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锐博生物总部位于广州市黄埔区广州开发区,是一家以核酸技术为核心,为基因功能、细胞生物学及药物研究提供产品与技术服务,以一体化核酸药 CDMO 服务为主导,致力于让新一代核酸药从概念走向商业化的国家火炬计划重点高新技术企业,是中国核酸行业的领军企业之一,拥有国家级博士后科研工作站。公司立足于基础生命科学与医学研究,创始人由国家重大人才工程入选者和诺贝尔生理/医学奖获得者领衔,以国际化视野和技术平台实力,提供高品质的寡核酸 Oligo 合成修饰、CRISPR-Cas9、RNAi、非编码 RNA、细胞分析、外泌体提取、DNA 提取、PCR 扩增、qRT-PCR 试剂盒及引物等,提供高内涵细胞成像及筛选、载体构建、动物实验、高通量测序、生信分析、RNA 体外转录、外泌体检测、qPCR 检测等技术服务,提供闻名业界的核酸药 GMP 生产 CDMO 服务。通过跨学科、多平台、上下游贯通的综合技术优势,赢得了国内外客户的信赖和赞誉。公司申请专利71项,其中已授权专利 21 项。“锐博生物RiboBio”是中国高品质核酸产品代名词之一,为国内外超过 5000 家机构提供产品或服务,客户 SCI 文章累计超过 25,000 多篇,合作客户包括诺贝尔奖得主实验室、知名科研机构和全球制药公司,锐博生物是亚洲知名的寡核酸原料药生产企业之一,2016年获得中国药监局颁发的寡核酸原料药生产许可证,现已跻身于全球核酸药 CDMO 的知名企业行列。锐博生物建立了与国际接轨的大规模cGMP生产基地,正在打造国际领先的大规模寡核酸 CMO 基地。锐博生物推动国内外核酸科学与技术的交流与合作,连续多年承办代表行业风向标的中国核酸国际论坛(CNAF)和非编码RNA与表观遗传学研究交流会,获批建立国家级博士后科研工作站,承担多项国家及省市重点科研项目。锐博生物致力于提供国际一流的核酸产品与服务,构建国际一流的合作平台与伙伴关系,培养国际一流的智慧型创新人才,为不断满足未来生命科学与医学研究及转化的需求而贡献力量。公司秉承“以创新求发展,以品质铸未来,以诚信待客户”的发展理念,追求“创新永不停”!
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打破常规 “非编码RNA”也会翻译蛋白

人阅读 发布时间:2014-07-14 11:54

  通常,人们按照RNA分子翻译蛋白的能力将其划分为信使RNA(message RNA, mRNA)及非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA),mRNA作为模板,被核糖体直接翻译为对应的蛋白质,而ncRNA由于缺少翻译蛋白能力,最初并没有受到重视,直到近些年来,包括miRNA、piRNA及lncRNA等ncRNA被发现在很多生物过程及疾病发生中发挥了很大作用,但很多ncRNA都是通过直接靶向作用于一些蛋白编码基因而起到调控作用,例如miRNA在mRNA的3’UTR区域识别种子序列并结合、piRNA通过乒乓机制与Piwi蛋白形成复合体,影响转座子转录等。

  看起来ncRNA不会通过编码蛋白来实现自我价值,但无数事实已经证明,科学是没有不可能的。随着技术的发展,近年来慢慢有学者发现了ncRNA表达蛋白质的潜力。2005年,数位日本学者在果蝇中鉴定出了多个与mRNA具有一定相似性的ncRNA,且有许多短肽序列可以与这些ncRNA序列相对应,但是用这类RNA分子所预测的蛋白质序列在其他相近物种中并不保守,所以当时研究者认为它们依然只是以非编码RNA分子的身份发挥功能;今年二月,美国哈佛大学研究者在Science发表论文,报道了他们对胚胎形成的最新研究结果,他们发现,在斑马鱼胚胎形成早期,一种由lncRNA生成的Toddler短肽发挥了G蛋白偶联受体激活因子的作用,促进原肠胚形成,可能是一个未发现过的发育信号因子;两个月后,来自美国耶鲁大学医学院的研究者又在EMBO Journal发表了其最新研究成果,他们从人类及斑马鱼的一些lncRNA中鉴别到了数百个小的开放阅读框(small open reading frame,sORF),这些物种中,被普遍认为没有编码蛋白能力的lncRNA,实际上是具有蛋白产生所必须的结构,通过生物信息学分析比对,发现这些sORF同一些进化保守的短肽相对应;今年六月,美国凯斯西储大学的研究者,利用与耶鲁大学研究者类似的方法,也在酵母细胞中鉴别到了ncRNA中的sORF结构,并发现含有sORF的ncRNA会对无义介导的RNA衰减(nonsense-mediated RNA decay, NMD)敏感,由于一般只有编码蛋白的RNA才会对NMD敏感,所以研究者进一步认为,酵母中一些ncRNA确实具有翻译蛋白的能力。

  上述几篇论文中,研究者一般是通过构建多聚核糖体图谱来鉴别sORF。通常情况下,核糖体在mRNA翻译成蛋白质的过程中,结合到mRNA的开放阅读框内(open reading frame),沿着mRNA通读ORF中的碱基排列,再按照三联体密码子排布,把对应的氨基酸连接成为多肽。多聚核糖体图谱即通过核酸酶剪切,把没有被核糖体所结合的部分剪切掉,利用高通量测序,获得核糖体所结合的RNA序列信息,再通过多种生物信息学分析手段,即可绘制出一个由核糖体所结合RNA部分组成的图谱。不过,尽管很多ncRNA含有sORF,可以与核糖体结合,但他们依然同真正的mRNA有很明显的区别,这也是ncRNA与mRNA功能异质性的原因。目前,ncRNA的蛋白翻译潜能具体在生物系统中发挥哪些作用还有很多不为人所知,哈佛大学研究者关于斑马鱼胚胎中Toddler短肽的研究也可能只是冰山一角,而随着高通量测序与数据挖掘技术的不断进步,对于ncRNA编码蛋白能力的研究或许会成为一个新的研究领域,发现更多ncRNA未知功能。

  
多聚核糖体图谱建立示意图

  酵母细胞中部分核糖体结合片段测序后与uRNA(YKU80-YMR107W intergenic RNA) 序列比对示意图

  相关文献:

  Inagaki S, Numata K, Kondo T, et al. Identification and expression analysis of putative mRNA‐like non‐coding RNA in Drosophila[J]. Genes to Cells, 2005, 10(12): 1163-1173.

  Bazzini A A, Johnstone T G, Christiano R, et al. Identification of small ORFs in vertebrates using ribosome footprinting and evolutionary conservation[J]. The EMBO journal, 2014, 33(9): 981-993.

  Pauli A, Norris M L, Valen E, et al. Toddler: an embryonic signal that promotes cell movement via apelin receptors[J]. Science, 2014, 343(6172): 1248636.

  Jenna E S, Juan R D, Nicholas K, et al. Translation of Small Open Reading Frames within Unannotated RNA Transcripts in Saccharomyces cerevisiae[J]. Cell Reports, 2014, 7(6): 1858–1866.

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