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lncRNA研究进展盘点丨20231215期
人阅读 发布时间:2023-12-21 16:21
01
LncRNA PSMB8-AS1诱发血管炎症以加重动脉粥样硬化
发表期刊:Circ Res
影响因子:20.1
发表时间:2023年12月12日
背景:越来越多的证据表明,长链非编码RNAs在血管生物学和疾病发展中起着重要作用。其中一种长链非编码RNA PSMB8-AS1与肿瘤的发展有关。然而,PSMB8-AS1在心血管疾病,特别是动脉粥样硬化中的确切作用尚未完全阐明。因此,本研究的主要目的是评估PSMB8-AS1对血管炎症和动脉粥样硬化起始的影响。
结果:长链非编码RNA PSMB8-AS1在人动脉粥样硬化斑块中显著升高。引人注目的是,与Apoe-/-小鼠相比,Apoe-/-PSMB8-AS1KI小鼠表现出动脉粥样硬化发展、斑块易损性和血管炎症的增加。此外,在Apoe-/-PSMB8-AS1KI小鼠的动脉粥样硬化病变和血清中,VCAM1(血管粘附分子1)和ICAM1(细胞内粘附分子1)的水平显著上调。一致的,体外功能获得性和缺失性研究表明,PSMB8-AS1诱导单核细胞/巨噬细胞粘附到内皮细胞上,并以PSMB9依赖性方式增加VCAM1和ICAM1水平。机制研究表明,PSMB8-AS1通过募集转录因子NONO(non-POU结构域八聚体结合蛋白)并与PSMB9启动子结合来诱导PSMB9转录。PSMB9(蛋白酶体亚基-β型9)通过上调ZEB1(锌指E-box结合同源盒1)增加VCAM1和ICAM1表达。Psmb9缺失降低了Apoe-/-小鼠体内动脉粥样硬化病变大小、斑块易损性和血管炎症。重要的是,通过敲除Psmb9可减弱PSMB8-AS1的内皮过表达增加的动脉粥样硬化和血管炎症。
结论:PSMB8-AS1通过NONO/PSMB9/ZEB1轴促进血管炎症和动脉粥样硬化。本研究结果支持开发新的基于长链非编码RNA的策略来对抗动脉粥样硬化性心血管疾病。
Fig1. 研究模型示意图
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38084631/
02
长链非编码RNA HOTAIR有助于类风湿性关节炎的关节特异性基因表达
发表期刊:Nat Commun
影响因子:16.6
发表时间:2023年12月9日
尽管类风湿性关节炎(RA)患者通常表现出对称性关节受累,但一些患者在治疗后会出现其他疾病模式,这表明不同的分子机制可能是疾病进展的基础,具体取决于关节的位置。本研究确定了膝关节和手部关节之间RA滑膜和滑膜成纤维细胞(SF)的关节特异性变化。结果发现,仅在膝关节SF中表达的长链非编码RNA HOTAIR在SF中调节了该位点特异性基因表达的50%以上。与骨关节炎相比,HOTAIR在用促炎细胞因子刺激后下调,并且在RA患者的膝关节样本中表达水平较低。敲低膝关节SF中的HOTAIR会增加PI-Akt信号和IL-6的产生,但会降低Wnt信号。沉默HOTAIR可抑制SF的迁移功能,减少SF介导的破骨细胞生成,并增加SF对B细胞的募集。本研究认为HOTAIR是RA关节特异性基因表达的重要表观遗传因子。
Fig2. HOTAIR改变滑膜成纤维细胞中位点特异性基因的表达
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38071204/
03
LncRNA MIR200CHG通过稳定miR-200c免受靶标指导的miRNA降解来抑制胃癌的EMT
发表期刊:Nat Commun
影响因子:16.6
发表时间:2023年12月8日
胃癌(GC)是一种异质性疾病,威胁着全球数百万人的生命,但长链非编码RNAs(lncRNAs)在不同GC亚型中的功能作用仍未得到充分表征。微卫星稳定(MSS)/上皮-间充质转化(EMT)GC是与预后不良相关的最具侵袭性的亚型。本研究应用综合网络分析来揭示GC亚型之间的lncRNA异质性,并将MIR200CHG确定为MSS/EMT GC中特异性介导EMT的主调节因子。在MSS/EMT GC中,MIR200CHG的表达因启动子超甲基化而被沉默,与预后不良相关。MIR200CHG在体外逆转GC细胞的间充质特性,在体内抑制GC细胞转移。机制上,MIR200CHG不仅促进其内含子miRNAs miR-200c和miR-141的生物发生,而且还通过直接与miR-200c结合来保护miR-200c免受靶标指导的miRNA降解(TDMD)。本研究揭示了亚型特异性lncRNA调控网络的景观,为MSS/EMT GC提供了临床相关的生物学见解。
