿瘤抑制活性
发表期刊:J Exp Clin Cancer Res
影响因子:11.161
发表时间:2022年6月2日
背景:MicroRNAs(miRNAs)和isomiRs作为基因表达的重要调节因子在肿瘤发生中发挥重要作用。与经典miRNA相比,5' isomiR表现出种子序列的偏移,导致不同的靶标范围,从而扩展了各自常见的pre-miRNA的表型影响。然而,对于大多数miRNAs,5'isomiRs的表达和功能尚未得到详细研究。因此,本研究旨在研究miRNAs及其5'isomiRs的功能。
结果:TCGA乳腺癌患者数据表明miR-183-5p的三个变体(即miR-183-5p|0、miR-183-5p|+1和miR-183-5p|+2)高表达并上调。然而,TNBC细胞系在pre-miR-183过表达后显示出增殖和侵袭减少。虽然所有三个isomiRs均可单降低侵袭能力,但过表达miR-183-5p|+2特异性地抑制了增殖和细胞周期进程。蛋白质组学分析显示,在这种isomiR过表达后,E2F靶基因的表达降低,这可能与miR-183-5p|+2直接靶向E2F1有关。E2F1的敲低部分地表型复制了miR-183-5p|+2过表达对细胞增殖和细胞周期的影响。TCGA和METABRIC患者数据的基因集富集分析表明,E2F的活性与miR-183-5p的表达密切相关,表明E2F家族的一个因子对miRNA的转录调控。事实上,在体外,miR-183-5p的表达受E2F1的调节。因此,直接靶向E2F1的miR-183-5p|+2似乎是负反馈回路的一部分,可能会微调其活性。
结论:本研究表明,源自相同pre-miRNA(即 pre-miR-183-5p)的同一臂的5'isomiR可能表现出不同的功能,从而共同促成相同的表型。在这里,三种isomiR中的一种被证明可以通过负调节转录激活因子(即E2F1)来抵消pre-miRNA的表达。研究人员推测这可能是防止不受控制的细胞增殖的调节机制的一部分,而不受控制的细胞增殖在癌症进展过程中被禁用。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35655310/
miR143-3p-Mediated NRG-1-Dependent Mitochondrial Dysfunction Contributes to Olanzapine Resistance in Refractory Schizophrenia
miR143-3p介导的NRG-1依赖性线粒体功能障碍导致难治性精神分裂症中的奥氮平耐药
发表期刊:Biol Psychiatry
影响因子:13.382
发表时间:2022年5月26日
背景:奥氮平是治疗难治性精神分裂症(TRS)的有效抗精神病药物;然而,已发现奥氮平的治疗效果因患者而异。当务之急是揭示其耐药机制,并找到可靠的靶点,以开发新的精确治疗策略。
结果:Neuregulin-1(NRG-1)缺失诱导的线粒体功能障碍与TRS中的奥氮平治疗结果相关。NRG-1基因敲除小鼠表现出与精神分裂症相关的行为缺陷并产生奥氮平耐药性。值得注意的是,miR143-3p是一个与线粒体功能障碍相关的关键NRG-1靶标,神经干细胞中的miR143-3p水平与TRS中奥氮平耐药的严重程度相关。同时,通过脑内注射miR143-3p agomir治疗可以挽救NRG-1敲除小鼠对奥氮平的耐药性。
结论:本研究结果为NRG-1缺陷引起的线粒体功能障碍导致奥氮平耐药提供了直接证据,将奥氮平耐药和NRG-1缺陷引起的线粒体功能障碍与NRG-1/miR143-3p轴联系起来,这构成了一个新的TRS生物标志物和靶点。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35662508/
MiR-690治疗可减少NASH中的纤维化和脂肪变性并恢复特定的Kupffer细胞功能
发表期刊:Cell Metab
影响因子:27.287
发表时间:2022年6月4日
