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锐博生物总部位于广州市黄埔区广州开发区,是一家以核酸技术为核心,为基因功能、细胞生物学及药物研究提供产品与技术服务,以一体化核酸药 CDMO 服务为主导,致力于让新一代核酸药从概念走向商业化的国家火炬计划重点高新技术企业,是中国核酸行业的领军企业之一,拥有国家级博士后科研工作站。公司立足于基础生命科学与医学研究,创始人由国家重大人才工程入选者和诺贝尔生理/医学奖获得者领衔,以国际化视野和技术平台实力,提供高品质的寡核酸 Oligo 合成修饰、CRISPR-Cas9、RNAi、非编码 RNA、细胞分析、外泌体提取、DNA 提取、PCR 扩增、qRT-PCR 试剂盒及引物等,提供高内涵细胞成像及筛选、载体构建、动物实验、高通量测序、生信分析、RNA 体外转录、外泌体检测、qPCR 检测等技术服务,提供闻名业界的核酸药 GMP 生产 CDMO 服务。通过跨学科、多平台、上下游贯通的综合技术优势,赢得了国内外客户的信赖和赞誉。公司申请专利71项,其中已授权专利 21 项。“锐博生物RiboBio”是中国高品质核酸产品代名词之一,为国内外超过 5000 家机构提供产品或服务,客户 SCI 文章累计超过 25,000 多篇,合作客户包括诺贝尔奖得主实验室、知名科研机构和全球制药公司,锐博生物是亚洲知名的寡核酸原料药生产企业之一,2016年获得中国药监局颁发的寡核酸原料药生产许可证,现已跻身于全球核酸药 CDMO 的知名企业行列。锐博生物建立了与国际接轨的大规模cGMP生产基地,正在打造国际领先的大规模寡核酸 CMO 基地。锐博生物推动国内外核酸科学与技术的交流与合作,连续多年承办代表行业风向标的中国核酸国际论坛(CNAF)和非编码RNA与表观遗传学研究交流会,获批建立国家级博士后科研工作站,承担多项国家及省市重点科研项目。锐博生物致力于提供国际一流的核酸产品与服务,构建国际一流的合作平台与伙伴关系,培养国际一流的智慧型创新人才,为不断满足未来生命科学与医学研究及转化的需求而贡献力量。公司秉承“以创新求发展,以品质铸未来,以诚信待客户”的发展理念,追求“创新永不停”!
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Nature子刊丨南医大团队揭示tRF3-IleAAT减少DKD小鼠ECM合成的分子机制

人阅读 发布时间:2024-02-07 09:34

众所周知,系膜细胞中细胞外基质(ECM)的合成是糖尿病肾病(DKD)的主要决定因素。阐明ECM合成中的主要参与者可能有助于为防止DKD进展提供有希望的候选药物。tRF3-IleAAT是由tRNA特异性位点的核酸酶产生的tRNA衍生的片段(tRF),在糖尿病和DKD患者的血清中差异表达。近日,Acta Pharmacologica Sinica期刊发表了一篇题为tRF3-IleAAT reduced extracellular matrix synthesis in diabetic kidney disease mice by targeting ZNF281 and inhibiting ferroptosis的研究论文。该研究报道了tRFs在DKD中的潜在作用,揭示了tRF3-IleAAT通过靶向ZNF281抑制铁死亡,从而减缓DKD模型中ECM合成的作用机制,表明tRF3-IleAAT可能是一个有吸引力的DKD治疗靶点。

 

 

之前的测序结果显示,tRF3-IleAAT在DKD患者血清中的表达显著降低,进一步的功能分析表明,细胞死亡和能量代谢与tRF3-IleAAT有关。在本研究中,研究人员将12周的Db/Db小鼠改编为DKD模型,并首先验证了db/db小鼠中tRF3-IleAAT的下调。此外,db/db小鼠在20周龄时的尿蛋白和sCr水平显著更高,肾脏组织病理形态异常,肾小球系膜间质增多且明显扩张,间质胶原沉积增多,纤维化增多。进一步的研究发现,在db/db小鼠肾小球中,ECM成分FN的荧光明显增强,且与ECM合成相关的FN和Col I的表达在db/db组中显著更高。另外,在高糖(HG)处理的小鼠肾小球系膜细胞中也观察到tRF3-IleAAT的表达降低,且FN和Col I在HG处理组中的表达明显高于对照组。

 

Fig1. tRF3-IleAAT在DKD模型中下调

 

接着,研究人员评估了tRF3-IleAAT在db/db小鼠ECM合成中的作用。结果显示,在db/db小鼠中过表达tRF3-IleAAT导致sCr和24h尿蛋白水平有所降低,胶原沉积面积减少,结合PAS染色,这一发现表明肾小球扩张和纤维化减少。此外,过表达tRF3-IleAAT导致FN荧光强度减弱,FN和Col I的mRNA和蛋白水平明显低于对照组。为了阐明tRF3-IleAAT对ECM合成的影响,研究人员使用tRF mimic在体外过表达tRF3-IleAAT。结果显示,HG+tRF3-IleAAT mimic组FN和Col I的mRNA和蛋白表达水平显著低于对照组。表明tRF3-IleAAT过表达可减轻DKD模型中ECM的合成。

 

Fig2. tRF3-IleAAT过表达可减轻DKD模型中ECM的合成

 