Fig3. MIR200CHG保护miR-200c免受TDMD的机制示意图
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38065939/
04
组蛋白乳酸化来源的LINC01127通过顺式调节MAP4K4以激活JNK通路,从而促进胶质母细胞瘤干细胞的自我更新
发表期刊:Cancer Lett
影响因子:9.7
发表时间:2023年12月8日
胶质瘤是最普遍和最具侵袭性的脑肿瘤,表现出高度增殖、糖酵解异常和预后不良。LncRNAs作为调节分子,在GBM细胞的恶性行为中起着至关重要的作用,包括细胞自我更新。然而,所涉及的调控机制在很大程度上是未知的。本研究进行了生物信息学分析以探索NF-κB通路相关的lncRNAs。采用ECAR和qRT-PCR检测糖酵解活性与lncRNA表达的关系。采用RIP-PCR和ChIP-PCR等方法揭示了lncRNA的调控机制。通过神经球形成和极限稀释试验来评估GBM细胞的自我更新能力。本研究在GBM中发现了一种名为LINC01127的NF-κB通路相关lncRNA,其与GBM的不良进展有关。功能上,NF-κB通路促进warburg效应,进而诱导H3组蛋白的乳酸化,增加LINC01127的表达。因此,LINC01127表达的增强导致了GBM细胞自我更新的促进。此外,LINC01127通过直接引导POLR2A到MAP4K4启动子区域来调节顺式MAP4K4的表达,从而导致JNK通路激活,并最终调节GBM细胞的自我更新。此外,激活的JNK通路促进了IκBα的磷酸化。总体而言,靶向LINC01127介导的轴阻碍了GBM异种移植物中原位肿瘤的生长。综上所述,这些结果揭示了warburg效应诱导的组蛋白乳酸化驱动NF-κB相关的LINC01127表达,从而通过MAP4K4/JNK/NF-κB轴促进GBM细胞的自我更新,并为LINC01127可能作为GBM患者一种新的治疗策略提供了大量证据。
Fig4. lncRNA LINC01127在GBM中的作用机制示意图
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38084701/
05
禁食通过lncRNA PRKCQ-AS1介导的IGF2BPs调节甲状腺乳头状癌的线粒体功能
发表期刊:Cell Death & Disease
影响因子:9.0
发表时间:2023年12月14日
反复出现的证据表明,禁食对包括甲状腺乳头状癌(PTC)在内的各种癌症具有广泛的抗肿瘤作用。然而,这种与PTC关系的潜在机制尚不清楚。本研究探索了禁食对PTC糖酵解和线粒体功能的影响。结果发现,禁食在体外和体内损害糖酵解并降低线粒体功能障碍,并且在抑制TPC细胞糖酵解和线粒体功能期间,体外禁食和体内禁食模拟饮食(FMD)显著增加lncRNA-蛋白激酶C θ反义RNA1(PRKCQ-AS1)的表达。此外,lncRNA PRKCQ-AS1在PTC组织和细胞中显著降低。此外,PRKCQ-AS1过表达增加PTC细胞糖酵解和线粒体功能;PRKCQ-AS1敲低具有相反的效果。进一步的机制分析发现,PRKCQ-AS1与 IGF2BP 发生物理相互作用并增强蛋白精氨酸甲基转移酶7(PRMT7)mRNA,这是调节PTC糖酵解和线粒体功能的关键参与者。因此,PRKCQ-AS1抑制肿瘤生长,同时通过IGF2BPs/PRMT7信号调节糖酵解和线粒体功能。这些结果表明,lncRNA PRKCQ-AS1是禁食的关键下游靶点,并参与PTC代谢重编程。此外,PRKCQ-AS1/IGF2BPs/PRMT7轴是PTC诊断和治疗的理想治疗靶点。
Fig5. PRKCQ-AS1通过IGF2BPs/PRMT7信号通路调控PTC细胞糖酵解和线粒体功能障碍
原文链接:
https://www.nature.com/articles/s41419-023-06348-0