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lncRNA新研究进展盘点(20220304)
人阅读 发布时间:2022-03-04 09:39
Micropeptide PACMP inhibition elicits synthetic lethal effects by decreasing CtIP and poly(ADP-ribosyl)ation
lncRNA编码的微肽PACMP抑制通过降低CtIP和聚(ADP-核糖基)化引起合成致死效应
发表期刊:Mol Cell
影响因子:17.970
发表时间:2022年2月17日
通过组合靶向DNA损伤应答(DDR)通路的合成致死性提供了令人兴奋的抗癌治疗益处。目前,长链非编码RNAs(lncRNAs)与肿瘤耐药性有关。然而,它们在DDR中的潜在意义很大程度上仍然未知。本研究报道了人类lncRNA CTD-2256P15.2编码一种称为PACMP (PAR扩增和CtIP维持微肽)的微肽,其具有维持CtIP丰度和促进聚(ADP-核糖基)化的双重功能。PACMP不仅通过抑制CtIP-KLHL15的结合来阻止CtIP泛素化,而且还直接结合DNA损伤诱导的多聚(ADP-核糖)链以增强PARP1依赖性多聚(ADP-核糖基)化。单独靶向PACMP通过引起CtIP和PARP抑制之间的合成致死相互作用来抑制肿瘤生长,并赋予对PARP/ATR/CDK4/6抑制剂、电离辐射、表柔比星和喜树碱的敏感性。本研究结果表明,lncRNA来源的微肽通过调节DDR来调节癌症进展和耐药性,其抑制可用于增强现有的抗癌治疗策略。
Fig1. lncRNA CTD-2256P15.2编码的PACMP在维持CtIP蛋白稳定性和促进DNA修复中的PARylation信号方面具有双重功能;lncRNA的缺失抑制了肿瘤生长并赋予对PARP/ATR/CDK4/6抑制剂和多种DNA损伤诱导剂的敏感性
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35219381/
Kastor and Polluks polypeptides encoded by a single gene locus cooperatively regulate VDAC and spermatogenesis
单基因位点(lncRNA Gm9999)编码的Kastor和Polluks多肽协同调控VDAC和精子发生
发表期刊:Nat Commun
影响因子:14.913
发表时间:2022年2月28日
尽管一些长链非编码RNAs(lncRNAs)最近被证明可以编码小的多肽,但睾丸中的这些lncRNAs在很大程度上仍未被表征。本研究对睾丸特异性lncRNAs进行了筛选,并鉴定了两个精子特异性多肽,Kastor和Polluks,它们均由单个小鼠基因位点(Gm9999)编码,此前被注释为编码lncRNA。Kastor和Polluks都被插入线粒体外膜,并直接与电压依赖性阴离子通道(VDAC)相互作用,尽管它们的氨基酸序列不同。雄性VDAC3缺陷小鼠由于精子中线粒体鞘异常导致精子活力降低而无法生育,并且Kastor和Polluks的缺陷也严重损害了雄性的生育能力,并与类似的异常线粒体鞘的形成有关。缺乏Kastor或Polluks的精子部分地再现了两者都缺乏的精子表型。因此,Kastor和Polluks在调节VDAC3中的协同作用可能对精子线粒体鞘形成和男性生育能力至关重要。
Fig2. Kastor和Polluks的缺失导致雄性生育能力受损
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35228556/
Oncogenic lncRNAs alter epigenetic memory at a fragile chromosomal site in human cancer cells
致癌lncRNAs改变人类癌细胞染色体脆性位点的表观遗传记忆
发表期刊:Sci Adv
影响因子:14.136
发表时间:2022年3月2日