在之前的研究中,KEGG分析显示tRF3-IleAAT功能在铁死亡相关信号通路中高度富集。为了探讨铁死亡在DKD中的作用,研究人员检测小鼠中铁死亡相关指示因子的表达水平。结果显示,db/db组小鼠肾组织中ACSL4的表达显著升高,GPX4和SLC7A11的表达显著降低,证实了铁死亡的发生。而使用铁死亡抑制剂Fer-1处理则导致ACSL4的表达显著更低,GPX4和SLC7A11的表达显著更高。此外,Fer-1处理导致小鼠24h尿蛋白和sCr水平显著降低,胶原沉积减少,肾小球扩张水平降低,纤维化减少,FN的荧光强度减弱,且肾脏FN和Col I的表达水平明显低于对照组。细胞实验也得到类似的结果,证实了铁死亡是ECM合成的关键因素。以上结果表明,抑制铁死亡可减轻体内和体外ECM的合成。

 

Fig3. 抑制铁死亡可减轻体内和体外ECM的合成

 

鉴于tRF3-IleAAT过表达和铁死亡的抑制均可减少DKD中ECM的合成,研究人员假设tRF3-IleAAT可能抑制铁死亡以减少ECM合成。接下来,研究人员评估了tRF3-IleAAT在db/db小鼠铁死亡发病中的作用。结果发现,tRF3-IleAAT过表达导致GPX4和SLC7A11表达显著更高,ACSL4表达显著更低,并导致GSH水平显著升高。体外实验显示,tRF3-IleAAT过表达导致铁死亡相关指示因子的表达发生显著改变,ROS水平有一定程度的降低。此外,用tRF3-IleAAT mimic处理后,系膜细胞的线粒体嵴变得清晰可见,并且缓解了萎缩和膜密度增加等形态变化。GSH检测结果显示,tRF3-IleAAT过表达导致GSH水平显著高于对照组,而Fe2+和MDA水平趋于较低,进一步证实了tRF3-IleAAT对DKD模型铁死亡的抑制作用。

 

Fig4. tRF3-IleAAT过表达缓解DKD模型中的铁死亡

 

接下来,研究人员探讨了tRF3-IleAAT减少DKD小鼠和HG处理系膜细胞ECM合成并抑制铁死亡的可能机制。首先,研究人员预测了tRF3-IleAAT的下游靶基因,揭示了26个靶基因,其中ZNF281的靶基因评分最高,极有可能参与组织细胞纤维化和炎症。进一步的研究发现,ZNF281在db/db小鼠中表达显著升高。免疫组化分析显示,ZNF281在db/db小鼠肾组织中高表达。接着,研究人员假设tRF3-IleAAT可能靶向ZNF281并减弱铁死亡。为了验证这一点,研究人员使用ZNF281 siRNA敲低ZNF281的表达。结果表明,敲低ZNF281 导致ACSL4、FN和Col I的表达显著降低,GPX4和SLC7A11的表达显著升高。此外,敲低ZNF281导致GSH水平较高,进一步阐明了ZNF281与铁死亡之间的相关性。

 

Fig5. 敲低tRF3-IleAAT下游靶基因ZNF281可缓解HG诱导的系膜细胞中的铁死亡

 

最后,为了进一步阐明tRF3-IleAAT与靶基因ZNF281之间的相互作用,研究人员检测了DKD模型中过表达tRF3-IleAAT后ZNF281表达的变化,以评估tRF3-IleAAT对基因表达水平的影响。结果显示,过表达tRF3-IleAAT导致ZNF281表达显著更低。结合位点预测分析显示,tRF3-IleAAT与ZNF281的3'UTR碱基完全互补,序列保守。双荧光素酶报告基因实验进一步证实了tRF3-IleAAT与ZNF281基因3'UTR的靶向结合。此外,tRF3-IleAAT mimic和ZNF281质粒共转染在很大程度上抵消了tRF3-IleAAT对铁死亡和ECM合成的抑制作用,GPX4、SLC7A11、ACSL4、FN和Col I水平的显著改变证明了这一点。以上结果表明,tRF3-IleAAT可能通过直接靶向DKD中的ZNF281抑制铁死亡和ECM合成。

 

Fig6. tRF3-IleAAT直接靶向ZNF281并负调控其表达

 

总之,本研究阐明了tRF3-IleAAT在DKD动物模型和HG处理的系膜细胞中的作用和机制。提出了tRF3-IleAAT通过降低ZNF281的表达来抑制铁死亡,从而减少系膜细胞中的ECM合成并延缓DKD的进展。然而,锌指蛋白在铁死亡中的作用机制值得进一步深入研究。此外,研究人员希望能够在后续研究中确定ZNF281在动物模型中调节DKD发展的方式。本研究从tRFs和铁死亡的角度对DKD的分子机制提供了新的见解,为DKD的临床诊断和治疗提供了理论依据。



 

原文链接:

https://www.nature.com/articles/s41401-024-01228-5





 

本研究使用到的tRF mimic及NC、siRNA及NC、转染试剂、mRNA过表达质粒、双荧光素酶报告基因载体均由锐博生物提供!锐博生物可提供tRF表达筛选、细胞功能缺失性/获得性实验、细胞分析、机制研究、动物实验一站式核酸产品或服务!更多关于lncRNA研究产品或服务详情,欢迎登陆锐博生物官方网站(www.ribobio.com)进行查询!







 

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