非酒精性脂肪性肝炎(NASH)是一种具有显著发病率的肝脏疾病。Kupffer细胞(KCs)产生内源性miR-690,并通过外泌体分泌将该miRNA运送到其他肝细胞,例如肝细胞、募集的肝巨噬细胞(RHMs)和肝星状细胞(HSCs)。miR-690直接抑制HSCs中的纤维发生、RHMs中的炎症和肝细胞中的从头脂肪生成。当miR-690 mimic被注射到NASH小鼠体内时,NASH表型的所有特征都受到强烈抑制。在NASH的发展过程中,KCs发生miR-690缺失,并且小鼠和人类NASH肝脏中的miR-690水平明显低于对照组。miR-690的KC特异性KO促进NASH发病机制。miR-690的一个主要靶点是NADK mRNA,NADK水平与细胞中的miR-690含量成反比。这些研究表明,KCs在NASH的病因学中发挥核心作用,并提出了miR-690作为NASH治疗手段的可能性。
Fig1. MiR-690治疗减少NASH中的纤维化和脂肪变性并恢复特定的Kupffer细胞功能的模型图
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35700738/
Control of CRK-RAC1 activity by the miR-1/206/133 miRNA family is essential for neuromuscular junction function
miR-1/206/133 miRNA家族控制CRK-RAC1活性对神经肌肉接头功能至关重要
发表期刊:Nat Commun
影响因子:14.919
发表时间:2022年6月8日
神经肌肉接头(NMJs)的形成和维持对骨骼肌功能至关重要,允许自主运动和维持肌张力,从而防止萎缩。NMJs的产生依赖于运动神经元与骨骼肌纤维的相互作用,这引发了一系列调节事件,这对于肌膜特定部位的乙酰胆碱受体(AChR)簇的形成至关重要。本研究表明miR-1/206/133家族的肌肉特异性miRNAs是包含DOK7-CRK-RAC1的信号级联的关键调节因子,这对于NMJ发育和维持期间突触后AChRs的稳定和锚定至关重要。研究发现miR-1/206/133对CRK的转录后抑制对于RAC1的平衡激活至关重要。RAC1活性调整失败会严重损害NMJ功能,导致新生儿呼吸衰竭和成年小鼠出现神经肌肉症状。本研究结果表明,miR-1/206/133对NMJ具有特定的功能,但对骨骼肌发育是非必要的。
Fig2. miR-1/206/133 miRNA家族对CRK-RAC1活性的调节对神经肌肉接头功能至关重要
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35676269/
The microRNA cluster C19MC confers differentiation potential into trophoblast lineages upon human pluripotent stem cells
microRNA簇C19MC赋予人类多能干细胞向滋养层谱系分化的潜能
发表期刊:Nat Commun
影响因子:14.919
发表时间:2022年6月2日
哺乳动物发育过程中的第一个细胞命运定型是内细胞团和滋养外胚层的确定。这种不可逆的细胞命运定型应该受到表观遗传调控,但在人类中确切的机制很大程度上是未知的。本研究发现naïve hES(人类胚胎干细胞)可以转分化为hTS(滋养层干细胞),但primed hES细胞不能。转录组和甲基化组分析表明,灵长类动物特异性19号染色体上的miRNA簇(C19MC)在naïve hES细胞中是活跃的,但在primed hES细胞中表观遗传沉默。此外,使用CRISPR/Cas系统进行的基因组和表观基因组编辑表明,C19MC对hTS细胞的维持至关重要,而C19MC重新激活的primed hES 细胞可以产生hTS细胞。因此,我本研究揭示了C19MC激活赋予hES细胞向滋养层谱系分化的潜能。本研究结果对于理解人类早期发育和多能性的表观遗传调控至关重要。
Fig3. hTSL细胞的分离和特征总结
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35654791/
5'isomiR-183-5p|+2 elicits tumor suppressor activity in a negative feedback loop with E2F1