染色体不稳定性是癌症进展的一个关键事件。组蛋白H3变体CENP-A在决定着丝粒身份、结构和功能方面发挥着重要作用,但其在几种类型的实体癌中先天过表达。在癌症背景中,过量的CENP-A通过侵入转录偶联的H3.3伴侣通路,异位沉积在染色体臂上,包括8q24/cMYC基因位点。许多癌症中lncRNAs的上调与患者预后不良和复发相关。本研究报道了8q24来源的致癌lncRNAs的转录通过H3.3伴侣介导的CENP-A相关复合物沉积,在改变8q24染色质景观中发挥了意想不到的作用。此外,携带特定8q24来源的lncRNA的转基因盒整合到naïve染色体基因位点中,以顺式作用的方式将CENP-A募集到新的位置。这些数据在基因位点特异性致癌lncRNAs、异常的局部染色质结构和人类癌细胞脆性位点产生新的表观遗传记忆之间提供了一种似是而非的机制联系。
Fig3. 致癌lncRNAs通过错误定位CENP-A赋予染色体脆性
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35235361/
The mechanosensitive lncRNA Neat1 promotes osteoblast function through paraspeckle-dependent Smurf1 mRNA retention
机械敏感性lncRNA Neat1通过paraspeckle依赖性Smurf1 mRNA保留促进成骨细胞功能
发表期刊:Bone Res
影响因子:13.567
发表时间:2022年2月24日
机械刺激在骨重塑中起着重要作用。运动引起的机械负荷会增强骨强度,而去应力负荷会导致骨质流失。越来越多的证据表明,长链非编码RNAs(lncRNAs)在不同的生物、生理和病理环境中发挥着关键作用。然而,lncRNAs在机械转导中的作用及其与骨形成的关系仍然不清楚。本研究筛选了成骨细胞中的机械传感lncRNAs,并鉴定了Neat1,这是在模拟微重力条件下减少最明显的lncRNA。值得注意的是,不仅Neat1的表达,而且Neat1形成的特定paraspeckle结构对不同的机械刺激都很敏感,这与成骨细胞功能密切相关。Paraspeckles在模拟微重力下表现出小的点状聚合物,在机械负荷下表现出拉长、扁长或更大的不规则结构。Neat1基因敲除小鼠表现出骨形成受到破坏,骨结构和强度受损,骨量减少。成骨细胞中Neat1的缺乏降低了成骨细胞对机械刺激的反应。在体内,Neat1敲除小鼠对机械负荷和后肢去负荷刺激的反应减弱了骨表型。从机制上讲,paraspeckles促进了E3泛素连接酶Smurf1 mRNA的核保留和其翻译的下调,从而抑制了泛素化介导的Smurf1靶标-成骨细胞主转录因子Runx2的降解。本研究表明了机械刺激下,Neat1在成骨细胞功能中发挥重要作用,这为lncRNA组装结构响应机械刺激的功能提供了范例,并为长期太空飞行或卧床诱导的骨质流失和与年龄有关的骨质疏松症提供了一种治疗策略。
Fig4. 机械刺激下含Neat1的paraspeckle调控成骨细胞的模型图
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35210394/
Long noncoding RNA LINC00930 promotes PFKFB3-mediated tumor glycolysis and cell proliferation in nasopharyngeal carcinoma
长链非编码RNA LINC00930促进PFKFB3介导的鼻咽癌肿瘤糖酵解和细胞增殖
发表期刊:J Exp Clin Cancer Res
影响因子:11.161
发表时间:2022年2月24日
背景:代谢重编程是癌症的一个标志。然而,长链非编码RNAs(lncRNAs)在癌症代谢,尤其是葡萄糖代谢中的作用在很大程度上仍然未知。
结果:本研究鉴定并在功能上表征了一种新的代谢相关lncRNA LINC00930,其在鼻咽癌(NPC)中被上调并与肿瘤发生、淋巴浸润、转移和不良预后相关。在功能上,LINC00930是在体外和体内多个NPC模型中增加糖酵解活性和细胞增殖所必需的。机制上,LINC00930作为支架将RBBP5和GCN5复合物募集到PFKFB3启动子,并增加PFKFB3启动子区域中的H3K4三甲基化和H3K9乙酰化水平,从而在表观遗传上反式激活PFKFB3,进而促进糖酵解通量和细胞周期进程。临床上,靶向LINC00930和PFKFB3联合放疗可诱导肿瘤消退。
结论:总的来说,LINC00930在NPC中具有机制、功能和临床致癌性。靶向LINC00930及其通路可能对NPC患者的治疗有重要意义。
