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[深度解读]siRNA文库筛选成功发现经典通路调控因子
人阅读 发布时间:2015-01-09 11:21
细胞因子TGF-β调控多个生物学过程,包括免疫抑制、血管生成、愈伤及上皮间质转化(EMT)等。TGF-β信号失调与自身免疫失调和感染性 疾病、纤维化、肿瘤发生和转移以及其他疾病有关。TGF-β会与其I型受体(TGFBRI)结合,并进一步再结合TGFBRII,导致转录因子 SMAD2/SMAD3被激活。
本项研究中,研究者希望找到这条通路中TGFBRI和TGFBRII这两个TGF-β的潜在调控因子。他们将一个蛋白激酶组siRNA文库转染 到A549和MDA-231-1833乳腺癌细胞中,同时转染TGFBRI激酶活性报告载体(BTR4),该载体在TGFBRI激酶活性缺失时会发出荧 光。在TGF-β刺激下,有多个促TGF-β信号反馈基因被筛选出来,作为二轮筛选的候选基因。
A549和MDA-231-1833两种细胞中的siRNA文库筛选结果
信号通路模型 在TGF-β刺激下,TGFBRI与BUB1互作增强,形成TGFBRI-BUB1-TGFBRII复合体,造成SMAD2/SMAD3磷酸化,并进一步 产生SMAD2/SMAD3/SMAD4复合体,进一步影响细胞EMT、迁移及侵袭能力,BUB1同时也会依靠其自身Ser/Thr磷酸激酶功能对RAS /MAPK及PI通路进行磷酸化修饰,进一步产生下一级信号
进一步在多种细胞内进行二轮siRNA筛选,确认BUB1(budding uninhibited by benzimidazoles-1)这个Ser/Thr磷酸激酶是最后筛选结果,敲除BUB1能造成SMAD2/SMAD3不再被磷酸化,其他TGF-β 通路下游关键组分也被抑制。共免疫沉淀及荧光成像分析结果表明,BUB1被siRNA沉默后,TGF-β刺激时,未被磷酸化的SMAD2/3将不再结合到 TGFBRI上,也不再被定位到核仁内,SMAD2/3-SMAD4复合体也会受到影响。TGF-β信号另一个功能是促上皮间质转化 (epithelial-mesenchymal transition,EMT),而TGF-β被siRNA沉默也进抑制了EMT及TGF-β所诱导的细胞迁移与侵袭作用。
为了确认BUB1参与调控TGF-β的机制,研究者对BUB1的磷酸激酶活性功能进行了研究。在BUB1激酶抑制剂2OH-BNNP处理 下,SMAD2和SMAD3磷酸化也和siRNA处理一样受到抑制,SMAD2核定位及SMAD2/3-SMAD4复合体形成也受到影响。通过荧光成像与 共免疫沉淀分析,发现TGFBRI、TGFBRII和BUB1在TGF-β刺激下互作增强,并进一步增强TGFBRI-TGFBRII-BUB1复合 体,SMAD2/SMAD3磷酸化提高。
研究者在体外细胞实验中已完整地确认了TGF-β/TGFBRI-TGFBRII/BUB1/SMAD这条TGF-β信号通路,最后也在体内对 其所筛选出TGF-β调控因子BUB1进行了验证,结果表明,用BUB1激酶活性抑制剂处理从小鼠体内获取的A549异植瘤细胞时,SMAD2/3磷酸化 水平也有了明显提升,进一步证明所筛选结果是精确可靠的。
本项研究利用蛋白激酶组siRNA文库,成功筛选出了TGF-β信号通路里一个重要的调控因子,并对此调控因子的功能进行了系统研究,其结果对于癌症发生与预后差异研究具有重要意义。
相关文献:The kinase activity of the Ser/Thr kinase BUB1 promotes TGF-b signaling