lncRNA是一种重要的非编码RNA，具有很多生物学功能，但lncRNA在神经细胞中的功能依然有很多研究空白。4月2日，Cell Stem Cell报道了美国加州大学关于lncRNA对神经干细胞分化过程调控功能的最新研究成果。

　　神经干细胞(Neural stem cells，NSCs)存在于胚胎期和新生哺乳动物脑部。在成年室管膜下层(adult ventricular-subventricular zone，V-SVZ)，产生过渡放大细胞(transit-amplifying cells，TAC)，这种细胞会产生成神经细胞(NB)，迁移到大脑嗅球处，再分化为中间神经元。

　　测序结果证明V-SVZ NPC中Pnky特异性表达

　　lncRNA FISH表明Pnky主要分布于细胞核内

　　使用EdU鉴定Pnky被沉默后细胞增殖状况
　　RNA-Seq检测Pnky和PTBP1分别被沉默时基因表达差异及剪切差异

　　研究者之前已鉴定出Pnky是一个成年V-SVZ特异表达的lncRNA，在V-SVZ区 NSC中，Pnky基因启动子区域富集H3K4me3组蛋白修饰，也与其转录激活状态一致，而qPCR和lncRNA FISH则确认Pnky是在V-SVZ NSC核内分布，且在V-SVZ分化为TAC及NB过程中，Pnky在胞内的浓度会不断下降，也表明Pnky会随着神经细胞定型而逐渐下调。

　　为了进一步了解Pnky在神经发生过程中的作用，研究者使用shRNA沉默V-SVZ NSC中的Pnky，EdU检测发现，V-SVZ NSC的增殖并未受到影响，但NSC分化产生的TAC和NB则明显增加，表明Pnky被敲除加速了V-SVZ NSC分化。

　　为了了解Pnly作用靶点及互作蛋白，研究者使用生物素标记的Pnky与V-SVZ NSC细胞核提取物共同孵育，进行RNA pull-down实验，鉴定出一个神经分化抑制因子PTBP1与Pnky特异互作。PTBP1调控神经分化过程中mRNA转录水平及pre-mRNA转 录后剪切，通过RNA-Seq发现，Pnky和PTBP1在V-SVZ中所控制的基因有很多一致，且大多与细胞黏附、突触发生和神经发生有关，且同时敲除 这两个基因并不会增加调控效应。这些数据最终证明，Pnky通过与PTBP1互作，调控一系列基因，进一步控制神经干细胞分化过程。

　　相关文献：Ramos A D, Andersen R E, Liu S J, et al. The Long Noncoding RNA Pnky Regulates Neuronal Differentiation of Embryonic and Postnatal Neural Stem Cells[J]. Cell stem cell, 2015, 16(4): 439-447.