5'isomiR-183-5p|+2在E2F1的负反馈回路中引发肿瘤抑制活性
发表期刊:J Exp Clin Cancer Res
影响因子:11.161
发表时间:2022年6月2日
背景:MicroRNAs(miRNAs)和isomiRs作为基因表达的重要调节因子在肿瘤发生中发挥重要作用。与经典miRNA相比,5' isomiR表现出种子序列的偏移,导致不同的靶标范围,从而扩展了各自常见的pre-miRNA的表型影响。然而,对于大多数miRNAs,5'isomiRs的表达和功能尚未得到详细研究。因此,本研究旨在研究miRNAs及其5'isomiRs的功能。
结果:TCGA乳腺癌患者数据表明miR-183-5p的三个变体(即miR-183-5p|0、miR-183-5p|+1和miR-183-5p|+2)高表达并上调。然而,TNBC细胞系在pre-miR-183过表达后显示出增殖和侵袭减少。虽然所有三个isomiRs均可单降低侵袭能力,但过表达miR-183-5p|+2特异性地抑制了增殖和细胞周期进程。蛋白质组学分析显示,在这种isomiR过表达后,E2F靶基因的表达降低,这可能与miR-183-5p|+2直接靶向E2F1有关。E2F1的敲低部分地表型复制了miR-183-5p|+2过表达对细胞增殖和细胞周期的影响。TCGA和METABRIC患者数据的基因集富集分析表明,E2F的活性与miR-183-5p的表达密切相关,表明E2F家族的一个因子对miRNA的转录调控。事实上,在体外,miR-183-5p的表达受E2F1的调节。因此,直接靶向E2F1的miR-183-5p|+2似乎是负反馈回路的一部分,可能会微调其活性。
结论:本研究表明,源自相同pre-miRNA(即 pre-miR-183-5p)的同一臂的5'isomiR可能表现出不同的功能,从而共同促成相同的表型。在这里,三种isomiR中的一种被证明可以通过负调节转录激活因子(即E2F1)来抵消pre-miRNA的表达。研究人员推测这可能是防止不受控制的细胞增殖的调节机制的一部分,而不受控制的细胞增殖在癌症进展过程中被禁用。
Fig4. 5'isomiR-183-5p|+2在E2F1的负反馈回路中引发肿瘤抑制活性的模型示意图
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35655310/
miR143-3p-Mediated NRG-1-Dependent Mitochondrial Dysfunction Contributes to Olanzapine Resistance in Refractory Schizophrenia
miR143-3p介导的NRG-1依赖性线粒体功能障碍导致难治性精神分裂症中的奥氮平耐药
发表期刊:Biol Psychiatry
影响因子:13.382
发表时间:2022年5月26日
背景:奥氮平是治疗难治性精神分裂症(TRS)的有效抗精神病药物;然而,已发现奥氮平的治疗效果因患者而异。当务之急是揭示其耐药机制,并找到可靠的靶点,以开发新的精确治疗策略。
结果:Neuregulin-1(NRG-1)缺失诱导的线粒体功能障碍与TRS中的奥氮平治疗结果相关。NRG-1基因敲除小鼠表现出与精神分裂症相关的行为缺陷并产生奥氮平耐药性。值得注意的是,miR143-3p是一个与线粒体功能障碍相关的关键NRG-1靶标,神经干细胞中的miR143-3p水平与TRS中奥氮平耐药的严重程度相关。同时,通过脑内注射miR143-3p agomir治疗可以挽救NRG-1敲除小鼠对奥氮平的耐药性。
结论:本研究结果为NRG-1缺陷引起的线粒体功能障碍导致奥氮平耐药提供了直接证据,将奥氮平耐药和NRG-1缺陷引起的线粒体功能障碍与NRG-1/miR143-3p轴联系起来,这构成了一个新的TRS生物标志物和靶点。
Fig5. 通过使用体内和体外SCZ建模方法分析来自TRS患者的NSCs和功能评估的步骤
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35662508/