Fig5. lncRNA LINC00930通过表观遗传上调PFKFB3促进肿瘤糖酵解和细胞增殖
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35209949/
lncRNA编码的微肽PACMP抑制通过降低CtIP和聚(ADP-核糖基)化引起合成致死效应
发表期刊:Mol Cell
影响因子:17.970
发表时间:2022年2月17日
通过组合靶向DNA损伤应答(DDR)通路的合成致死性提供了令人兴奋的抗癌治疗益处。目前,长链非编码RNAs(lncRNAs)与肿瘤耐药性有关。然而,它们在DDR中的潜在意义很大程度上仍然未知。本研究报道了人类lncRNA CTD-2256P15.2编码一种称为PACMP (PAR扩增和CtIP维持微肽)的微肽,其具有维持CtIP丰度和促进聚(ADP-核糖基)化的双重功能。PACMP不仅通过抑制CtIP-KLHL15的结合来阻止CtIP泛素化,而且还直接结合DNA损伤诱导的多聚(ADP-核糖)链以增强PARP1依赖性多聚(ADP-核糖基)化。单独靶向PACMP通过引起CtIP和PARP抑制之间的合成致死相互作用来抑制肿瘤生长,并赋予对PARP/ATR/CDK4/6抑制剂、电离辐射、表柔比星和喜树碱的敏感性。本研究结果表明,lncRNA来源的微肽通过调节DDR来调节癌症进展和耐药性,其抑制可用于增强现有的抗癌治疗策略。
Fig1. lncRNA CTD-2256P15.2编码的PACMP在维持CtIP蛋白稳定性和促进DNA修复中的PARylation信号方面具有双重功能;lncRNA的缺失抑制了肿瘤生长并赋予对PARP/ATR/CDK4/6抑制剂和多种DNA损伤诱导剂的敏感性
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35219381/
Kastor and Polluks polypeptides encoded by a single gene locus cooperatively regulate VDAC and spermatogenesis
单基因位点(lncRNA Gm9999)编码的Kastor和Polluks多肽协同调控VDAC和精子发生
发表期刊:Nat Commun
影响因子:14.913
发表时间:2022年2月28日
尽管一些长链非编码RNAs(lncRNAs)最近被证明可以编码小的多肽,但睾丸中的这些lncRNAs在很大程度上仍未被表征。本研究对睾丸特异性lncRNAs进行了筛选,并鉴定了两个精子特异性多肽,Kastor和Polluks,它们均由单个小鼠基因位点(Gm9999)编码,此前被注释为编码lncRNA。Kastor和Polluks都被插入线粒体外膜,并直接与电压依赖性阴离子通道(VDAC)相互作用,尽管它们的氨基酸序列不同。雄性VDAC3缺陷小鼠由于精子中线粒体鞘异常导致精子活力降低而无法生育,并且Kastor和Polluks的缺陷也严重损害了雄性的生育能力,并与类似的异常线粒体鞘的形成有关。缺乏Kastor或Polluks的精子部分地再现了两者都缺乏的精子表型。因此,Kastor和Polluks在调节VDAC3中的协同作用可能对精子线粒体鞘形成和男性生育能力至关重要。
Fig2. Kastor和Polluks的缺失导致雄性生育能力受损
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35228556/
Oncogenic lncRNAs alter epigenetic memory at a fragile chromosomal site in human cancer cells
致癌lncRNAs改变人类癌细胞染色体脆性位点的表观遗传记忆
发表期刊:Sci Adv
影响因子:14.136
发表时间:2022年3月2日
染色体不稳定性是癌症进展的一个关键事件。组蛋白H3变体CENP-A在决定着丝粒身份、结构和功能方面发挥着重要作用,但其在几种类型的实体癌中先天过表达。在癌症背景中,过量的CENP-A通过侵入转录偶联的H3.3伴侣通路,异位沉积在染色体臂上,包括8q24/cMYC基因位点。许多癌症中lncRNAs的上调与患者预后不良和复发相关。本研究报道了8q24来源的致癌lncRNAs的转录通过H3.3伴侣介导的CENP-A相关复合物沉积,在改变8q24染色质景观中发挥了意想不到的作用。此外,携带特定8q24来源的lncRNA的转基因盒整合到naïve染色体基因位点中,以顺式作用的方式将CENP-A募集到新的位置。这些数据在基因位点特异性致癌lncRNAs、异常的局部染色质结构和人类癌细胞脆性位点产生新的表观遗传记忆之间提供了一种似是而非的机制联系。
Fig3. 致癌lncRNAs通过错误定位CENP-A赋予染色体脆性
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35235361/
The mechanosensitive lncRNA Neat1 promotes osteoblast function through paraspeckle-dependent Smurf1 mRNA retention
机械敏感性lncRNA Neat1通过paraspeckle依赖性Smurf1 mRNA保留促进成骨细胞功能
发表期刊:Bone Res
影响因子:13.567
发表时间:2022年2月24日
机械刺激在骨重塑中起着重要作用。运动引起的机械负荷会增强骨强度,而去应力负荷会导致骨质流失。越来越多的证据表明,长链非编码RNAs(lncRNAs)在不同的生物、生理和病理环境中发挥着关键作用。然而,lncRNAs在机械转导中的作用及其与骨形成的关系仍然不清楚。本研究筛选了成骨细胞中的机械传感lncRNAs,并鉴定了Neat1,这是在模拟微重力条件下减少最明显的lncRNA。值得注意的是,不仅Neat1的表达,而且Neat1形成的特定paraspeckle结构对不同的机械刺激都很敏感,这与成骨细胞功能密切相关。Paraspeckles在模拟微重力下表现出小的点状聚合物,在机械负荷下表现出拉长、扁长或更大的不规则结构。Neat1基因敲除小鼠表现出骨形成受到破坏,骨结构和强度受损,骨量减少。成骨细胞中Neat1的缺乏降低了成骨细胞对机械刺激的反应。在体内,Neat1敲除小鼠对机械负荷和后肢去负荷刺激的反应减弱了骨表型。从机制上讲,paraspeckles促进了E3泛素连接酶Smurf1 mRNA的核保留和其翻译的下调,从而抑制了泛素化介导的Smurf1靶标-成骨细胞主转录因子Runx2的降解。本研究表明了机械刺激下,Neat1在成骨细胞功能中发挥重要作用,这为lncRNA组装结构响应机械刺激的功能提供了范例,并为长期太空飞行或卧床诱导的骨质流失和与年龄有关的骨质疏松症提供了一种治疗策略。
Fig4. 机械刺激下含Neat1的paraspeckle调控成骨细胞的模型图
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35210394/
Long noncoding RNA LINC00930 promotes PFKFB3-mediated tumor glycolysis and cell proliferation in nasopharyngeal carcinoma
长链非编码RNA LINC00930促进PFKFB3介导的鼻咽癌肿瘤糖酵解和细胞增殖
发表期刊:J Exp Clin Cancer Res
影响因子:11.161
发表时间:2022年2月24日
背景:代谢重编程是癌症的一个标志。然而,长链非编码RNAs(lncRNAs)在癌症代谢,尤其是葡萄糖代谢中的作用在很大程度上仍然未知。
结果:本研究鉴定并在功能上表征了一种新的代谢相关lncRNA LINC00930,其在鼻咽癌(NPC)中被上调并与肿瘤发生、淋巴浸润、转移和不良预后相关。在功能上,LINC00930是在体外和体内多个NPC模型中增加糖酵解活性和细胞增殖所必需的。机制上,LINC00930作为支架将RBBP5和GCN5复合物募集到PFKFB3启动子,并增加PFKFB3启动子区域中的H3K4三甲基化和H3K9乙酰化水平,从而在表观遗传上反式激活PFKFB3,进而促进糖酵解通量和细胞周期进程。临床上,靶向LINC00930和PFKFB3联合放疗可诱导肿瘤消退。
结论:总的来说,LINC00930在NPC中具有机制、功能和临床致癌性。靶向LINC00930及其通路可能对NPC患者的治疗有重要意义。
Fig5. lncRNA LINC00930通过表观遗传上调PFKFB3促进肿瘤糖酵解和细胞增殖
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35209949/